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利用RNA-seq技术筛选火毛撒坝猪和杜洛克猪背最长肌差异基因 被引量:2
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作者 李再磊 窦必成 +5 位作者 赵玉香 邱丙姗 吴正明 翁亚烦 孙婷婷 赵桂英 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第5期136-141,共6页
本研究旨在利用RNA-seq技术研究中国地方猪种火毛撒坝猪优良性状的分子机制,发掘和鉴定地方猪种肉质性状和适应性的主效基因。屠宰火毛撒坝猪和杜洛克猪各4头,取背最长肌组织提取RNA,使用转录组测序筛选出差异表达的基因后进行GO和KEGG... 本研究旨在利用RNA-seq技术研究中国地方猪种火毛撒坝猪优良性状的分子机制,发掘和鉴定地方猪种肉质性状和适应性的主效基因。屠宰火毛撒坝猪和杜洛克猪各4头,取背最长肌组织提取RNA,使用转录组测序筛选出差异表达的基因后进行GO和KEGG分析,研究了火毛撒坝猪和杜洛克猪2个猪种间3683个差异显著表达基因。结果表明,在富集的48条通路中,有6条信号通路与脂类代谢相关,其富集的过氧化物酶体增殖剂激活受体等差异表达基因与脂肪的代谢、沉积有关;初步筛选出6条与脂类代谢相关的通路和相关的基因。 展开更多
关键词 转录组测序 火毛撒坝猪 杜洛克猪 差异表达基因 背最长肌
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云南六个小型猪的亲缘关系比较分析 被引量:1
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作者 翁亚烦 李志勋 +5 位作者 邱丙珊 杨圳超 刘平 信吉阁 富国文 赵桂英 《家畜生态学报》 北大核心 2020年第9期39-42,共4页
利用线粒体DNA D-loop高变区为标记,研究云南六个小型猪之间的亲缘关系,以期从分子水平揭示它们的遗传多样性及其分布规律,为其遗传资源的保护及开发利用提供参考。采集滇南小耳猪(版纳、盈江、金平、芒市)、迪庆藏猪、明光小耳猪的耳组... 利用线粒体DNA D-loop高变区为标记,研究云南六个小型猪之间的亲缘关系,以期从分子水平揭示它们的遗传多样性及其分布规律,为其遗传资源的保护及开发利用提供参考。采集滇南小耳猪(版纳、盈江、金平、芒市)、迪庆藏猪、明光小耳猪的耳组织,进行DNA提取及扩增、测序、拼接,并利用MEGA软件构建系统树,分析云南六个小型猪之间的亲缘关系。结果表明六个小型猪群中,版纳小耳猪(BN)与迪庆藏猪(DQ)遗传距离最远;版纳小耳猪(BN)、盈江小耳猪(YJ)、金平小耳猪(JP)与芒市小耳猪(MS)聚为一类,其中,盈江小耳猪(YJ)与芒市小耳猪(MS)聚为一小类,版纳小耳猪(BN)与金平小耳猪(JP)聚为一小类;明光小耳猪(MG)与迪庆藏猪(TP)聚为一类。研究证明云南六个小型猪群体遗传距离的大小与其相对地理距离的远近、生活环境及猪种类型吻合。 展开更多
关键词 云南小型猪 mtDNA D-loop 亲缘关系
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基于RNA-Seq技术鉴定撒坝猪与杜洛克猪肝脏组织差异表达基因 被引量:1
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作者 吴正明 邱丙姗 +4 位作者 李志勋 程娜 翁亚烦 李再磊 赵桂英 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2021年第11期119-125,共7页
