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基于CUDA的蛋白质翻译后修饰鉴定MS-Alignment算法加速研究 被引量:1
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作者 翟艳堂 涂强 +2 位作者 郎显宇 陆忠华 迟学斌 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2010年第9期3409-3414,共6页
对MS-Alignment算法进行分析得出该算法很难满足大规模数据对鉴定速度的要求,而且具有的一个特点是相同的任务在不同的数据上重复计算,为数据划分提供了基础。基于CUDA编程模型使用图形处理器(GPU)对步骤数据库检索及候选肽段生成进... 对MS-Alignment算法进行分析得出该算法很难满足大规模数据对鉴定速度的要求,而且具有的一个特点是相同的任务在不同的数据上重复计算,为数据划分提供了基础。基于CUDA编程模型使用图形处理器(GPU)对步骤数据库检索及候选肽段生成进行加速优化,设计了该步骤在单GPU上的实现方法。测试结果表明,此方法平均加速比为30倍以上,效果良好,可以满足蛋白质翻译后修饰鉴定中大规模数据快速计算的需求。 展开更多
关键词 蛋白质翻译后修饰鉴定 MS-Alignment 图形处理器 统一计算设备架构
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腾讯大规模Hadoop集群实践 被引量:1
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作者 翟艳堂 《程序员》 2014年第2期99-103,共5页
TDW是腾讯最大的离线数据处理平台。本文主要从需求、挑战、方案和未来计划等方面,介绍了TDW在建设单个大规模集群中采取的JobTracker分散化和NameNode高可用两个优化方案。
关键词 集群 腾讯 数据处理平台 优化方案 高可用 分散化
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