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北部湾柱状角孔珊瑚水螅体次级代谢产物研究
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作者 冯广福 何洁怡 +4 位作者 白猛 易湘茜 刘昕明 罗连响 高程海 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期135-139,共5页
为了研究柱状角孔珊瑚(Goniopora columna)水螅体的次级代谢产物,采用硅胶柱层析、凝胶柱层析及半制备高效液相色谱对柱状角孔珊瑚水螅体粗提物中次级代谢产物进行分离纯化,利用现代波谱技术鉴定其结构,并对获得的次级代谢产物进行非小... 为了研究柱状角孔珊瑚(Goniopora columna)水螅体的次级代谢产物,采用硅胶柱层析、凝胶柱层析及半制备高效液相色谱对柱状角孔珊瑚水螅体粗提物中次级代谢产物进行分离纯化,利用现代波谱技术鉴定其结构,并对获得的次级代谢产物进行非小细胞肺癌A549细胞(non-small cell lung cancer A549 cells, NSCLC)的抗癌活性筛选。结果表明,从柱状角孔珊瑚水螅体中分离鉴定出8种化合物,分别为alkalgoniopora A (1)、茶碱(2)、胸腺嘧啶脱氧核糖核苷(3)、尿嘧啶(4)、胸腺嘧啶(5)、pregna-5,20-dien-3β-ol(6)、cinnamicacid(7)和原儿茶酸(8),其中化合物1为新发现的生物碱。初步细胞毒活性测试显示,化合物1、2和6对NSCLC增殖有较弱的抑制活性,其余化合物对NSCLC增殖无明显抑制活性。 展开更多
关键词 柱状角孔珊瑚 水螅体 次级代谢产物 非小细胞肺癌A549细胞
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番茄红素生物学活性研究进展 被引量:11
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作者 罗连响 李晓玲 鲍波 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2013年第16期388-391,共4页
番茄红素作为番茄等红色水果中自然存在的活性物质,是膳食中最重要的抗氧化营养素之一,由于其具有良好的色泽和多个共轭的碳碳双键结构,已引起植物、农业和营养学界的广泛关注。研究表明番茄红素在抗氧化、抗癌症、预防心血管疾病和神... 番茄红素作为番茄等红色水果中自然存在的活性物质,是膳食中最重要的抗氧化营养素之一,由于其具有良好的色泽和多个共轭的碳碳双键结构,已引起植物、农业和营养学界的广泛关注。研究表明番茄红素在抗氧化、抗癌症、预防心血管疾病和神经退行性疾病等方面都有明显的作用,是国际上功能性食品成分研究中的一个热点。本文将对其生物学活性作进一步的综述。 展开更多
关键词 番茄红素 生物学 活性
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番茄红素对鱼藤酮损伤PC12细胞的保护作用研究 被引量:2
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作者 罗连响 李晓玲 +3 位作者 朱少平 黎柔君 朱丽飞 鲍波 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期328-331,336,共5页
