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基于SSR标记的132份甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析
被引量:
16
1
作者
聂立圆
李爱贤
+3 位作者
秦桢
王庆美
侯夫云
张立明
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期904-911,共8页
利用SSR分子标记技术,构建132份甘薯种质的DNA指纹图谱,并进行遗传多样性分析,旨在为甘薯种质资源亲缘关系鉴定、分类提供理论依据。利用筛选的核心引物进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测显示,19对引物共扩增出232个条带,其中多...
利用SSR分子标记技术,构建132份甘薯种质的DNA指纹图谱,并进行遗传多样性分析,旨在为甘薯种质资源亲缘关系鉴定、分类提供理论依据。利用筛选的核心引物进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测显示,19对引物共扩增出232个条带,其中多态性条带165条,多态性比率为71.1%,平均每对引物扩增出8.68个条带,多态性信息含量变化范围在0.6706~0.9331之间,平均为0.8158;其中引物SSR9和引物C33可将132份种质完全区分开,并构建供试材料的DNA指纹图谱,供试材料遗传距离在0.0363~0.5939之间,平均为0.4087,表明种质资源间遗传多样性丰富。基于SSR标记对供试材料进行聚类分析,将供试材料分为2个类群,第Ⅰ类群分为两个亚类,第Ⅰ-1亚类包括济薯25和3份日本引进品种日本金千贯、安納芋、日本薯;第Ⅰ-2亚类包括济徐薯23、苏丹、济薯09281。第Ⅱ类群分为两个亚类,第Ⅱ-1亚类由S07甘薯品系和与其亲缘关系较近的20份甘薯种质组成;第Ⅱ-2亚类由剩余的70份甘薯种质组成,为甘薯分子辅助育种中亲本的选择提供理论依据。
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关键词
甘薯
SSR
指纹图谱
遗传多样性
聚类分析
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职称材料
题名
基于SSR标记的132份甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析
被引量:
16
1
作者
聂立圆
李爱贤
秦桢
王庆美
侯夫云
张立明
机构
山东省农业科学院作物研究所/农业部黄淮海薯类科学观测实验站
山东大学生命科学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期904-911,共8页
基金
山东省良种工程项目(2016LZGC005)
国家甘薯产业技术体系(CARS-10-B07)
+1 种基金
山东省重点研发计划项目(2018GNC111016)
山东省现代农业产业技术体系薯类产业创新团队遗传育种岗位(SDAIT-10-022-04)
文摘
利用SSR分子标记技术,构建132份甘薯种质的DNA指纹图谱,并进行遗传多样性分析,旨在为甘薯种质资源亲缘关系鉴定、分类提供理论依据。利用筛选的核心引物进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测显示,19对引物共扩增出232个条带,其中多态性条带165条,多态性比率为71.1%,平均每对引物扩增出8.68个条带,多态性信息含量变化范围在0.6706~0.9331之间,平均为0.8158;其中引物SSR9和引物C33可将132份种质完全区分开,并构建供试材料的DNA指纹图谱,供试材料遗传距离在0.0363~0.5939之间,平均为0.4087,表明种质资源间遗传多样性丰富。基于SSR标记对供试材料进行聚类分析,将供试材料分为2个类群,第Ⅰ类群分为两个亚类,第Ⅰ-1亚类包括济薯25和3份日本引进品种日本金千贯、安納芋、日本薯;第Ⅰ-2亚类包括济徐薯23、苏丹、济薯09281。第Ⅱ类群分为两个亚类,第Ⅱ-1亚类由S07甘薯品系和与其亲缘关系较近的20份甘薯种质组成;第Ⅱ-2亚类由剩余的70份甘薯种质组成,为甘薯分子辅助育种中亲本的选择提供理论依据。
关键词
甘薯
SSR
指纹图谱
遗传多样性
聚类分析
Keywords
sweetpotato
SSR
fingerprinting
genetic diversity
cluster analysis
分类号
S531 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SSR标记的132份甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析
聂立圆
李爱贤
秦桢
王庆美
侯夫云
张立明
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
16
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