为了鉴定撒坝猪和杜洛克猪肝脏组织的转录组差异表达基因,揭示撒坝猪肉质性状和生长性状的相关遗传机理,实验以260日龄撒坝猪和杜洛克猪肥猪(各4头)为研究对象,用RNA-seq技术并结合现代高通量测序技术对撒坝猪和杜洛克猪的肝脏组织样品... 为了鉴定撒坝猪和杜洛克猪肝脏组织的转录组差异表达基因,揭示撒坝猪肉质性状和生长性状的相关遗传机理,实验以260日龄撒坝猪和杜洛克猪肥猪(各4头)为研究对象,用RNA-seq技术并结合现代高通量测序技术对撒坝猪和杜洛克猪的肝脏组织样品进行测序,鉴定并挑选撒坝猪和杜洛克猪肝脏组织中的差异表达基因,并对其进行GO功能和KEGG通路富集分析与可变剪接分析。从撒坝猪和杜洛克猪肝脏组织中共鉴定出差异表达基因2326个,其中上调表达基因1049个,下调表达基因1277个;在GO数据库中共检测到521个差异表达基因,在KEGG数据库中共检测到651个差异表达基因;经过对差异表达基因进行显著富集通路的分析挑选出可能与撒坝猪肉质和生长性状相关的通路20条;进一步与标准参考基因组对比分析共发掘出27499个差异可变剪接。说明PPAR信号通路等20条信号通路在撒坝猪的肉质形成和生长发育过程中起重要作用。本研究结果为猪种遗传改良提供了理论参考依据。 展开更多
关键词 肝脏 转录组 差异表达 富集分析
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不同区域藏猪性能的比较研究 被引量:7
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作者 邱丙姗 杨繁 +6 位作者 周京伟 夏伟 李志勋 翁亚烦 张志鹏 毕宝学 赵桂英 《猪业科学》 2019年第9期128-131,共4页
通过对不同区域藏猪的胴体、肉质性状和肌肉营养价值的比较分析,找出不同区域藏猪性能的差异性及优势,为藏猪的开发利用提供理论依据。该研究以6头西藏昌都藏猪、6头香格里拉藏猪(各自为3头公猪和3头母猪)为试验对象,通过屠宰测定、肉... 通过对不同区域藏猪的胴体、肉质性状和肌肉营养价值的比较分析,找出不同区域藏猪性能的差异性及优势,为藏猪的开发利用提供理论依据。该研究以6头西藏昌都藏猪、6头香格里拉藏猪(各自为3头公猪和3头母猪)为试验对象,通过屠宰测定、肉质检测、肌肉营养价值测定等,对两个不同区域藏猪的性能进行比较分析。结果发现:1)两个区域的藏猪在胴体性状方面无显著差异(P>0.05);2)在肉质性状上,香格里拉藏猪宰后24 h的大理石纹评分下降的程度比西藏昌都藏猪多,差异显著(P<0.05);3)氨基酸含量,香格里拉藏猪的苏氨酸、缬氨酸、蛋氨酸、亮氨酸、酪氨酸含量比西藏昌都藏猪高,差异极显著(P<0.01);谷氨酸、组氨酸、必需氨基酸含量比西藏昌都藏猪高,差异显著(P<0.05);甘氨酸、丙氨酸、赖氨酸、精氨酸、脯氨酸、鲜味氨基酸含量比西藏昌都藏猪低,差异极显著(P<0.01);4)脂肪酸含量,西藏昌都藏猪的油酸、单不饱和脂肪酸(总)、不饱和脂肪酸(总)含量比香格里拉藏猪高,差异极显著(P<0.01);辛酸、十二酸、十四酸、十五酸、十七酸、亚油酸、二十碳二烯酸、多不饱和脂肪酸(总)、饱和脂肪酸(总)、必需脂肪酸(总)含量比香格里拉藏猪低,且差异极显著(P<0.01)。结果表明,两个区域的藏猪在胴体性状方面没有差别,但肌肉营养价值区别较大,可为不同区域在藏猪的养殖及推广方面提供参考。 展开更多
关键词 藏猪 胴体性状 肉质性状 肌肉营养价值
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保山猪品牌建设的思考 被引量:1
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作者 李志勋 龚绍荣 +4 位作者 李朝震 邱丙珊 翁亚烦 舒相华 赵桂英 《养殖与饲料》 2019年第5期1-4,共4页
