铜绿假单胞菌耐药基因分析及多位点序列遗传分型

目的了解2011-2012年深圳市南山区医院病人,各医院、诊所内环境台面涂抹样、医护人员手涂抹样分离的铜绿假单胞菌,抗生素耐药基因分布及基因的遗传多样性。方法采用聚合酶链反应技术检测铜绿假单胞菌的20种耐药基因:TEM、VEB、CARB、OXA、SHV、PER、GES、GTX、SPM、GIM、IMP、VIM、DHA、oprD、Aac(6′)-Ⅰ、Aac(6′)-Ⅱ、Aac(3′)-Ⅰ、Aac(2″)-Ⅰ、qacE1-sull及Ⅰ类整合子基因。采用多位点序列分子分型方法进行聚类和克隆分析。结果检出11种耐药基因:TEM、SHV、IMP、DHA、Aac(6’)-Ⅰ、Aac(6′)-Ⅱ、Aac(3′)-Ⅰ、Aac(2″)-Ⅰ、qacE1-sull、Ⅰ类整合子及oprD基因,检出率分别为8.1%、6.4%、4.8%、9.7%、4.8%、14.5%、4.8%、56.5%,8.1%,8.1%,oprD基因缺失率为61.2%。52株铜绿假单胞菌检出耐药基因,形成19种耐药基因谱。多位点序列分型方法将62株铜绿假单胞菌,分为39个ST型,5个克隆群,1个优势克隆群CC244,1个优势独特型ST856。结论不同类型样本分离菌株携带耐药基因存在差异,部分病人分离株携带多种耐药基因。本研究铜绿假单胞菌具有遗传多样性,存在优势克隆群。

AB法处理含合成洗涤剂的废水

研究结果表明,在适当条件下,AB工艺用于处理含合成洗涤剂废水的COD_(Cr)和BOD_5总去除率分别为90％～95％和86％～96％,比常规活性污泥法提高36％～45％。

2014—2019年深圳市南山区医疗机构消毒质量监测分析

目的了解深圳市南山区各级医疗机构消毒工作现状,为提高医疗机构的消毒质量提供科学依据。方法通过现场采样检测方法,对深圳市南山区各级医疗机构消毒质量进行监测与分析。结果监测期间对8种对象采样,共计11982份,总体合格率为96.26%,连续6年监测合格率呈逐步上升趋势。公立医院、民营医院、社区健康服务中心和个体医疗机构的消毒监测合格率分别为97.75%、98.22%、96.58%和94.99%,差异有统计学意义(χ^(2)=62.063,P<0.001)。医护人员手卫生合格率最低,为88.70%;其次是污水和一次性医疗用品,合格率分别为93.18%和95.00%。不同级别医疗机构中,个体医疗机构人员手卫生和物体表面合格率均低于较高级别医疗机构。结论深圳市南山区医疗机构消毒质量整体良好,但仍存在一些薄弱环节,特别是个体医疗机构的手卫生和公立医院污水需要进一步加强消毒监测和管理。

基层医疗机构小型压力蒸汽灭菌器使用现况调查

目的了解基层医疗机构小型压力蒸汽灭菌器的使用管理及灭菌质量现况。方法随机选取深圳市50家医疗机构使用中的小型压力蒸汽灭菌器作为监测对象,采用问卷调查、现场查看和使用温度记录仪、生物监测和化学监测进行灭菌效果监测。结果共调查61台小型压力蒸汽灭菌器,应用温度记录仪进行有效实时物理、生物、化学监测,合格率分别为94.10%(5215/5542),99.35%(616/620)和100%。同批次实时物理监测和生物监测的结果有差异(P=0.039),吻合系数κ=0.243(P<0.01),吻合度较弱。医疗机构有制定操作规程的占76%,消毒管理人员经培训持证上岗率为54%,定期开展校准、物理监测和化学监测的医疗机构占比分别为42%、20%和100%,每周开展生物监测的医疗机构占比为8%。结论所调查医疗机构小型压力蒸汽灭菌器存在管理和监测不规范的问题,需加强消毒人员培训和监管,同时加强物理参数监测和故障原因分析,保证灭菌器的灭菌效果。