目的:探讨番茄红素(Lycopene)对鱼藤酮诱导的PC12细胞损伤的保护作用及其可能机制。方法:采用鱼藤酮诱导PC12细胞损伤模型,给予番茄红素预处理后,CCK-8法检测细胞存活率;倒置显微镜观察细胞形态,测定细胞培养液上清乳酸脱氢酶(LDH)释放... 目的:探讨番茄红素(Lycopene)对鱼藤酮诱导的PC12细胞损伤的保护作用及其可能机制。方法:采用鱼藤酮诱导PC12细胞损伤模型,给予番茄红素预处理后,CCK-8法检测细胞存活率;倒置显微镜观察细胞形态,测定细胞培养液上清乳酸脱氢酶(LDH)释放量;碘化丙啶(PI)染色流式细胞术检测细胞周期变化;比色法测定细胞内谷胱甘肽(GSH)含量、超氧化物歧化酶(SOD)活性、丙二醛(MDA)含量、总抗氧化能力(T-AOC);DCFH-DA染色检测细胞内活性氧类物质(ROS)水平。结果:番茄红素能明显提高鱼藤酮损伤PC12细胞存活率(p<0.05),恢复细胞增殖;明显减轻了细胞损伤的形态的改变,降低LDH的释放、MDA和ROS含量(p<0.05),提高PC12细胞内SOD活性、GSH含量、T-AOC能力(p<0.05)。结论:番茄红素拮抗鱼藤酮致PC12细胞的损伤,其机制可能与抗氧化,清除细胞内ROS,诱导抗氧化酶的活性有关。 展开更多
关键词 番茄红素 鱼藤酮 PC12细胞 抗氧化
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番茄红素在鱼藤酮诱导的PC12细胞凋亡中的作用 被引量:1
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作者 罗连响 李晓玲 鲍波 《中风与神经疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期884-886,共3页
目的探讨番茄红素对鱼藤酮诱导的PC12细胞凋亡的作用及可能机制。方法采用鱼藤酮诱导PC12细胞为损伤模型,在番茄红素预处理后,以CCK-8法检测细胞存活率,Hoechst33258染色荧光显微镜观察细胞凋亡形态学改变,流式细胞术检测细胞凋亡率,罗... 目的探讨番茄红素对鱼藤酮诱导的PC12细胞凋亡的作用及可能机制。方法采用鱼藤酮诱导PC12细胞为损伤模型,在番茄红素预处理后,以CCK-8法检测细胞存活率,Hoechst33258染色荧光显微镜观察细胞凋亡形态学改变,流式细胞术检测细胞凋亡率,罗丹明123染色检测细胞线粒体膜电位,比较各组的差异。结果与鱼藤酮组相比,番茄红素预处理后,细胞存活率明显提高(P<0.05),细胞形态明显改善,凋亡率降低(P<0.05),线粒体膜电位上升(P<0.05)。结论番茄红素对鱼藤酮诱导的PC12细胞凋亡具有抑制作用,其机制可能与其稳定线粒体膜电位有关。 展开更多
关键词 番茄红素 鱼藤酮 PC12 细胞凋亡
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番茄红素和神经疾病的研究进展
5
作者 罗连响 李晓玲 +1 位作者 胡利 鲍波 《中风与神经疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期760-761,共2页
番茄红素(Lycopene),又名茄红素,是自然界已知的600多种类胡萝卜素(Carotenoid)的一种,它能使成熟的番茄呈现深红色。番茄红素存在于红色蔬菜与水果中,如番茄、胡萝卜、西瓜、红色葡萄柚、草莓番茄、西瓜、葡萄、杏、番木瓜、番石... 番茄红素(Lycopene),又名茄红素,是自然界已知的600多种类胡萝卜素(Carotenoid)的一种,它能使成熟的番茄呈现深红色。番茄红素存在于红色蔬菜与水果中,如番茄、胡萝卜、西瓜、红色葡萄柚、草莓番茄、西瓜、葡萄、杏、番木瓜、番石榴等红色果实等,以番茄中的含量最高。其分子式为C40H56,分子量为536.85,纯品为针状深红色晶体。 展开更多
关键词 番茄红素 神经疾病 类胡萝卜素 葡萄柚 自然界 番木瓜 番石榴 分子式
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天然产物抗细菌的群体感应系统的研究进展 被引量:1
6
作者 李晓玲 王玥莹 +2 位作者 罗连响 赵祖国 李国明 《广东医学院学报》 2013年第5期593-596,共4页
细菌群体感应系统参与许多致病菌或条件致病菌的毒素及侵袭性酶类的合成和分泌、生物膜的形成以及抗生素抗性的产生等多种生物过程,与细菌对人和动植物感染密切相关。干扰细菌群体感应系统的物质可以降低细菌致病性,在近年成为新型抗菌... 细菌群体感应系统参与许多致病菌或条件致病菌的毒素及侵袭性酶类的合成和分泌、生物膜的形成以及抗生素抗性的产生等多种生物过程,与细菌对人和动植物感染密切相关。干扰细菌群体感应系统的物质可以降低细菌致病性,在近年成为新型抗菌药物研究的热点。一些从植物分离获得的活性成分可以干扰细菌的群体感应系统,具有实际的和潜在的抗感染作用。该文综述了细菌群体感应系统及植物活性成分干扰细菌群体感应系统的研究进展。 展开更多