目前,保山猪的养殖虽具备了一定的生产规模,但因缺少强大的品牌而没有创造出与之对应的产值。因此,走区域品牌化道路、加强品牌建设与推广是保山猪科学、健康发展的必由之路。本文介绍了保山猪品牌发展的优势:地理位置优越、政策环境优... 目前,保山猪的养殖虽具备了一定的生产规模,但因缺少强大的品牌而没有创造出与之对应的产值。因此,走区域品牌化道路、加强品牌建设与推广是保山猪科学、健康发展的必由之路。本文介绍了保山猪品牌发展的优势:地理位置优越、政策环境优良、政府机构健全;指出了保山猪品牌发展的制约因素:科研资金投入不足、养殖经济效益低下、肉品加工技术落后;提出了保山猪品牌建设的措施:建立健全保山猪饲养规范流程,实施知识产权示范工程,培养养殖和产品研发人才,充分利用资源积极招商引资。 展开更多
关键词 保山猪 品牌建设 发展优势 制约因素 经济效益
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黄荆对DLY育肥猪生长性能的影响
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作者 王志祥 赵贵武 +5 位作者 潘选梅 马浩 吴旭东 杨圳超 翁亚烦 赵桂英 《上海畜牧兽医通讯》 2018年第3期31-33,共3页
通过在DLY生长育肥猪的基础日粮中添加不同剂量的黄荆,比较黄荆对猪生长育肥性能的影响。试验选取体重相近的DLY育肥猪52头,随机分为5组,4个试验组和1个对照组,试验组黄荆按1.5%、2.5%、3.5%、4.0%的比例添加到基础日粮中,进行90d的饲... 通过在DLY生长育肥猪的基础日粮中添加不同剂量的黄荆,比较黄荆对猪生长育肥性能的影响。试验选取体重相近的DLY育肥猪52头,随机分为5组,4个试验组和1个对照组,试验组黄荆按1.5%、2.5%、3.5%、4.0%的比例添加到基础日粮中,进行90d的饲喂试验,并对试验结果进行统计分析。结果:(1)试验Ⅰ组日增重比对照组降低46.00g,差异不显著(P>0.05);试验Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ组日增重比对照组分别降低230.56、243.67、323.22g,差异显著(P<0.05);试验Ⅰ组日增重比试验Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ组分别提高184.56、197.67、277.22g,差异显著(P<0.05);试验Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ组组间差异不显著(P>0.05)。(2)试验Ⅰ、Ⅲ组料重比比对照组分别提高0.68、0.31,试验Ⅱ、Ⅳ组料重比比对照组分别降低1.49、2.69。(3)饲喂黄荆的猪肉无公害指标检测合格,铅、无机砷含量在安全范围,金霉素、四环素、土霉素未检出。结论:试验Ⅰ组日增重最高,料重比最好;随着黄荆添加量的增加,DLY育肥猪的生长速度减缓;黄荆可作为无抗添加剂生产无公害猪肉。 展开更多
关键词 DLY 黄荆 料重比 日增重
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云南3个地方猪种猪肉的营养价值比较分析 被引量:15
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作者 翁亚烦 富国文 +5 位作者 吴旭东 杨圳超 李璇 李智连 刘永刚 赵桂英 《畜牧与兽医》 北大核心 2018年第11期45-48,共4页
为进一步利用云南地方猪种资源和生产优质猪肉,选用高黎贡山猪、撒坝猪、滇南小耳猪3个云南地方猪种,测定其背最长肌的水分、粗蛋白、灰分、粗脂肪、脂肪酸、胆固醇、氨基酸含量并进行比较分析。结果显示,高黎贡山猪脂肪含量较撒坝猪、... 为进一步利用云南地方猪种资源和生产优质猪肉,选用高黎贡山猪、撒坝猪、滇南小耳猪3个云南地方猪种,测定其背最长肌的水分、粗蛋白、灰分、粗脂肪、脂肪酸、胆固醇、氨基酸含量并进行比较分析。结果显示,高黎贡山猪脂肪含量较撒坝猪、滇南小耳猪高(P〈0. 05),而撒坝猪粗蛋白含量最高(P〈0. 01)。3个猪种各种氨基酸含量依次为撒坝猪、滇南小耳猪、高黎贡山猪,且3个猪种之间差异性极显著(P〈0. 01)。撒坝猪胆固醇含量最低,极显著低于高黎贡山猪(P 〈0. 01),低于滇南小耳猪(P〉0. 05)。结果表明,高黎贡山猪猪肉营养成分丰富,脂肪品质好;撒坝猪猪肉味鲜,胆固醇含量较低。 展开更多
