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肺腺癌患者代谢相关基因和免疫相关预后模型的建立
1
作者
邓彪
陈春源
+3 位作者
黄裕锋
陈心铭
罗连响
(
指导
)
梁柱(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第15期1851-1860,共10页
目的:构建一个基于代谢相关基因(MRGs)的肺腺癌(LUAD)预测模型并分析肿瘤免疫微环境(TIME)与MRGs的关系。方法:从TCGA和GEO数据库下载LUAD的基因表达数据,Msign数据库提取MRGs,取交集得到LUAD患者MRGs表达矩阵和对应的临床数据。单因素...
目的:构建一个基于代谢相关基因(MRGs)的肺腺癌(LUAD)预测模型并分析肿瘤免疫微环境(TIME)与MRGs的关系。方法:从TCGA和GEO数据库下载LUAD的基因表达数据,Msign数据库提取MRGs,取交集得到LUAD患者MRGs表达矩阵和对应的临床数据。单因素COX回归分析和Lasso回归分析筛选出生存相关MRGs并据此构建风险预测模型。采用Kaplan-Meier曲线验证模型区分高低风险患者的能力,ROC曲线预测患者生存率的稳定性。对模型基因进行GO、KEGG富集分析和单样本基因集富集分析(ssGSEA)以评估相关通路活性和免疫细胞浸润水平。结果:构建并验证了一个基于MRGs的预后模型,该模型能较好地区分高低风险的LUAD患者,具有稳定的预测性能,并可在一定程度反映TIME。基于模型风险评分绘制的列线图可更准确地预测LUAD患者一、三、五年生存率,更方便临床使用。结论:本研究确定了一些有临床意义的MRGs,是LUAD患者生存率、TIME的潜在预测指标。基于这些基因构建的风险模型和列线图具有良好的预测性能。
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关键词
肺腺癌
代谢相关基因
预后
肿瘤免疫微环境
生物信息学
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职称材料
题名
肺腺癌患者代谢相关基因和免疫相关预后模型的建立
1
作者
邓彪
陈春源
黄裕锋
陈心铭
罗连响
(
指导
)
梁柱(
指导
)
机构
广东医科大学附属医院心胸外科
广东医科大学第一临床医学院
南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江)
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第15期1851-1860,共10页
基金
广东医科大学附属医院临床研究重点项目(LCYJ2018B001)
南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江)(湛江湾实验室)项目(ZJW-2019-07)
+1 种基金
湛江市科技计划项目(2019A01009)
广东省基础与应用基础研究基金项目(2019A1515110201)。
文摘
目的:构建一个基于代谢相关基因(MRGs)的肺腺癌(LUAD)预测模型并分析肿瘤免疫微环境(TIME)与MRGs的关系。方法:从TCGA和GEO数据库下载LUAD的基因表达数据,Msign数据库提取MRGs,取交集得到LUAD患者MRGs表达矩阵和对应的临床数据。单因素COX回归分析和Lasso回归分析筛选出生存相关MRGs并据此构建风险预测模型。采用Kaplan-Meier曲线验证模型区分高低风险患者的能力,ROC曲线预测患者生存率的稳定性。对模型基因进行GO、KEGG富集分析和单样本基因集富集分析(ssGSEA)以评估相关通路活性和免疫细胞浸润水平。结果:构建并验证了一个基于MRGs的预后模型,该模型能较好地区分高低风险的LUAD患者,具有稳定的预测性能,并可在一定程度反映TIME。基于模型风险评分绘制的列线图可更准确地预测LUAD患者一、三、五年生存率,更方便临床使用。结论:本研究确定了一些有临床意义的MRGs,是LUAD患者生存率、TIME的潜在预测指标。基于这些基因构建的风险模型和列线图具有良好的预测性能。
关键词
肺腺癌
代谢相关基因
预后
肿瘤免疫微环境
生物信息学
Keywords
Lung adenocarcinoma
Metabolism-related genes
Prognostic
Tumor immune microenvironment
Bioinformatics
分类号
R734.4 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
肺腺癌患者代谢相关基因和免疫相关预后模型的建立
邓彪
陈春源
黄裕锋
陈心铭
罗连响
(
指导
)
梁柱(
指导
)
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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