关键词 群体感应 细菌 植物 抗感染 综述文献
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葫芦素B通过靶向STAT3促进铁死亡抑制非小细胞肺癌的生长 被引量:2
7
作者 曾泽瑶 苏佳婷 罗连响 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第S01期28-28,共1页
目的葫芦素B(CuB)是一种具有特殊苦味和细胞毒性的四环三萜分子,具有广泛的生物活性。本研究探索CuB在非小细胞肺癌(NSCLC)中诱导铁死亡的可能。方法数据库综合分析结果揭示CuB介导的NSCLC铁死亡的潜在可能。通过蛋白-蛋白相互作用(PPI... 目的葫芦素B(CuB)是一种具有特殊苦味和细胞毒性的四环三萜分子,具有广泛的生物活性。本研究探索CuB在非小细胞肺癌(NSCLC)中诱导铁死亡的可能。方法数据库综合分析结果揭示CuB介导的NSCLC铁死亡的潜在可能。通过蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络预测CuB诱导NSCLC的枢纽靶点。利用分子对接、分子动力学检测CuB与枢纽靶点的结合效应。最后,通过体外实验包括脂质过氧化、活性氧、亚铁离子水平、线粒体膜电位测定和药物毒性分析、蛋白印迹、免疫荧光、热迁移等技术探究CuB诱导NSCLC铁死亡的潜在机制。结果网络药理学分析显示,CuB在NSCLC中介导26个铁死亡基因的改变,预测STAT3是其中最重要的靶点之一。使用KRAS-G12C突变的H358细胞进行体外实验验证。结果表明,CuB通过靶向STAT3诱导H358细胞铁死亡。结论本研究首次阐明了CuB在NSCLC中诱导铁死亡的潜力。CuB通过靶向STAT3诱导H358细胞铁死亡,为从天然产物中提取有效成分开发新的靶向铁死亡的肺癌治疗药物提供新的线索。 展开更多
关键词 葫芦素B 非小细胞肺癌 铁死亡 STAT3 网络药理学
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铁死亡调控机制及其在肺癌治疗中的潜在价值 被引量:1
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作者 黄裕锋 向静 +4 位作者 陈春源 邓彪 王薛枫 罗连响 梁柱 《广东医科大学学报》 2023年第4期444-455,共12页
铁死亡是一种铁依赖性程序性细胞死亡方式,具体调控机制仍未明了。研究发现肺癌与铁死亡密切相关,铁死亡诱导剂促进肺癌细胞死亡。该文阐述了铁死亡调控机制及其在肺癌中作用,分析了铁死亡在肺癌治疗中潜在价值。
关键词 铁死亡 肺癌 免疫治疗
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花青素对阿尔兹海默病关键药理途径的生物信息学分析及实验验证 被引量:9
9
作者 罗连响 黄芳芳 +4 位作者 吴锐剑 林浩雯 王渠 李晓玲 黄宇戈 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第18期2217-2224,共8页
目的:采用网络药理学和分子对接技术研究花青素治疗阿尔兹海默病(AD)的潜在机制,并通过实验对预测关键靶点进行验证。方法:在药物靶点预测平台Swiss Target Prediction、Chembl数据库和CTD数据库上预测花青素的靶点,借助OMIM数据库和Gen... 目的:采用网络药理学和分子对接技术研究花青素治疗阿尔兹海默病(AD)的潜在机制,并通过实验对预测关键靶点进行验证。方法:在药物靶点预测平台Swiss Target Prediction、Chembl数据库和CTD数据库上预测花青素的靶点,借助OMIM数据库和GeneCards数据库检索AD的靶点;将化合物靶点与疾病靶点作交集得到花青素作用于AD的潜在靶点。