基于网络药理学探讨白藜芦醇治疗肺癌的生物分子机制

目的基于网络药理学,运用在线数据库研究白藜芦醇治疗肺癌的潜在作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、PubChem、Swiss TargetPrediction、GeneCards数据库分别获取白藜芦醇和肺癌的相关基因,取二者交集基因,使用String数据库获得交集基因的蛋白相互作用(PPI)网络图,使用DAVID6.8对交集基因进行GO和KEGG富集分析。采用Cytoscape3.7.2软件构建化合物-靶点-通路-疾病网络模型。使用AutoDock4.2.6软件对白藜芦醇和重要靶点进行分子对接。Western blot检测白藜芦醇对人肺癌H1975细胞p-Akt蛋白表达的影响。结果获得白藜芦醇和肺癌交集基因78个,PPI网络图表明交集基因关系密切。富集分析得到生物过程55项、分子功能26项、细胞组分18项,以及86条相关通路,其中以PI3K-Akt通路富集靶点较多。分子对接结果显示,白藜芦醇与PIK3CB、PIK3CA这2个重要靶点均能稳定结合。Western blot检测结果显示,白藜芦醇能够显著降低人肺癌H1975细胞p-Akt蛋白表达。结论白藜芦醇可能主要通过作用于PIK3CB、PIK3CA靶点,介导PI3K-Akt信号通路发挥治疗肺癌作用。

基于网络药理学研究龙葵抗肺癌的生物作用机制

目的研究龙葵治疗肺癌的药理机制。方法以药代动力学参数(口服生物利用度≥30%,药物相似性≥0.18)作为筛选标准,从中药成分检索数据库中筛选出龙葵的主要活性成分,并预测活性成分相关作用靶点。用Genecards数据库查询已知的肺癌治疗靶点,通过Calculate and draw custom Venn diagrams构建药物靶点与肺癌靶点韦恩图并获得两者共同靶点,用String数据库绘制共同靶点的蛋白相互作用网络图;再用Cytoscape软件构建龙葵的成分-靶点-疾病网络模型,用WebGestalt和David分别进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书功能富集分析。结果共筛选出龙葵活性成分7个,相关靶点51个。根据蛋白质相互作用(PPI)网络图,可知共有51个节点,146条关系。富集分析显示龙葵可以通过多个通路对肺癌产生治疗作用。结论龙葵可通过作用于多个靶点,并参与调控多个网络通路发挥治疗肺癌的作用。

基于数据库挖掘和分子生物学探讨白藜芦醇治疗肺腺癌的作用机制

目的:结合生物信息学与分子生物学探讨白藜芦治疗肺腺癌的作用机制。方法:从DrugBank获取白藜芦醇作用靶点信息,运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。在TCGA数据库中分析靶标基因在肿瘤及正常组织中表达量,预示其在肿瘤发生发展中的影响。然后,运用随机森林和单因素COX回归的分析方法对靶标基因进行筛选。结合生物信息学结果,使用分子生物学探究白藜芦醇治疗肺腺癌的作用机制。结果:基于白藜芦醇作用靶点的PPI网络,筛选出10个Hub基因,其中溶质载体家族2成员1(SLC2A1),花生四烯酸5-脂氧合酶(ALOX5),过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)和花生四烯酸15-脂氧合酶(ALOX15)在肿瘤和正常组织中表达量具有显著差异。然后,随机森林和单因素COX回归分析结果表明SLC2A1对肺腺癌的生存和预后意义重大。KM-plotter生存分析结果显示SLC2A1表达量与肺癌患者的总体生存率(OS),初次进展(FP),进展后生存率(PPS)均紧密相关。分子生物学实验也进一步证明白藜芦醇能够通过降低SLC2A1表达,抑制肺腺癌细胞的增殖和迁移。免疫组化评分显示SLC2A1在肿瘤和正常组织中蛋白表达量具有显著差异。结论:白藜芦醇通过降低SLC2A1表达,抑制肺腺癌细胞的增殖和迁移,在肺腺癌的临床治疗中具有深远意义。