菜豆CACTA转座元件注释、标记开发及其在品种鉴定中的应用

[目的]本文旨在对菜豆(Phaseolus vulgaris)基因组中CACTA转座元件进行鉴定,分析其序列特征、插入位点特征、进化关系、基因结构和功能基因并进行标记开发,为CACTA转座元件功能研究和应用奠定基础。[方法]基于菜豆的全基因组数据,采用生物信息学方法进行序列鉴定和分析;基于所鉴定的CACTA转座元件插入位点多态性,随机设计51对引物;利用筛选的11对引物,对24个菜豆品种进行亲缘关系分析和分子身份证构建。[结果]菜豆基因组中共鉴定出来源于20个家族的1645个插入位置明确的CACTA转座元件。这些元件DNA总长度约4.71 Mb,占整个基因组DNA的0.9%左右。CACTA转座元件均匀分布在11条染色体上,与功能基因的分布没有相关性。插入偏好性分析提示,菜豆CACTA转座元件更倾向于插入AT富集区域。系统进化分析表明,菜豆CACTA转座元件可以划分为4个进化支。CladeⅠ和CladeⅣ进化支分别拥有最多的家族数量(50.0%)和元件数量(57.7%),但各进化支家族数量与元件数量差异较大。与功能基因的关系分析表明,有390个CACTA转座元件插入功能基因的内部或基因的临近区域(<2 kb);有258个元件捕获完整的基因或基因片段。标记开发结果显示,材料间遗传相似系数为0.28~1.00,平均遗传相似系数为0.64,并在遗传相似系数0.53水平上可以将24个品种分为4类。[结论]本研究从全基因组水平上系统鉴定和注释了菜豆基因组中的CACTA转座元件,并明确了其在基因组中的分布规律、插入偏好性、系统进化关系和与基因之间的关系;构建了菜豆品种特异的分子身份证,可用于菜豆品种的系统分类、亲缘关系和品种鉴定。

绿豆Copia类反转座子全基因组注释及进化分析

利用基于结构从头寻找和同源比对的方法,从绿豆基因组中鉴定出插入位置明确的1198个完整的Copia类反转座子和1038个solo LTR转座子元件。这些元件不均匀分布在绿豆的22条染色体上,并和功能基因的分布呈现显著的负相关关系。绝大部分Copia类反转座子(91.8%)在最近5.0 MYA内插入到寄主基因组中,并在1.0~2.0 MYA呈现1个明显的活跃峰值。此外,每个家族的solo LTR转座元件数量与完整转座元件数量的比值与进化时间无关,而与LTR的长度呈现显著的正相关关系。尽管这些Copia类反转座子可划分为Angela、Ale、Bianca、Ivana、Maximus和TAR等6个谱系,但各谱系内所包含的家族数和元件数差异较大。通过染色体上的位置比较,发现67个Copia类反转座子家族的713个元件插入到629个功能基因的内部或附近区域(<1 kb),提示这些元件可能对基因的结构、表达和功能产生一定的影响。

针对我国的财政税收体制改革的相关思考

国家财政税收制度的改革作为经济发展过程中的重要因素,要随着我国经济体制的改革而不断的做出调整,同时建立恰当的预算体制,从而促进我国的整体经济水平的提高。本文通过对财政税收体制改革进行相关分析,提出相关的观点和看法。

乳化剂在畜禽饲料中的应用

为促进畜禽生长、提升养殖收益,养殖户在禽畜饲料中添加脂肪成分,但由于幼龄畜禽消化系统发育未完全,对脂肪的消化吸收能力较差。另外,成年畜禽机体内产生的胆汁酸盐和脂肪酶量也不足以消化大量的脂肪,饲料中添加的脂肪不能完全被乳化和吸收,导致浪费,大量未乳化脂肪还会导致畜禽腹泻,影响畜禽生产效率。乳化剂可使脂肪溶解于水中,为饲料添加剂应用可以促进畜禽吸收饲料中的脂肪,促进畜禽生长。

财政税收对市场经济发展的作用

财政税收是推动我国社会经济发展的重要动力,是进一步改善和保障民生的重要条件。随着我国市场经济转型期的到来,优化财政税收制度不仅可以保证经济活力,而且可以及时的调配各种经济资源,有效消除区域间经济发展不平衡,推动创新型的经济要素实现快速发展,推动落后产能的快速淘汰。在财政税收管理深化改革的当下,应当深刻认识财政税收对经济发展的作用。