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支气管肺泡灌洗液高通量测序技术在成人肺部感染中的应用价值
被引量:
2
1
作者
朱常军
杜兴冉
+6 位作者
吕敏捷
张长文
翁哲琪
金霄
邵明玥
陈思锡
冯旰珠
《国际呼吸杂志》
2022年第15期1148-1157,共10页
目的评估支气管肺泡灌洗液(BALF)高通量测序技术在肺部感染病原学诊断中的价值及对患者预后的影响。方法计算机检索PubMed、Embase、Cochrane Library、Web of science、clinical trials.gov.cn、中国知网、万方数据库和中国生物医学文...
目的评估支气管肺泡灌洗液(BALF)高通量测序技术在肺部感染病原学诊断中的价值及对患者预后的影响。方法计算机检索PubMed、Embase、Cochrane Library、Web of science、clinical trials.gov.cn、中国知网、万方数据库和中国生物医学文献数据库,检索时间为自建库时间至2021年12月8日。比较BALF宏基因组测序与传统病原学检测方法对肺部感染检测的阳性率、敏感度及特异度;根据病原学检测结果调整治疗方案,比较2组患者的抗生素使用强度、住院时长、28/30 d及90 d病死率。采用Review Manager 5.4.1软件对上述指标分别进行meta分析。结果最终纳入35篇文献,共2624例患者,其中高通量测序组2248例,传统病原学检测组2493例。meta分析结果显示,高通量测序组阳性率为79.8%(1793/2248),高于传统病原学检测组41.7%(1039/2493)(OR=6.84,95%CI:4.84~9.67,Z=10.88,P<0.001);敏感度、特异度及汇总受试者工作特征曲线下面积均高于传统病原学检测组。9篇论文纳入的患者为重症肺炎患者,亚组分析结果示,重症肺炎患者BALF高通量测序阳性率为85.8%(495/577),高于传统病原学检测组42.9%(282/657)(OR=6.52,95%CI:4.04~10.52,Z=7.69,P<0.001)。根据病原检测结果调整治疗方案,与传统病原学检测组相比,高通量测序组患者抗生素使用强度降低(SMD=-40.04,95%CI:-47.05~-33.03,Z=11.19,P<0.001);平均住院时长缩短(SMD=-4.68,95%CI:-6.12~-3.25,Z=6.40,P<0.001)。高通量测序组28/30 d及90 d病死率分别为9.09%和12.82%,均低于传统检测组26.44%(OR=0.26,95%CI:0.13~0.51,Z=3.89,P<0.001)和38.30%(OR=0.21,95%CI:0.07~0.66,Z=2.67,P=0.008)。结论与传统病原学诊断方法相比,BALF高通量测序对肺部感染具有更高的诊断价值。根据BALF高通量测序结果调整治疗方案,可降低患者的抗生素使用强度,缩短住院时间,降低病死率,改善患者预后。
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关键词
感染
高通量测序
支气管肺泡灌洗液
META分析
原文传递
题名
支气管肺泡灌洗液高通量测序技术在成人肺部感染中的应用价值
被引量:
2
1
作者
朱常军
杜兴冉
吕敏捷
张长文
翁哲琪
金霄
邵明玥
陈思锡
冯旰珠
机构
南京医科大学第二附属医院呼吸与危重症医学科
出处
《国际呼吸杂志》
2022年第15期1148-1157,共10页
基金
国家自然科学基金(81870009)。
文摘
目的评估支气管肺泡灌洗液(BALF)高通量测序技术在肺部感染病原学诊断中的价值及对患者预后的影响。方法计算机检索PubMed、Embase、Cochrane Library、Web of science、clinical trials.gov.cn、中国知网、万方数据库和中国生物医学文献数据库,检索时间为自建库时间至2021年12月8日。比较BALF宏基因组测序与传统病原学检测方法对肺部感染检测的阳性率、敏感度及特异度;根据病原学检测结果调整治疗方案,比较2组患者的抗生素使用强度、住院时长、28/30 d及90 d病死率。采用Review Manager 5.4.1软件对上述指标分别进行meta分析。结果最终纳入35篇文献,共2624例患者,其中高通量测序组2248例,传统病原学检测组2493例。meta分析结果显示,高通量测序组阳性率为79.8%(1793/2248),高于传统病原学检测组41.7%(1039/2493)(OR=6.84,95%CI:4.84~9.67,Z=10.88,P<0.001);敏感度、特异度及汇总受试者工作特征曲线下面积均高于传统病原学检测组。9篇论文纳入的患者为重症肺炎患者,亚组分析结果示,重症肺炎患者BALF高通量测序阳性率为85.8%(495/577),高于传统病原学检测组42.9%(282/657)(OR=6.52,95%CI:4.04~10.52,Z=7.69,P<0.001)。根据病原检测结果调整治疗方案,与传统病原学检测组相比,高通量测序组患者抗生素使用强度降低(SMD=-40.04,95%CI:-47.05~-33.03,Z=11.19,P<0.001);平均住院时长缩短(SMD=-4.68,95%CI:-6.12~-3.25,Z=6.40,P<0.001)。高通量测序组28/30 d及90 d病死率分别为9.09%和12.82%,均低于传统检测组26.44%(OR=0.26,95%CI:0.13~0.51,Z=3.89,P<0.001)和38.30%(OR=0.21,95%CI:0.07~0.66,Z=2.67,P=0.008)。结论与传统病原学诊断方法相比,BALF高通量测序对肺部感染具有更高的诊断价值。根据BALF高通量测序结果调整治疗方案,可降低患者的抗生素使用强度,缩短住院时间,降低病死率,改善患者预后。
关键词
感染
高通量测序
支气管肺泡灌洗液
META分析
Keywords
Infections
High-throughput sequencing
Bronchoalveolar lavage fluid
Meta-analysis
分类号
R563.1 [医药卫生—呼吸系统]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
支气管肺泡灌洗液高通量测序技术在成人肺部感染中的应用价值
朱常军
杜兴冉
吕敏捷
张长文
翁哲琪
金霄
邵明玥
陈思锡
冯旰珠
《国际呼吸杂志》
2022
2
原文传递
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参考文献
引证文献
统计分析
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