使用STRING平台构建蛋白相互作用(PPI)网络,并通过网络拓扑分析筛选核心靶点。在Metascape平台中对交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。最后进行分子对接及实验验证,进一步明确花青素作用于AD的核心靶点。结果:花青素与AD的靶点取交集后获得71个共同靶点,PPI网络拓扑分析发现血管内皮生长因子A(VEGFA),IL-6,原癌基因酪氨酸蛋白激酶src(SRC),肿瘤坏死因子(TNF),信号转导和转录激活因子3(STAT3),人前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2),丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶AKT(AKT1)等是花青素治疗AD的关键靶点。同时,分子对接及实验结果显示花青素与靶点PTGS2具有较好的亲和力,并且花青素可降低LPS诱导的BV2细胞中PTGS2蛋白的表达。KEGG通路富集分析结果显示,花青素治疗AD的通路涉及PI3K/AKT信号通路、Rap1信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路等。结论:花青素可能通过调控PI3K/AKT、Rap1、Ras、MAPK等多条信号通路,发挥减轻神经炎症反应、抑制细胞凋亡和氧化应激以及调节tau蛋白等多种作用,从而对AD起治疗作用。 展开更多
关键词 花青素 阿尔兹海默病 网络药理学 分子对接 人前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2) PI3K/AKT信号通路
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基于生物信息学分析胃癌铁死亡相关基因预后及免疫细胞浸润的临床和功能意义 被引量:4
10
作者 罗连响 陈心铭 +1 位作者 郑羽诗 罗辉 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1237-1244,共8页
目的:采用生物信息学方法寻找胃癌(GC)中有预后价值的差异表达基因(DEGs)和免疫细胞浸润矩阵,并探讨其临床和功能意义。方法:建立基于TCGA GC数据集的10个铁死亡相关基因风险模型,并采用GEO数据集验证其预后预测准确性。利用R软件cluste... 目的:采用生物信息学方法寻找胃癌(GC)中有预后价值的差异表达基因(DEGs)和免疫细胞浸润矩阵,并探讨其临床和功能意义。方法:建立基于TCGA GC数据集的10个铁死亡相关基因风险模型,并采用GEO数据集验证其预后预测准确性。利用R软件clusterProfiler包进行功能富集分析。单样本基因集富集分析(ssGSEA)量化16个免疫细胞的浸润水平和13个免疫相关通路活性。结果:根据10基因模型得出的中位风险评分将患者分为高风险组和低风险组。生存分析表明,高风险组和低风险组GC患者总生存率(OS)差异有统计学意义。铁死亡相关风险评分与是GC患者OS的独立预测因子。功能富集分析显示,风险模型与PI3K-Akt信号通路相关。ssGSEA和免疫评分相关性分析指出了高风险组中上调的免疫细胞和免疫相关途径,开发了一个列线图帮助临床医生更好地决策。结论:基于10个铁死亡相关基因的风险模型显示出较好的预后预测性能,为GC提供了一种有希望的治疗策略。 展开更多
关键词 胃癌 铁死亡 预后 生物信息学 列线图 免疫评分
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杨梅素通过诱导巨噬细胞自噬抑制NLRP3炎症小体激活 被引量:4
11
作者 罗连响 黄芳芳 +1 位作者 吴锐剑 黄宇戈 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第15期1809-1813,1819,共6页