关键词 云南地方猪 肉质 氨基酸 胆固醇 脂肪酸
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铁皮石斛对免疫抑制模型小鼠血清抗氧化酶活性及细胞因子含量的影响 被引量:5
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作者 林福新 邹奕恒 +4 位作者 张连妹 翁亚烦 阮雨虹 李焰 王华 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第5期39-42,共4页
为了研究铁皮石斛对环磷酰胺(cyclophosphamide,CY)所致免疫抑制模型小鼠血清中抗氧化酶活性及细胞因子含量的影响,试验选用100只雌性KM种小鼠随机分为5组,每组5个重复,每个重复4只。Ⅰ组为对照组,每天灌服0.3 m L纯化水;Ⅱ组为模型组,... 为了研究铁皮石斛对环磷酰胺(cyclophosphamide,CY)所致免疫抑制模型小鼠血清中抗氧化酶活性及细胞因子含量的影响,试验选用100只雌性KM种小鼠随机分为5组,每组5个重复,每个重复4只。Ⅰ组为对照组,每天灌服0.3 m L纯化水;Ⅱ组为模型组,每天灌服0.3 m L纯化水;Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ组为试验组,分别灌服1,2,3 g/kg铁皮石斛水煎剂。Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ组按体重100 mg/kg腹腔注射CY,隔日注射1次,连续15 d。结果表明:试验成功构建免疫抑制小鼠模型。与Ⅰ组(对照组)相比,Ⅱ组(模型组)、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ组小鼠血清中GSH-Px活性显著降低(P<0.05);各组间CAT活性差异均不显著(P>0.05);Ⅱ组(模型组)和Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ组小鼠血清中IL-4、IFN-γ、IL-10含量均存在显著差异(P<0.05)。与Ⅱ组(模型组)相比,Ⅰ组(对照组)与和Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ组小鼠血清中MDA含量显著降低(P<0.05);Ⅰ组(对照组)和Ⅴ组小鼠血清中SOD活性显著升高(P<0.05),Ⅲ、Ⅳ组小鼠血清中SOD活性有升高趋势(P>0.05);Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ组小鼠血清中IL-2含量显著降低(P<0.05);Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ及Ⅴ组小鼠血清中IL-4/IFN-γ比值差异显著(P<0.05)。说明铁皮石斛能通过调控CY构建的免疫抑制小鼠血液内细胞因子,从而对免疫抑制小鼠的血清抗氧化酶活性及Th1与Th2细胞发挥调节作用,使得血液细胞因子指标恢复正常,有效提高环磷酰胺所致的小鼠免疫调节机能,具有一定的免疫增强作用。 展开更多
关键词 铁皮石斛 环磷酰胺 免疫抑制小鼠 血清 抗氧化酶活性 细胞因子
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保山猪PRLR、NOCA1和HTRA3基因多态性与其产仔数的关联分析 被引量:7
9
作者 李志勋 富国文 +6 位作者 信吉阁 龚绍荣 赵加鼎 翁亚烦 邱丙珊 吴旭东 赵桂英 《畜牧与兽医》 北大核心 2020年第4期19-23,共5页
