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基于小RNA测序和数据库比对探究PRMT1调控的sncRNAs在哮喘中的作用
1
作者
翟炜琪
张孝珍
孙青竹
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期1099-1110,共12页
小非编码RNA(small non-coding RNA,sncRNA)包括microRNA(miRNA)和PIWI蛋白互作RNA(PIWI-interacting RNA,piRNAs),其异常表达参与支气管哮喘(简称哮喘)气道上皮炎症过程。目前的研究多基于哮喘相关sncRNA的异常表达功能研究,少有对snc...
小非编码RNA(small non-coding RNA,sncRNA)包括microRNA(miRNA)和PIWI蛋白互作RNA(PIWI-interacting RNA,piRNAs),其异常表达参与支气管哮喘(简称哮喘)气道上皮炎症过程。目前的研究多基于哮喘相关sncRNA的异常表达功能研究,少有对sncRNA表达变化原因的探究。我们前期的研究发现,蛋白质精氨酸甲基转移酶1(protein arginine methyltransferase 1,PRMT1)作为哮喘标志性分子,参与上皮细胞炎症的发生和气道下重塑。本文利用过表达人肺上皮细胞BEAS-2B中哮喘标志性基因PRMT1,进行sncRNA深度测序并与哮喘数据库联合分析,将差异表达的sncRNA与5个Gene Expression Omnibus(GEO)测序数据集进行比较,发现23种PRMT1调控的哮喘相关的sncRNA。利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证,筛选出12种miRNA和2种piRNA。将这些sncRNA靶基因与哮喘病人生成的上皮细胞样本mRNA测序结果(GSE18965和GSE43696)进行交叉比对,初步确定哮喘相关基因,并进行Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)预测。分析表明,哮喘相关sncRNA主要靶标是Ras/Rap1-MAPK信号通路,包含53种靶基因。本研究通过小RNA测序(small RNA Seq)技术探寻PRMT1调控的下游sncRNA,比对现有的数据库,识别出PRMT1调节的sncRNA及其目标信号通路Ras/Rap1-MAPK,为哮喘的发病机制研究提供了新的sncRNA分子和信号通路靶点。
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关键词
支气管哮喘
蛋白质精氨酸转甲基酶1
微RNA
PIWI互作RNA
Ras/Rap1-MAPK信号通路
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职称材料
猪精液常温保存抗氧化剂的研究进展
被引量:
7
2
作者
连星
张红俊
+4 位作者
杜烨青
边伊林
王艳华
翟炜琪
胡建宏
《畜牧兽医杂志》
2017年第4期41-43,共3页
随着规模化养猪业的不断发展,猪的人工授精技术越来越受到重视,但猪精液的有效保存就成为提高精液质量的关键。本文通过分析影响猪精液体外常温保存的物质、稀释液,综述了猪精液常温保存抗氧化剂方面的新发展,表明猪精液中加入抗氧化剂...
随着规模化养猪业的不断发展,猪的人工授精技术越来越受到重视,但猪精液的有效保存就成为提高精液质量的关键。本文通过分析影响猪精液体外常温保存的物质、稀释液,综述了猪精液常温保存抗氧化剂方面的新发展,表明猪精液中加入抗氧化剂能够有效延长精子保存时间,稀释液是影响猪精液保存效果的重要因素。
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关键词
猪精液
常温保存
抗氧化剂
研究进展
下载PDF
职称材料
题名
基于小RNA测序和数据库比对探究PRMT1调控的sncRNAs在哮喘中的作用
1
作者
翟炜琪
张孝珍
孙青竹
机构
西北农林科技大学动物科技学院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期1099-1110,共12页
基金
国家自然科学基金(No.31871314)
陕西省青年科技新星项目(No.2019kjxx-008)资助。
文摘
小非编码RNA(small non-coding RNA,sncRNA)包括microRNA(miRNA)和PIWI蛋白互作RNA(PIWI-interacting RNA,piRNAs),其异常表达参与支气管哮喘(简称哮喘)气道上皮炎症过程。目前的研究多基于哮喘相关sncRNA的异常表达功能研究,少有对sncRNA表达变化原因的探究。我们前期的研究发现,蛋白质精氨酸甲基转移酶1(protein arginine methyltransferase 1,PRMT1)作为哮喘标志性分子,参与上皮细胞炎症的发生和气道下重塑。本文利用过表达人肺上皮细胞BEAS-2B中哮喘标志性基因PRMT1,进行sncRNA深度测序并与哮喘数据库联合分析,将差异表达的sncRNA与5个Gene Expression Omnibus(GEO)测序数据集进行比较,发现23种PRMT1调控的哮喘相关的sncRNA。利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证,筛选出12种miRNA和2种piRNA。将这些sncRNA靶基因与哮喘病人生成的上皮细胞样本mRNA测序结果(GSE18965和GSE43696)进行交叉比对,初步确定哮喘相关基因,并进行Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)预测。分析表明,哮喘相关sncRNA主要靶标是Ras/Rap1-MAPK信号通路,包含53种靶基因。本研究通过小RNA测序(small RNA Seq)技术探寻PRMT1调控的下游sncRNA,比对现有的数据库,识别出PRMT1调节的sncRNA及其目标信号通路Ras/Rap1-MAPK,为哮喘的发病机制研究提供了新的sncRNA分子和信号通路靶点。
关键词
支气管哮喘
蛋白质精氨酸转甲基酶1
微RNA
PIWI互作RNA
Ras/Rap1-MAPK信号通路
Keywords
asthma
protein arginine methyltransferase 1(PRMT1)
microRNA(miRNAs)
PIWI-interacting RNA(piRNAs)
Ras/Rap1-MAPK
分类号
R3 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
猪精液常温保存抗氧化剂的研究进展
被引量:
7
2
作者
连星
张红俊
杜烨青
边伊林
王艳华
翟炜琪
胡建宏
机构
陕西正能农牧科技有限责任公司
白水县史官镇畜牧兽医站
西北农林科技大学动物科技学院
拉萨市动物疫病预防控制中心
出处
《畜牧兽医杂志》
2017年第4期41-43,共3页
基金
国家生猪产业技术体系(CARS-36)
西北农林科技大学试验示范站(基地)科技成果推广项目(TGZX2015-18)
文摘
随着规模化养猪业的不断发展,猪的人工授精技术越来越受到重视,但猪精液的有效保存就成为提高精液质量的关键。本文通过分析影响猪精液体外常温保存的物质、稀释液,综述了猪精液常温保存抗氧化剂方面的新发展,表明猪精液中加入抗氧化剂能够有效延长精子保存时间,稀释液是影响猪精液保存效果的重要因素。
关键词
猪精液
常温保存
抗氧化剂
研究进展
Keywords
Boar semen
noamal temperature preservation
antioxidant
research progress
分类号
S814.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于小RNA测序和数据库比对探究PRMT1调控的sncRNAs在哮喘中的作用
翟炜琪
张孝珍
孙青竹
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
下载PDF
职称材料
2
猪精液常温保存抗氧化剂的研究进展
连星
张红俊
杜烨青
边伊林
王艳华
翟炜琪
胡建宏
《畜牧兽医杂志》
2017
7
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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