目的:探讨杨梅素对尼日利亚菌素(Nigericin)诱导的巨噬细胞中Nod样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体激活的影响。方法:将iBMDM细胞或THP-1细胞分为空白对照组、LPS组、LPS+Nigericin组和杨梅素治疗组(5μmo/l L、10μmo/l L、20μmo/l L),LPS+N... 目的:探讨杨梅素对尼日利亚菌素(Nigericin)诱导的巨噬细胞中Nod样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体激活的影响。方法:将iBMDM细胞或THP-1细胞分为空白对照组、LPS组、LPS+Nigericin组和杨梅素治疗组(5μmo/l L、10μmo/l L、20μmo/l L),LPS+Nigericin组和杨梅素治疗组使用Nigericin激活NLRP3炎症小体,杨梅素治疗组加Nigericin前给予杨梅素预处理。Western blot检测细胞上清液中IL-1β(p17)以及细胞裂解液中NLRP3、pro-IL-1β、pro-caspase-1、AMPK、P-AMPK、mTOR、P-mTOR、P62、Beclin-1和LC3的表达情况。免疫荧光法检测细胞内ASC斑点形成情况。流式细胞术检测细胞内ROS和线粒体ROS的表达变化。结果:杨梅素治疗组上清液中IL-1β(p17)的表达水平较LPS+Nigericin组降低,细胞裂解液中LC3Ⅱ/LC3Ⅰ、P62和Beclin-1的表达水平较LPS+Nigericin组升高,而NLRP3、pro-IL-1β、pro-caspase-1、AMPK、P-AMPK、mTOR、P-mTOR的表达与LPS+Nigericin组差异无统计学意义。此外,LPS+Nigericin组细胞内ASC斑点形成以及细胞内ROS和线粒体ROS的产生均较杨梅素治疗组增加。结论:杨梅素可通过抑制炎症小体的组装以及线粒体ROS的产生,并通过提高细胞自噬活动抑制NLRP3炎症小体激活。 展开更多
关键词 杨梅素 NLRP3炎症小体 白细胞介素-1Β 活性氧 自噬
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代谢组学在儿童哮喘中的应用进展 被引量:3
12
作者 吴锐剑 黄宇戈 罗连响 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2022年第8期1014-1020,1026,共8页
支气管哮喘是儿童最常见的慢性疾病,其漏诊率高,发病机制复杂。代谢组学通过定性定量分析生物样品的低分子量分子或代谢产物的变化,为寻找生物标志物和发病机制提供了一种新途径。本文综述了代谢组学技术运用于儿童哮喘的研究,运用靶向... 支气管哮喘是儿童最常见的慢性疾病,其漏诊率高,发病机制复杂。代谢组学通过定性定量分析生物样品的低分子量分子或代谢产物的变化,为寻找生物标志物和发病机制提供了一种新途径。本文综述了代谢组学技术运用于儿童哮喘的研究,运用靶向或非靶向研究策略,以哮喘儿童及健康儿童的血液、呼出气、粪便及尿液为研究对象,试图寻找儿童哮喘的潜在生物标志物及发病机制,为儿童哮喘的诊断及治疗提供帮助。近年来代谢组学在儿童哮喘方面取得了不小的进展,但受限于个体差异、样品采集、数据分析及组学异质性等因素,代谢组学在儿童哮喘的解释方面仍面临挑战。 展开更多
关键词 哮喘 代谢组学 儿童 综述
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组织透明化技术在神经退行性疾病中的应用研究进展 被引量:2
13
作者 陈小玉 罗连响 +1 位作者 潘韵琪 鲍波 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期305-313,共9页
组织透明化技术是一种快速发展的新兴组织学技术,将大块组织、单个器官、啮齿动物全身以及人类大型标本,通过一系列物理化学原理与方法进行处理,在保持其完整性的同时快速实现高度光学透明,为高通量地获取生物组织三维结构信息提供了重... 组织透明化技术是一种快速发展的新兴组织学技术,将大块组织、单个器官、啮齿动物全身以及人类大型标本,通过一系列物理化学原理与方法进行处理,在保持其完整性的同时快速实现高度光学透明,为高通量地获取生物组织三维结构信息提供了重要的工具。结合现代光学成像技术和荧光标记技术,可显著提高成像深度和图像对比度,已成为经典组织学技术有前景的替代方案,并广泛应用于多个生命科学领域。本文对主要的脑组织透明化方法学原理及其优缺点、组织透明化技术在神经退行性疾病中的应用等进行综述,从整体水平观察神经元、轴突、髓鞘等精细结构的退行性改变以及异质性病理成分在全脑范围内细胞间的演变过程,为最终转向人类脑组织神经退行性病变研究提供可能。 展开更多