一起中学GI.P2-GI.2型诺如病毒暴发疫情调查及厨工感染因素分析

目的 调查深圳市某中学一起诺如病毒感染暴发疫情,探索可能的传播途径和危险因素,为制定防控措施提供科学依据。方法 采用现场流行病学调查方法对病例进行个案调查,描述疾病流行特征,开展现场卫生学调查,采用病例对照研究探索厨工感染危险因素。采集病例和厨工肛拭子标本,用实时荧光定量PCR法检测诺如病毒核酸,部分阳性样本进行基因测序和系统进化分析。结果 2020年9月11—27日,深圳市某中学共发现学生病例31例,均为高三学生,罹患率为3.33%(31/930),无班级和宿舍聚集性,厨工26例检测诺如病毒阳性,其中2例发病,感染率为41.94%(26/62);厕所相邻班级的发病风险高于其余班级(OR=4.014,95%CI:2.012~8.009);每天使用食堂更衣室≥3次为厨工感染的危险因素(OR=7.378,95%CI:1.013~53.711)。104份肛拭子标本,经检测48份为GI型诺如病毒核酸阳性,厨工和学生病例的病毒测序结果为GI.P2-GI.2型,序列相似度为100.00%。88.46%(23/26)的感染厨工排毒时间超过10 d。结论 本次疫情为一起GI.P2-GI.2型诺如病毒感染暴发疫情,厨工可能经接触传播感染发病或隐性携带病毒,后污染食堂加工食品或餐具而传播给用餐学生。

一起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情的流行病学调查

目的调查深圳市某研究院一起诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情的原因,分析流行特征,为有效控制疫情提供科学依据。方法对食堂、饮水、厨工宿舍等开展卫生学调查,采集病例和餐饮从业人员肛拭子、饮用水、留样食品和环境等样本进行病原学检测,采用描述流行病学方法分析疫情流行病学特征,应用病例对照研究分析暴发疫情的传播方式及危险因素。结果2020年12月10—16日,疫情共报告病例165例,隐性感染者16例,罹患率为4.77%。临床症状主要为腹泻(89.09%)、恶心(60.00%)、呕吐(51.52%),腹泻伴呕吐者占40.61%。某研究院的病例无部门和宿舍聚集性,餐饮从业人员以E2食堂感染率最高(33.33%,11/33)且有宿舍聚集性。实验室检测发现27份病例肛拭子、16份厨工肛拭子和1份厨工工服表面涂抹样诺如病毒核酸GII型阳性,E2食堂自选餐线12月10~11日的3份留样食品菌落总数超标,4份水样检测卫生学指标正常。病例对照结果显示12月9~11日多个餐次在E2食堂自选快餐用餐感染风险增加(OR=1.828~6.256),饭前便后每次洗手能降低感染风险(OR=0.522)。结论本起事件为一起由GⅡ型诺如病毒引起的感染性腹泻暴发疫情,食用了E2食堂感染厨工污染的自选快餐是疫情暴发的主要危险因素。

深圳市副溶血弧菌O3：K6血清变异型病原学特征研究

目的分析2006--2012年深圳市食物中毒中分离的副溶血弧菌03：K6血清变异型毒力基因和分子分型特征，及其与03：K6血清型的基因遗传关系。方法对深圳市2006--2012年食物中毒病例肛拭子样本中分离的115株副溶血弧菌进行PFGE分型，并根据地域分布与分离时间的不同，选取了7株03：K6血清型为对照组，对其以及03：K6血清变异型分别进行tdh和trh毒力基因检测，群特异性PER（GS．PCR）和。邪基因检测，及多位点测序分型（MLST）。结果115株副溶血弧菌中，带型相似度〉80％的菌株占58．3％（67／115），其中，03：K6血清型占67％（44／67），01：KUT血清型占5％（4／67），03：K6血清变异型占28％（19／67）。03：K6血清变异型中，01：K25血清型占7％（5／67），04：K68血清型占10％（7／67），011：K36血清型占10％（7／67），其均携带tdh基因，不携带fm基因，GS—PCR扩增基因和ory8基因阳性占10／19，GS—PCR扩增基因和0#8基因阴性占5／19，GS—PCR扩增基因阴性、0邢基因阳性占4／19，ST-3型占17／19，ST-305型占2／19。对照组均携带tdh基因，不携带￡旃基因，为GS—PCR扩增基因、o够基因阳性以及sT-3型。ST．305型与sT．3型在dtdS和pntA两个管家基因上有差异，在dtdS基因的第305个碱基处，ST-305型（147号等位基因）为T，sT-3型（4号等位基因）为C；在pntA基因的第33个碱基处，ST-305型（93号等位基因）为C，ST．3型（29号等位基因）为A。结论04：K68、01：K25、011：K36血清型毒力基因携带与03：K6血清型相似，且MLST结果一致，遗传关系接近，为03：K6血清变异型。