采集保山猪耳组织样品共计180头份,记录、统计328窝保山猪经产母猪的总产仔数和产活仔数。通过聚合酶链反应(PCR)、限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术对保山猪的3个繁殖候选基因PRLR、NOCA1、HTRA3的多态性进行研究,分别... 采集保山猪耳组织样品共计180头份,记录、统计328窝保山猪经产母猪的总产仔数和产活仔数。通过聚合酶链反应(PCR)、限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术对保山猪的3个繁殖候选基因PRLR、NOCA1、HTRA3的多态性进行研究,分别计算各繁殖基因在保山猪群体中等位基因频率、基因型频率,多态信息含量、卡方值等遗传信息值,并将各繁殖基因多态性和合并基因型的多态性与保山猪产仔数进行关联分析。试验结果表明:3个基因PRLR、NOCA1、HTRA3的各基因型之间产仔数差异不显著(P>0.05),未发现可作为保山猪产仔数候选基因的证据。合并基因型后发现,保山猪繁殖性状PRLR-NOCA1最优分子标记组合为BBBB型,PRLR-HTRA3最优分子标记组合为AAAA型,NOCA1-HTRA3最优分子标记组合为BBAB型。 展开更多
关键词 保山猪 繁殖基因 多态性 产仔数
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银杏叶复方对脾虚小鼠小肠淋巴细胞体外增殖的影响 被引量:1
10
作者 李朝杰 张征 +4 位作者 阮雨虹 翁亚烦 张连妹 李焰 孙艳发 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第8期204-207,共4页
为了探究不同浓度的银杏叶复方在脂多糖(LPS)或植物血凝集素(PHA)刺激下对脾虚小鼠小肠淋巴细胞体外增殖的影响,试验用不同浓度的银杏叶复方(200μg/mL、100μg/mL、10μg/mL、1μg/mL、0.1μg/mL)同LPS或PHA刺激小肠淋巴细胞分裂增殖... 为了探究不同浓度的银杏叶复方在脂多糖(LPS)或植物血凝集素(PHA)刺激下对脾虚小鼠小肠淋巴细胞体外增殖的影响,试验用不同浓度的银杏叶复方(200μg/mL、100μg/mL、10μg/mL、1μg/mL、0.1μg/mL)同LPS或PHA刺激小肠淋巴细胞分裂增殖的方法研究对小鼠淋巴细胞体外增殖的影响。结果表明:对于脾虚小鼠小肠B淋巴细胞,以200μg/mL、100μg/mL的浓度刺激效果最佳(P<0.05);相比于1μg/mL、0.1μg/mL浓度,浓度为200μg/mL时更有利于正常小鼠小肠B淋巴细胞增殖(P<0.05);对于脾虚小鼠小肠T淋巴细胞,以100μg/mL浓度最佳(P<0.05),浓度为200μg/mL和100μg/mL时对正常小鼠小肠T淋巴细胞的刺激增殖效果显著(P<0.05)。说明银杏叶复方浓度为200μg/mL、100μg/mL时能有效刺激正常和脾虚小鼠的小肠淋巴细胞分裂增殖。 展开更多
关键词 银杏叶复方 脾虚模型 小肠淋巴细胞 体外培养 小鼠 增殖
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通过饲养技术集成提高大河乌猪繁殖性能试验 被引量:1
11
作者 杨圳超 牛元力 +5 位作者 富国文 李祥 吴旭东 翁亚烦 段坤 赵桂英 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第16期75-77,共3页
