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基于PEG胁迫表达谱发掘调控谷子干旱胁迫的泛素连接酶E3基因
被引量:
1
1
作者
宋敏
马芳芳
+6 位作者
侯思宇
张雁明
刘龙龙
耿潞阳
江璇宇
李红英
韩渊怀
《山西农业大学学报(自然科学版)》
CAS
2016年第12期860-867,共8页
[目的]探析谷子调控干旱胁迫的E3基因。[方法]本文基于二代测序技术获得勾勾母鸡咀(GG)和晋汾16(JF)在PEG胁迫下的转录表达谱数据,运用生物信息学检索筛选出11个干旱相关的E3基因,对其理化性质、功能域、启动子元件、表达模式以及...
[目的]探析谷子调控干旱胁迫的E3基因。[方法]本文基于二代测序技术获得勾勾母鸡咀(GG)和晋汾16(JF)在PEG胁迫下的转录表达谱数据,运用生物信息学检索筛选出11个干旱相关的E3基因,对其理化性质、功能域、启动子元件、表达模式以及与其它物种E3基因的系统进化分析。[结果]蛋白等电点介于4.78~8.88之间,功能域主要为ZF_UBR型、ZF_RING和U_BOX型三类,启动子序列包含干旱诱导响应元件MBS或脱落酸响应元件ABRE等,其中Si001665m和Si022170m与PUB22/23亲缘关系较近,Si029090m与PUB19亲缘关系较近。[结论]初步确定这些是调控谷子干旱胁迫的E3候选基因,可能受干旱或脱落酸诱导表达,这为进一步研究谷子干旱响应相关的泛素连接酶E3基因提供理论依据。
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关键词
谷子
泛素连接酶E3
干旱胁迫
表达谱
下载PDF
职称材料
题名
基于PEG胁迫表达谱发掘调控谷子干旱胁迫的泛素连接酶E3基因
被引量:
1
1
作者
宋敏
马芳芳
侯思宇
张雁明
刘龙龙
耿潞阳
江璇宇
李红英
韩渊怀
机构
山西农业大学农学院
特色杂粮种质资源发掘与育种改良山西省重点实验室
山西农业大学农业生物工程研究所
农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室
出处
《山西农业大学学报(自然科学版)》
CAS
2016年第12期860-867,共8页
基金
国家自然科学基金(31371693
31471556
31401396)
文摘
[目的]探析谷子调控干旱胁迫的E3基因。[方法]本文基于二代测序技术获得勾勾母鸡咀(GG)和晋汾16(JF)在PEG胁迫下的转录表达谱数据,运用生物信息学检索筛选出11个干旱相关的E3基因,对其理化性质、功能域、启动子元件、表达模式以及与其它物种E3基因的系统进化分析。[结果]蛋白等电点介于4.78~8.88之间,功能域主要为ZF_UBR型、ZF_RING和U_BOX型三类,启动子序列包含干旱诱导响应元件MBS或脱落酸响应元件ABRE等,其中Si001665m和Si022170m与PUB22/23亲缘关系较近,Si029090m与PUB19亲缘关系较近。[结论]初步确定这些是调控谷子干旱胁迫的E3候选基因,可能受干旱或脱落酸诱导表达,这为进一步研究谷子干旱响应相关的泛素连接酶E3基因提供理论依据。
关键词
谷子
泛素连接酶E3
干旱胁迫
表达谱
Keywords
Foxtail millet
Ubiquitin ligase E3
Drought stress
Expression profile
分类号
S515 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于PEG胁迫表达谱发掘调控谷子干旱胁迫的泛素连接酶E3基因
宋敏
马芳芳
侯思宇
张雁明
刘龙龙
耿潞阳
江璇宇
李红英
韩渊怀
《山西农业大学学报(自然科学版)》
CAS
2016
1
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