金黄色葡萄球菌毒力基因检测及Spa分型研究

目的研究深圳市南山区2009 2015年医院内患者临床检测标本、医院台面与医护人员双手涂抹样以及食物中毒样本中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)蛋白A基因多态性分型(single locus DNA-sequencing of the repeat region of the Staphylococcus protein A gene,Spa)的特征及毒力基因分布情况。方法采用多重PCR方法检测SA的mec A与fem A基因,PCR方法检测24个毒力基因以及SA蛋白A基因,PCR产物测序后序列上传数据库进行比对。结果 87株SA共检出48株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant S.aureus,MRSA),检出率为55.2%。共检出21种毒力基因,检出率>60%的毒力基因有LUKDE(65.5%)、SHE(67.8%)、mpHLG2(85.1%)、HLD(93.1%)和HLA(100.0%)。94.3%菌株携带5个以上毒力基因。三类样本中有11种毒力基因检出率差异有统计学意义,分别是SEB、mpSEC、mpSEJ、mpSEO、TST、HLB、HLD、mpHLG1、mpHLG2,mpETB和PVL。其中mpETB与PVL仅在患者中检出,肠毒素基因在食物中毒株中携带率较高。MRSA与甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(methicillin-sensitive S.aureus,MSSA)的3种毒力基因检出率差异有统计学意义,分别是mpETA、PVL及mpHLG2;MRSA的毒力基因mpETA与PVL检出率明显高于MSSA(P=0.033,P=0.030),而mpHLG2检出率明显低于MSSA(P=0.021)。87株SA分为24种Spa型,患者优势型别为t030(30.0%)与t437(36.7%),医院其他样本优势型别为t091(50.0%),食物中毒优势型别为t127(36.8%)与t091(21.1%)。结论三类样本部分毒力基因检出差异有统计学意义。MRSA与MSSA携带毒力基因差异无统计学意义。三类样本中均存在优势的Spa型别。

铜绿假单胞菌抗生素耐药性及耐药相关基因检测

目的了解2011-2012年深圳市南山区医院患者,各医院诊所内环境、医护人员手涂抹样以及食品样中铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruinosa,PA）对抗生素耐药性及携带耐药基因情况。方法利用VITEK 2 compact全自动微生物鉴定仪对PA菌进行药敏试验。采用聚合酶链反应（polymeras chain reaction,PCR）技术检测PA的20种耐药基因：β-内酰胺TEM、VEB、CARB、OXA、SHV、PER、GES、GTX、SPM、GIM,金属β-内酰胺酶IMP、VIM,AmpC酶DHA,膜通道蛋白oprD,氨基糖苷类修饰酶Aac（6’）-Ⅰ、Aac（6’）-Ⅱ、Aac（3’）-Ⅰ、Aac（2’）-Ⅰ,耐消毒基因qacE1-sull与Ⅰ类整合子基因。结果药敏试验显示53株菌对11种抗菌药物阿米卡星、氨苄西林等耐药率为100%,对呋喃妥因、亚胺培南等耐药率为10%~30%。检出11种耐药基因：TEM、SHV、IMP、DHA、Aac（6’）-Ⅰ、Aac（6’）-Ⅱ、Aac（3’）-Ⅰ、Aac（2’’）-Ⅰ、qacE1-sull、Ⅰ类整合子及oprD基因,检出率分别为7.54%、5.66%、3.77%、11.32%、5.66%、15.09%、5.66%、58.49%、9.43%和9.43%,oprD基因缺失率为67.93%。结论部分分离自患者菌株呈多重耐药,且携带多种耐药基因,应引起高度重视。不同类型样本分离菌株携带耐药基因存在差异。

