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两种药物协同效应对酵母细胞转录组的影响
1
作者
沈成
童侨
+3 位作者
金一然
袁辰阳
罗静帆
黄新河
《生物信息学》
2017年第4期229-234,共6页
寻找抗衰老活性分子并研究其作用机制是衰老药物学的研究重点和热点。前期研究发现活性分子多球壳菌素和雷帕霉素可通过分子间协同效应延缓芽殖酵母细胞衰老。为了考察这两种小分子协同效应对细胞转录组的影响,利用DNA Microarray技术...
寻找抗衰老活性分子并研究其作用机制是衰老药物学的研究重点和热点。前期研究发现活性分子多球壳菌素和雷帕霉素可通过分子间协同效应延缓芽殖酵母细胞衰老。为了考察这两种小分子协同效应对细胞转录组的影响,利用DNA Microarray技术及生物信息学手段系统分析了这两种小分子药物协同处理对基因表达谱、基因本体聚类及相关信号通路的影响。研究结果显示,药物协同效应对细胞转录组产生了显著影响,共导致2 546个基因的差异表达(FDR<0.05,Fold Change>10%),其中1 157个基因显著上调,1 389个基因显著下调。进一步对基因本体聚类及信号通路分析显示,线粒体相关的分子功能、细胞组分、生物学过程和信号通路是此协同效应的一个主要靶点,其他可能的作用靶点还包括核糖体的生物发生、细胞骨架及过氧化物酶体代谢。
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关键词
多球壳菌素
雷帕霉素
协同效应
芽殖酵母
抗衰老
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职称材料
题名
两种药物协同效应对酵母细胞转录组的影响
1
作者
沈成
童侨
金一然
袁辰阳
罗静帆
黄新河
机构
西南交通大学生命科学与工程学院
出处
《生物信息学》
2017年第4期229-234,共6页
基金
中央高校科技创新项目(2682016CX099)
中国大学生科研训练计划项目(201610613063)
+1 种基金
四川省科技厅应用基础研究项目(2016JY0113)
成都市科学技术局科技惠民计划(2015-HMOJ-00047-SF)
文摘
寻找抗衰老活性分子并研究其作用机制是衰老药物学的研究重点和热点。前期研究发现活性分子多球壳菌素和雷帕霉素可通过分子间协同效应延缓芽殖酵母细胞衰老。为了考察这两种小分子协同效应对细胞转录组的影响,利用DNA Microarray技术及生物信息学手段系统分析了这两种小分子药物协同处理对基因表达谱、基因本体聚类及相关信号通路的影响。研究结果显示,药物协同效应对细胞转录组产生了显著影响,共导致2 546个基因的差异表达(FDR<0.05,Fold Change>10%),其中1 157个基因显著上调,1 389个基因显著下调。进一步对基因本体聚类及信号通路分析显示,线粒体相关的分子功能、细胞组分、生物学过程和信号通路是此协同效应的一个主要靶点,其他可能的作用靶点还包括核糖体的生物发生、细胞骨架及过氧化物酶体代谢。
关键词
多球壳菌素
雷帕霉素
协同效应
芽殖酵母
抗衰老
Keywords
Myriocin
Rapamycin
Synergistic effects
Saccharomyces cerevisiae
Anti-aging
分类号
Q255 [生物学—细胞生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
两种药物协同效应对酵母细胞转录组的影响
沈成
童侨
金一然
袁辰阳
罗静帆
黄新河
《生物信息学》
2017
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