关键词 组织透明技术 透明脑 三维成像 神经退行性疾病
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基于网络药理学预测紫苏子-杏仁药对治疗支气管哮喘的作用机制 被引量:9
14
作者 黄芳芳 吴锐剑 +5 位作者 李晓玲 林浩雯 邱琴 林柏忻 黄宇戈 罗连响 《广东医科大学学报》 2021年第5期550-557,共8页
目的基于网络药理学探讨紫苏子-杏仁药对治疗支气管哮喘的作用机制。方法基于中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)收集紫苏子-杏仁药对的有效活性成分及其靶点信息。通过Genecards数据库获取哮喘相关基因,并与经STRING数据库转换的... 目的基于网络药理学探讨紫苏子-杏仁药对治疗支气管哮喘的作用机制。方法基于中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)收集紫苏子-杏仁药对的有效活性成分及其靶点信息。通过Genecards数据库获取哮喘相关基因,并与经STRING数据库转换的紫苏子-杏仁药对的靶基因进行匹配,得到紫苏子-杏仁药对治疗哮喘的候选作用靶点。利用STRING数据库和Cytoscape软件构建药物-有效活性成分-作用靶点网络和蛋白互作网络图,并利用DAVID数据库对预测靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果筛选得到紫苏子中有效活性成分14个、杏仁中有效活性成分15个,关键有效活性成分包括雌酮、木犀草素、β-谷固醇等。去重后得到两者共有靶点179个,关键靶点包括TP53、AKT1、JUN、CDKN1A、VEGFA等。GO富集分析结果包括GO-BP(生物过程)、GO-MF(分子功能)和GO-CC(细胞组分)分析。KEGG通路富集分析得到7条与哮喘显著相关通路。结论紫苏子-杏仁药对主要通过PI3K-Akt、TNF、P53等信号通路发挥治疗哮喘作用。 展开更多
关键词 紫苏子 杏仁 网络药理学 支气管哮喘
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番茄红素对鱼藤酮所致PC12细胞线粒体损伤的影响 被引量:3
15
作者 罗连响 李晓玲 +2 位作者 朱少平 曾敏娟 鲍波 《中国实验方剂学杂志》 CAS 北大核心 2013年第20期181-185,共5页
目的:研究番茄红素对鱼藤酮诱导PC12细胞线粒体损伤的保护作用。方法:采用鱼藤酮(0.5μmol·L-1)诱导PC12细胞损伤模型,给予番茄红素(3,10,30μmol·L-1)预处理2 h后,加入鱼藤酮,使终浓度达到0.5μmol·L-1,培养24 h后,CCK-... 目的:研究番茄红素对鱼藤酮诱导PC12细胞线粒体损伤的保护作用。方法:采用鱼藤酮(0.5μmol·L-1)诱导PC12细胞损伤模型,给予番茄红素(3,10,30μmol·L-1)预处理2 h后,加入鱼藤酮,使终浓度达到0.5μmol·L-1,培养24 h后,CCK-8法检测细胞存活率,倒置相差显微镜观察细胞形态改变、透射电镜观察细胞线粒体超微结构,罗丹明123染色检测线粒体膜电位,以观察番茄红素的保护作用。结果:CCK-8结果显示与正常对照组比较,模型组细胞存活率下降为70.34%±2.81%(P<0.05),与模型组比较,番茄红素(3,10,30μmol·L-1)预处理后其细胞存活率分别提高到83.09%±3.15%,87.24%±2.15%,89.17%±2.26%(P<0.05);倒置相差显微镜观察显示鱼藤酮可导致PC12细胞凋亡,经番茄红素处理后,模型细胞凋亡情况明显改善;透射电镜观察显示鱼藤酮可导致PC12细胞线粒体超微结构发生改变,经番茄红素处理后,模型细胞凋亡情况明显改善;流式细胞仪检测结果显示与正常对照组比较,模型组细胞线粒体膜电位平均荧光强度下降为151.63±12.25(P<0.05),经番茄红素(3,10,30μmol·L-1)预处理后线粒体膜电位平均荧光强度分别提高到202.24±26.28,226.21±9.71,238.83±10.29(P<0.05)。结论:番茄红素对鱼藤酮诱导的PC12细胞线粒体损伤有保护作用。 展开更多