2009-2015年深圳市不同来源样本中金黄色葡萄球菌毒力耐药特征及分子分型研究

目的研究2009-2015年深圳市不同来源样本中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)携带毒力、耐药基因、耐药表型情况和分子型别研究。方法 2009-2015年期间,86株SA分离自医院病人、医院环境涂抹样、食物中毒等样品。PCR方法检测毒力基因、耐药基因以及耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)的SCCmec基因型,进行蛋白A基因多态性(single locus DNA-sequencing of the repeat region of the Staphylococcus protein A gene,Spa)以及多位点序列分型(multilocus sequencing typing,MLST)研究。按照美国临床和实验室标准协会(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)方法,对抗菌药物进行药敏试验。结果检出21种毒力基因,55株(64.0%)携带mecA基因。SCCmec分型结果,Ⅲ型为优势型别(60.0%,33/55)。86株SA分为24种Spa型,MRSA菌株Spa优势型别为t030与t437,甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌菌株(methicillin sensitive Staphylococcus aureus,MSSA)的优势型别为t091与t127。86株SA分为23种MLST型,形成3个克隆复合体CC239(27.9%)、CCnew3(27.9%)与CC188(11.6%)。结论优势型别为ST239(Spa-t030)、STnew3(Spa-t437)具有多药耐药的特征,且携带多种毒力基因。MRSA流行株、非流行株与MSSA在携带毒力与耐药基因之间均存在差异。需要加强监测SA中的优势型别及MRSA菌株.关注其耐药的动态变化。

深圳地区环境中创伤弧菌携带质粒分析及多位点序列遗传分型

目的了解2010-2013年深圳市南山区环境中不同样品中分离的创伤弧菌质粒携带情况及基因的遗传多样性。方法采用聚合酶链反应技术检测深圳市南山区环境样品中创伤弧菌的6种质粒基因:seq25、seq51、Tra I、Tra I2、Tra D及Vep07。采用多位点序列分子分型方法进行分子分型及聚类分析。结果 50株创伤弧菌中,43株菌(43/50,86%)携带质粒,形成19种质粒图谱:20株(20/50,40%)同时存在毒力与结合质粒,13株(13/50,26%)仅存在毒力质粒,2株(2/50,4%)仅存在结合质粒。多位点序列分型方法将50株创伤弧菌,分为43个ST型。结论质粒广泛存在于深圳市南山区环境样品分离的创伤弧菌中,不同类型样本分离菌株携带质粒存在差异且具有遗传多样性。

2017—2020年深圳市南山区部分医疗机构口腔治疗用水污染状况调查

目的调查分析深圳市南山区2017—2020年医疗机构口腔治疗用水污染状况,为制订针对性控制措施提供依据。方法现场采集辖区内综合性医院口腔科和个体口腔诊所综合治疗台的治疗用水,进行细菌菌落总数、大肠埃希菌、耐热大肠菌群三项指标的检测,统计分析其污染状况。结果262份水样均未检出大肠埃希菌、耐热大肠菌群,但其中50份(19.08%)细菌菌落总数超标。不同年份、不同类别医疗机构、不同类型口腔治疗用水污染率差异具有统计学意义,2018年(29.73%)、个体口腔诊所(25.71%)、手机水(28.42%)污染较为严重。结论深圳市南山区医疗机构口腔治疗用水细菌菌落总数超标,个体口腔诊所的口腔治疗用水污染较严重,相关部门应强化从业人员专业培训和针对性监督检查力度。

广州市番禺区医用X射线诊断设备影像质控检测与分析

目的分析广州市番禺区医用X射线诊断设备的运行状况,查找可能存在的问题并提出改进意见,以期达到提高医用X射线诊断设备的诊断质量、降低受检者及工作人员的受照剂量的目的。方法使用质量控制测量系统对广州市番禺区43台医用X射线诊断设备的摄影和透视质量控制指标进行检测,并按照WS 76-2011中相关规定对其进行评价。结果本次检测在用的43台医用X射线诊断设备中,检测项目全部合格的有40台,占93.0%,其中国产设备合格率为94.7%,进口设备合格率为91.7%。各检测项目结果显示,出现不合格的检测项目为光野与照射野偏离、自动亮度控制,其检测合格率分别为93.1%、92.3%;其余检测项目如管电压指示偏离、输出量的线性和重复性、空间分辨力、低对比度分辨率等合格率均为100%。结论广州市番禺区医用X射线诊断设备的总体运行情况良好,但是一些社区卫生服务中心等基层医疗单位仍然存在一定问题,医用X射线诊断设备的质量控制工作仍需加强,定期进行质量控制检测十分必要。