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题名大白菜SUS基因家族鉴定与节律表达分析
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作者
肖玉凡
许脉然
秦田雨
王俊玲
王春阳
冯大领
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机构
河北农业大学河北省蔬菜种质创新与利用重点实验室/生命科学学院
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出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期48-54,共7页
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基金
中央引导地方科技发展基金项目(236Z2903G)
大学生创新创业计划训练项目(2024183)。
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文摘
植物体内的蔗糖合酶(SUS)是一种糖基转移酶,它参与调控蔗糖的合成与运输,研究大白菜SUS基因家族的表达为揭示糖代谢的分子调控机制提供了重要基础。本研究利用生物信息学方法,进行大白菜SUS基因家族成员鉴定、理化性质、系统进化关系、蛋白基序、基因结构和物种内(间)共线性分析;利用RNA-seq技术,获得SUS家族基因的相对表达量,分析大白菜SUS家族基因的节律表达模式。结果表明:大白菜中包含13个SUS基因,均含有SUS结构域;大白菜SUS基因家族可分为3个亚家族(SUSⅠ,SUSⅡ,SUSⅢ);SUSⅡ亚家族的基因motif保守基序种类最多;多数基因含有11~14个CDS序列。大白菜SUS基因家族物种内共线性分析有4对基因参与了大片段重复事件,为大白菜进化提供动力。大白菜与拟南芥的SUS基因家族物种间共线性分析,物种间共构建了13对同源基因,其中有多个“一对多,多对一”的同源基因关系,均属于SUS基因家族的基因对有10个。对SUS家族基因的KEGG和GO功能富集分析,发现富集在淀粉与蔗糖代谢、蔗糖合酶活性通路等方面上。分析SUS家族基因的节律表达模式,发现BraSUSs基因中BraA10g019840.3C基因表达呈现节律性,而其余基因多在夜晚高表达。本研究结果可为大白菜SUSs基因功能解析及蔗糖代谢调控机制研究奠定理论基础。
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关键词
大白菜
蔗糖合酶
基因家族
昼夜节律表达
生物信息分析
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Keywords
Chinese cabbage
sucrose synthase
gene family
circadian rhythm expression
bioinfor maticsanalysis
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分类号
S634.1
[农业科学—蔬菜学]
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题名飞机灭鼠在林业上的应用
被引量:2
- 2
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作者
赵存玉
赵凌国
陈秀玉
肖玉凡
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机构
黑龙江省带岭林业实验局森保站
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出处
《林业科技》
北大核心
1997年第4期36-39,共4页
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文摘
飞机灭鼠在林业上的应用赵存玉赵凌国陈秀玉肖玉凡(黑龙江省带岭林业实验局森保站)飞机在农业病虫害的防治、草原灭鼠和林业播种等方面已得到广泛应用,但在林木害鼠防治方面却应用得很少。林木害鼠以其适应性强、食性杂、繁殖快和防治困难等特点,而成为当今林区影响造...
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关键词
鼠害
林木
飞机灭鼠
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分类号
S764.5
[农业科学—森林保护学]
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题名大白菜SUS基因家族鉴定与节律表达分析
- 3
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作者
肖玉凡
许脉然
秦田雨
王俊玲
王春阳
冯大领
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机构
河北农业大学河北省蔬菜种质创新与利用重点实验室/生命科学学院
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出处
《河北农业大学学报》
CAS
2024年第5期48-54,共7页
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基金
中央引导地方科技发展基金项目(236Z2903G)
大学生创新创业计划训练项目(2024183).
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文摘
植物体内的蔗糖合酶(SUS)是一种糖基转移酶,它参与调控蔗糖的合成与运输,研究大白菜SUS基因家族的表达为揭示糖代谢的分子调控机制提供了重要基础。本研究利用生物信息学方法,进行大白菜SUS基因家族成员鉴定、理化性质、系统进化关系、蛋白基序、基因结构和物种内(间)共线性分析;利用RNA-seq技术,获得SUS家族基因的相对表达量,分析大白菜SUS家族基因的节律表达模式。结果表明:大白菜中包含13个SUS基因,均含有SUS结构域;大白菜SUS基因家族可分为3个亚家族(SUSⅠ,SUSⅡ,SUSⅢ);SUSⅡ亚家族的基因motif保守基序种类最多;多数基因含有11~14个CDS序列。大白菜SUS基因家族物种内共线性分析有4对基因参与了大片段重复事件,为大白菜进化提供动力。大白菜与拟南芥的SUS基因家族物种间共线性分析,物种间共构建了13对同源基因,其中有多个“一对多,多对一”的同源基因关系,均属于SUS基因家族的基因对有10个。对SUS家族基因的KEGG和GO功能富集分析,发现富集在淀粉与蔗糖代谢、蔗糖合酶活性通路等方面上。分析SUS家族基因的节律表达模式,发现BraSUSs基因中BraA10g019840.3C基因表达呈现节律性,而其余基因多在夜晚高表达。本研究结果可为大白菜SUSs基因功能解析及蔗糖代谢调控机制研究奠定理论基础。
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关键词
大白菜
蔗糖合酶
基因家族
昼夜节律表达
生物信息分析
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Keywords
Chinese cabbage
sucrose synthase
gene family
circadian rhythm expression
bioinfor maticsanalysis
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分类号
S634.1
[农业科学—蔬菜学]
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