关键词 帕金森病 番茄红素 PC12细胞 鱼藤酮 线粒体
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以c-MET为抗癌靶点的海洋小分子虚拟筛选
16
作者 罗连响 郑晓祺 +1 位作者 王渠 罗辉 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2022年第3期57-63,共7页
目的 运用计算机虚拟筛选技术和分子动力学模拟寻找海洋小分子库中抗癌靶点c-MET的小分子抑制剂。方法 利用schrodinger中Ligand Docking模块对海藻代谢物数据库(s WMD)和PDB网站检索的c-MET蛋白(PDB:2RFs)进行基于受体的分子对接筛选,... 目的 运用计算机虚拟筛选技术和分子动力学模拟寻找海洋小分子库中抗癌靶点c-MET的小分子抑制剂。方法 利用schrodinger中Ligand Docking模块对海藻代谢物数据库(s WMD)和PDB网站检索的c-MET蛋白(PDB:2RFs)进行基于受体的分子对接筛选,采用对接得分前十的结果,利用swiss ADME网站进行成药性分析(ADME)。最后将最好的结果用Gromacs进行分子动力学模拟。结果 分子对接结果显示打分前十的化合物都能与蛋白有较好的结合效果和对接姿势,蛋白与化合物之间的相互作用主要以氢键作用为主。分子动力学结果显示配体能在受体的结合口袋中稳定存在,同时具备较为稳定的对接构象。结论 基于分子对接技术和分子动力学虚拟筛选潜在的抗癌靶点c-MET的小分子抑制剂,为研发抗癌海洋药物提供科学指导与理论依据。 展开更多
关键词 C-MET 分子对接 分子动力学 海洋小分子 ADME筛选
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基于计算机虚拟筛选发现具有抑制Gpx4活性的海洋化合物
17
作者 罗连响 廖颖琳 +1 位作者 王渠 罗辉 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2022年第5期1-12,共12页
目的 借助计算机模拟方法发现具有Gpx4酶抑制活性的海洋化合物。方法 使用Libdock软件对现有Gpx4结构进行了虚拟筛选,对于Libdock得分最好的前100个海洋化合物,进一步根据利平斯基五规则(lipinski’s Rule of Five)中的相对分子质量限... 目的 借助计算机模拟方法发现具有Gpx4酶抑制活性的海洋化合物。方法 使用Libdock软件对现有Gpx4结构进行了虚拟筛选,对于Libdock得分最好的前100个海洋化合物,进一步根据利平斯基五规则(lipinski’s Rule of Five)中的相对分子质量限制条件进行筛选,得到了6个符合条件的海洋分子。然后借助CovDock功能对得分最佳的2个活性海洋分子进行了与蛋白的共价对接,并对这2个配体进行基于复合物药效团的药效特征分析以验证化合物与受体结合所需的关键性质。最后预测了全部6个海洋化合物的吸收、分布、代谢、排泄和毒性(ADMET)特性,以确定其成药特性。结果 海洋库中的2个分子被预测为具有最佳类药性质,因此被选作后续研究对象。对这2个化合物与Gpx4形成复合物的分子动力学计算表明,它们与靶标的结合效果稳定。结论筛选出的2种海洋化合物可能是有效的Gpx4抑制剂,为肿瘤的治疗提供新的候选化合物。 展开更多
关键词 铁死亡 Gpx4 海洋化合物 虚拟筛选 分子动力学
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