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基于转录组与代谢组料慈竹的耐盐机制分析
1
作者
杜娟
陈咸吉
+6 位作者
王哲
聂现辉
陈彦超
艾文胜
孟勇
汪启明
彭国平
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期35-41,共7页
选取盐处理组(1.0%NaCl溶液浇灌)和对照组(用井水浇灌)料慈竹的成熟叶片进行转录组与代谢组分析,分析料慈竹在转录水平与次生代谢物水平的变化。结果表明:与对照组相比,处理组共检测到差异基因487个,其中上调基因257个,下调基因230个;G...
选取盐处理组(1.0%NaCl溶液浇灌)和对照组(用井水浇灌)料慈竹的成熟叶片进行转录组与代谢组分析,分析料慈竹在转录水平与次生代谢物水平的变化。结果表明:与对照组相比,处理组共检测到差异基因487个,其中上调基因257个,下调基因230个;GO功能分析基因差异表达(DEGs)结果显示,在盐胁迫下叶片中DNA出现损伤,甲基转移酶复合物富集最多;DEGs的KEGG富集分析发现,料慈竹的糖类、氨基酸类代谢相关途径富集种类较多,次生代谢产物途径富集数量最多;盐处理后差异表达的次生代谢物共有225种,上调的有77种,下调的有148种,其中差异表达显著上调的次生代谢产物1种(log_(2)(FC)≥1),为葫芦巴碱,下调的有20种(log_(2)(FC)≤-1),主要为酚酸类及黄酮类化合物;料慈竹在长时间的盐胁迫下依靠自身的甲基化复合物相关基因调控稳定了基因的表达,但盐胁迫仍然导致DNA受到损伤;通过初生代谢能力的提高及下游苯丙素类生物合成途径的减少,料慈竹的可溶性糖、可溶性蛋白、葫芦巴碱等渗透压调节物质含量提高,维持了渗透压,保证在盐胁迫下的生理活性,提高了在含盐环境中的生长能力。
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关键词
料慈竹
盐胁迫
代谢组
转录组
苯丙素类生物合成
基因差异表达
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职称材料
基于叶绿体DNA条形码的竹子种属聚类分析与耐盐性鉴定
被引量:
3
2
作者
陈咸吉
聂现辉
+6 位作者
艾文胜
孟勇
肖扬波
周楚人
彭逸斯
汪启明
彭国平
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期514-522,共9页
利用3种叶绿体DNA条形码序列ndhF、psbA–trnH、rps16对竹亚科植物17个属的98个竹种进行DNA条形码聚类分析,并对已知的43个耐盐竹种进行聚类分析。结果显示:3种DNA条形码序列对竹子具有良好的通用性,平均通用性在96%以上;psbA–trnH未...
利用3种叶绿体DNA条形码序列ndhF、psbA–trnH、rps16对竹亚科植物17个属的98个竹种进行DNA条形码聚类分析,并对已知的43个耐盐竹种进行聚类分析。结果显示:3种DNA条形码序列对竹子具有良好的通用性,平均通用性在96%以上;psbA–trnH未能对瓜多竹外的竹亚科植物种属进行聚类,能对部分耐盐竹种进行聚类;ndhF、rps16条形码序列能对部分种属进行聚类,对牡竹属、箣竹属、苦竹属中包含的耐盐竹种聚类效果较好。
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关键词
竹亚科植物
DNA条形码
NJ系统发育树
耐盐性
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职称材料
不同组分羧甲基茯苓多糖对HepG2细胞增殖的影响
被引量:
2
3
作者
杨焕治
熊芳琪
+4 位作者
杨岚
杨中扬
陈咸吉
聂现辉
彭国平
《中国食物与营养》
2019年第12期26-28,39,共4页
目的:探究不同组分羧甲基茯苓多糖(CMP)对HepG2细胞增殖的影响。方法:在不同提取碱浓度和碱处理时间下,采用二次加碱法制备不同组分CMP。利用硫酸-蒽酮法、滴定法和CCK-8法对CMP的含量、取代度和HepG2细胞增殖检测。结果:获得7个组分CMP...