为提高大河乌猪的繁殖性能,试验选择80头大河乌猪种母猪,随机分为试验组和对照组,试验组从饲养环境、饲料品质、饲料饲喂量、饲养程序调控等方面对母猪、仔猪进行饲养技术集成,对照组按常规方法饲养。结果表明:与对照组比较,试验组仔... 为提高大河乌猪的繁殖性能,试验选择80头大河乌猪种母猪,随机分为试验组和对照组,试验组从饲养环境、饲料品质、饲料饲喂量、饲养程序调控等方面对母猪、仔猪进行饲养技术集成,对照组按常规方法饲养。结果表明:与对照组比较,试验组仔猪初生窝重、初生均重、断奶窝重、70日龄窝重等指标均显著提高(P〈0.05);断奶均重、70日龄均重极显著提高(P〈0.01);初生仔猪的弱仔数、每周死亡数显著降低(P〈0.05);试验组与对照组产仔数、产活仔数、断奶头数、70日龄断奶头数差异不显著(P〉0.05)。说明通过饲养技术的集成能有效提高大河乌猪母猪繁殖性能。 展开更多
关键词 大河乌猪 饲养技术集成 繁殖性能 仔猪 初生重 断奶性状
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云南两个地方猪和杜洛克猪的营养成分比较 被引量:5
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作者 李志勋 翁亚烦 +2 位作者 杨圳超 胖文婷 赵桂英 《食品工业》 CAS 北大核心 2020年第4期341-345,共5页
对火毛撒坝猪、高黎贡山猪、杜洛克猪的生长性状、胴体性能、肉质性状进行比较,为云南两个优质地方猪种的保护与开发利用提供理论依据。试验饲养火毛撒坝猪、高黎贡山猪、杜洛克猪各10头(5♂,5♀),至260日龄随机屠宰各猪种6头(3♂,3♀)... 对火毛撒坝猪、高黎贡山猪、杜洛克猪的生长性状、胴体性能、肉质性状进行比较,为云南两个优质地方猪种的保护与开发利用提供理论依据。试验饲养火毛撒坝猪、高黎贡山猪、杜洛克猪各10头(5♂,5♀),至260日龄随机屠宰各猪种6头(3♂,3♀),测定其生长性状、胴体性能、肉质性状、肌肉组织学特性、脂肪酸、氨基酸和胆固醇,并进行显著性比较分析。结果说明:高黎贡山猪猪肉风味、口感更好,营养价值更高;火毛撒坝猪胆固醇含量低,保健性能更佳,但沉脂率强,在饲养方式上有待改进;杜洛克猪仍保持外来猪种的特性,但鲜味氨基酸和总氨基酸含量比火毛撒坝猪高,还需进一步研究。 展开更多
关键词 猪种 生长性状 胴体性状 氨基酸 胆固醇 脂肪酸
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基于RNA-Seq技术对高黎贡山猪与杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选 被引量:2
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作者 李志勋 杨圳超 +2 位作者 翁亚烦 邱丙姗 赵桂英 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第15期71-74,170,171,共6页
为了筛选出高黎贡山猪与杜洛克猪背最长肌的差异表达基因,为高黎贡山猪的分子选育提供科学依据,试验选用胎次相近、70日龄的高黎贡山猪和杜洛克猪各10头(5♂,5♀),在相同的饲养管理条件下饲养至260日龄,屠宰12头,其中高黎贡山猪6头(3♂,... 为了筛选出高黎贡山猪与杜洛克猪背最长肌的差异表达基因,为高黎贡山猪的分子选育提供科学依据,试验选用胎次相近、70日龄的高黎贡山猪和杜洛克猪各10头(5♂,5♀),在相同的饲养管理条件下饲养至260日龄,屠宰12头,其中高黎贡山猪6头(3♂,3♀)、杜洛克猪6头(3♂,3♀),利用RNA-Seq技术对两个品种猪背最长肌肌肉组织进行测序,先使用edgeR软件对高黎贡山猪与杜洛克猪背最长肌转录组数据进行差异分析,再将差异表达基因进行GO富集分析和KEGG富集分析。结果表明:高黎贡山猪与杜洛克猪差异表达的基因、显著富集的通路大部分与脂肪的沉积、代谢和脂肪细胞分化相关。说明高黎贡山猪与杜洛克猪背最长肌的肌内脂肪含量受基因转录水平的调控。 展开更多
关键词 高黎贡山猪 杜洛克猪 背最长肌 转录组 差异表达基因 富集分析
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