目的:探究不同组分羧甲基茯苓多糖(CMP)对HepG2细胞增殖的影响。方法:在不同提取碱浓度和碱处理时间下,采用二次加碱法制备不同组分CMP。利用硫酸-蒽酮法、滴定法和CCK-8法对CMP的含量、取代度和HepG2细胞增殖检测。结果:获得7个组分CMP,含量为85%~90%,取代度为0.65~0.80。不同浓度CMP培养HepG2细胞24 h下,CMP 750μg/mL抑制细胞增殖效果最好,其中CMP3抑制率最高达50.035%。CMP 750μg/mL培养HepG2细胞24、48、72 h,在48 h下抑制效果最好,其中CMP3抑制效果最高达到76.05%。在72、48、24 h下CMP3培养HepG2细胞的IC50分别为26.34、34.06、763.64μg/mL。结论:CMP能有效抑制HepG2肿瘤细胞的增殖,其中CMP3是7个CMP组分中抑制效果最好的,这与CMP3的含量、浓度呈正相关性,48 h为CMP最适抑制时间。
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关键词
不同组分
羧甲基茯苓多糖
HEPG2
细胞增殖
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职称材料
题名
基于转录组与代谢组料慈竹的耐盐机制分析
1
作者
杜娟
陈咸吉
王哲
聂现辉
陈彦超
艾文胜
孟勇
汪启明
彭国平
机构
湖南农业大学生物科学技术学院
道地药用植物规范化栽培与综合利用湖南省工程实验室
湖南省林业科学院竹木研究所
出处
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期35-41,共7页
基金
国家重点研发计划(2018YFD0600102)。
文摘
选取盐处理组(1.0%NaCl溶液浇灌)和对照组(用井水浇灌)料慈竹的成熟叶片进行转录组与代谢组分析,分析料慈竹在转录水平与次生代谢物水平的变化。结果表明:与对照组相比,处理组共检测到差异基因487个,其中上调基因257个,下调基因230个;GO功能分析基因差异表达(DEGs)结果显示,在盐胁迫下叶片中DNA出现损伤,甲基转移酶复合物富集最多;DEGs的KEGG富集分析发现,料慈竹的糖类、氨基酸类代谢相关途径富集种类较多,次生代谢产物途径富集数量最多;盐处理后差异表达的次生代谢物共有225种,上调的有77种,下调的有148种,其中差异表达显著上调的次生代谢产物1种(log_(2)(FC)≥1),为葫芦巴碱,下调的有20种(log_(2)(FC)≤-1),主要为酚酸类及黄酮类化合物;料慈竹在长时间的盐胁迫下依靠自身的甲基化复合物相关基因调控稳定了基因的表达,但盐胁迫仍然导致DNA受到损伤;通过初生代谢能力的提高及下游苯丙素类生物合成途径的减少,料慈竹的可溶性糖、可溶性蛋白、葫芦巴碱等渗透压调节物质含量提高,维持了渗透压,保证在盐胁迫下的生理活性,提高了在含盐环境中的生长能力。
关键词
料慈竹
盐胁迫
代谢组
转录组
苯丙素类生物合成
基因差异表达
Keywords
Bambusa distegia
salt street
metabonomics
transcriptomics
phenylpropanoid biosynthesis
differentially expressed genes
分类号
S795 [农业科学—林木遗传育种]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
基于叶绿体DNA条形码的竹子种属聚类分析与耐盐性鉴定
被引量:
3
2
作者
陈咸吉
聂现辉
艾文胜
孟勇
肖扬波
周楚人
彭逸斯
汪启明
彭国平
机构
湖南农业大学生物科学技术学院
道地药用植物规范栽培与综合利用湖南省工程实验室
湖南省林业科学院竹类研究所
出处
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期514-522,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFD0600102)。
文摘
利用3种叶绿体DNA条形码序列ndhF、psbA–trnH、rps16对竹亚科植物17个属的98个竹种进行DNA条形码聚类分析,并对已知的43个耐盐竹种进行聚类分析。结果显示:3种DNA条形码序列对竹子具有良好的通用性,平均通用性在96%以上;psbA–trnH未能对瓜多竹外的竹亚科植物种属进行聚类,能对部分耐盐竹种进行聚类;ndhF、rps16条形码序列能对部分种属进行聚类,对牡竹属、箣竹属、苦竹属中包含的耐盐竹种聚类效果较好。
关键词
竹亚科植物
DNA条形码
NJ系统发育树
耐盐性
Keywords
Bambusoideae
DNA barcode
NJ-tree
salt tolerance
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S795 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
不同组分羧甲基茯苓多糖对HepG2细胞增殖的影响
被引量:
2
3
作者
杨焕治
熊芳琪
杨岚
杨中扬
陈咸吉
聂现辉
彭国平
机构
湖南农业大学生物科学技术学院/道地药用植物规范化栽培与综合利用湖南省工程实验室
出处
《中国食物与营养》
2019年第12期26-28,39,共4页
基金
国家十三五重点研发计划项目(项目编号:2018YFD0600100)
文摘
目的:探究不同组分羧甲基茯苓多糖(CMP)对HepG2细胞增殖的影响。方法:在不同提取碱浓度和碱处理时间下,采用二次加碱法制备不同组分CMP。利用硫酸-蒽酮法、滴定法和CCK-8法对CMP的含量、取代度和HepG2细胞增殖检测。结果:获得7个组分CMP,含量为85%~90%,取代度为0.65~0.80。不同浓度CMP培养HepG2细胞24 h下,CMP 750μg/mL抑制细胞增殖效果最好,其中CMP3抑制率最高达50.035%。CMP 750μg/mL培养HepG2细胞24、48、72 h,在48 h下抑制效果最好,其中CMP3抑制效果最高达到76.05%。在72、48、24 h下CMP3培养HepG2细胞的IC50分别为26.34、34.06、763.64μg/mL。结论:CMP能有效抑制HepG2肿瘤细胞的增殖,其中CMP3是7个CMP组分中抑制效果最好的,这与CMP3的含量、浓度呈正相关性,48 h为CMP最适抑制时间。
关键词
不同组分
羧甲基茯苓多糖
HEPG2
细胞增殖
Keywords
different component
carboxymethylpachyman (CMP)
HepG2
cell proliferation
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组与代谢组料慈竹的耐盐机制分析
杜娟
陈咸吉
王哲
聂现辉
陈彦超
艾文胜
孟勇
汪启明
彭国平
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
基于叶绿体DNA条形码的竹子种属聚类分析与耐盐性鉴定
陈咸吉
聂现辉
艾文胜
孟勇
肖扬波
周楚人
彭逸斯
汪启明
彭国平
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
下载PDF
职称材料
3
不同组分羧甲基茯苓多糖对HepG2细胞增殖的影响
杨焕治
熊芳琪
杨岚
杨中扬
陈咸吉
聂现辉
彭国平
《中国食物与营养》
2019
2
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职称材料
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