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桑树miR858及MYB转录因子基因在桑椹花青素合成过程中的表达分析 被引量:4
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作者 肖竞淇 陈怡 +6 位作者 谢岩 韩子琦 褚升瑞 董银星 邢炳楠 刘善正 孙志超 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期501-509,共9页
为探究桑树miR858及其靶向MYB转录因子基因调控桑椹花青素合成的分子机制,利用生物信息学、5′-RACE及qRT-PCR技术进行分析,使用在线网站预测,发现在桑树MYB基因家族中存在9个miR858靶基因,均为R2R3-MYB型基因,其中6个在降解组测序结果... 为探究桑树miR858及其靶向MYB转录因子基因调控桑椹花青素合成的分子机制,利用生物信息学、5′-RACE及qRT-PCR技术进行分析,使用在线网站预测,发现在桑树MYB基因家族中存在9个miR858靶基因,均为R2R3-MYB型基因,其中6个在降解组测序结果中能够被miR858靶向切割;5′-RACE技术对MYB5-1进行验证,发现切割位点位于与miRNA互补序列的第11至第12位碱基之间。对靶基因互补区进行分析发现miR858靶向区域为R3结构域中的T区,该区域核苷酸序列在第3、6、12、15、18位存在差异,但氨基酸序列一致,其切割位点具有保守性。运用Pearson对MYB与花青素合成关键基因表达进行相关性分析,发现MYB与花青素合成关键基因存在显著相关。qRT-PCR分析结果表明,miR858在黑、白桑椹的3个发育阶段表达上升,而MYB5-1基因在黑、白桑椹中的表达水平均呈现下降的趋势,二者呈现相反的表达趋势。由此推测,miR858可能通过抑制MYB5-1的表达从而调控桑椹花青素合成。本研究确定了桑树中MYB5-1为miR858作用的靶基因之一,分析了MYB5-1与花青素合成关键基因的相关性,从分子角度探究桑树miR858及靶基因MYB在桑椹花青素合成过程中的调控机制,为进一步探索桑椹花青素合成以及代谢过程提供相关数据支持。 展开更多
关键词 桑椹 miR858 花青素 MYB
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桑树雄花发育过程乙烯合成相关miRNA鉴定与分析 被引量:1
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作者 肖竞淇 陈怡 +3 位作者 周晓春 褚升瑞 韩子琦 孙志超 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第19期6356-6363,共8页
为鉴定桑树雄花发育过程中与乙烯合成相关的新miRNA并探究其功能,本研究利用NCBI上已有的桑树miRNA数据,筛选出与乙烯合成相关的新miRNA,并进行靶基因预测及功能注释。通过生物信息学技术共鉴定到58个新miRNA,对这些新miRNA结构分析发现... 为鉴定桑树雄花发育过程中与乙烯合成相关的新miRNA并探究其功能,本研究利用NCBI上已有的桑树miRNA数据,筛选出与乙烯合成相关的新miRNA,并进行靶基因预测及功能注释。通过生物信息学技术共鉴定到58个新miRNA,对这些新miRNA结构分析发现,首位碱基以U为主,占比为40%;长度以21 nt为居多,占比67%。对新miRNA进行靶基因预测并进行GO与KEGG分析,GO富集分析发现靶基因主要集中在乙烯激活信号通路、乙烯激活信号的负调控和乙烯反应,KEGG通路富集分析发现靶基因主要富集到代谢通路为植物激素信号转导途径和MAPK信号通路。结合降解组测序,本研究对预测到的6个新miRNA的靶基因进行靶位点分析,发现其均可作用在相应靶基因上。采用RT-qPCR技术检测新miRNA在桑树雄花不同发育阶段的表达水平,发现mno-miRn69-5p随着雄花发育表达呈现下降的趋势,而保守mno-miR172表达呈现上升的趋势。mno-miRn204-3p与mno-miRn138-3p的表达在未分化期到雄花分化初期上升,在雄花分化初期到总苞形成期则下降。mno-miRn211-5p与mno-miRn227-5p的表达在未分化期到花序分化期表达水平上升,在花序分化期到总苞形成期则表达水平下降,表明这些新的miRNA在桑树雄花发育过程中发挥着不同的作用。本研究为揭示桑树中miRNA在调控乙烯合成途径提供理论基础。 展开更多
关键词 桑树 乙烯 MIRNA 靶基因 RT-QPCR
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不同制备条件及贮存温度对四种桑树花粉活力影响 被引量:1
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作者 陈怡 肖竞淇 +4 位作者 褚升瑞 董银星 邢炳楠 姜楠 孙志超 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第7期2403-2408,共6页
为探究不同处理条件对桑树花粉活力的影响,本研究以‘冀桑2号’、‘华桑’、‘路杨’及‘物45’四个桑树品种为研究对象,采用碘-碘化钾(I2-KI)法测定花粉活力,观察其在不同制备条件(制备温度:19℃、25℃和32℃;制备时间:1 d和7 d)、不... 为探究不同处理条件对桑树花粉活力的影响,本研究以‘冀桑2号’、‘华桑’、‘路杨’及‘物45’四个桑树品种为研究对象,采用碘-碘化钾(I2-KI)法测定花粉活力,观察其在不同制备条件(制备温度:19℃、25℃和32℃;制备时间:1 d和7 d)、不同贮存温度(-80℃,-20℃和4℃)下的活力。实验表明,不同的制备条件和贮存温度对四个桑树品种的花粉活力均存在影响,在不同温度制备条件下,‘冀桑2号’与‘路杨’在25℃培养条件下,花粉活力最高,‘华桑’与‘物45’在19℃培养条件下,花粉活力最高;在相同的培养温度下,同一品种培养7 d的活力低于培养1 d的活力,其中19℃培养条件下的‘华桑’花粉活力最高为95.26%。四个桑树品种花粉的生活力在经过贮存一定时间后,与制备后的初始活力相比均存在不同程度的活力的下降;四个桑树品种在不同贮存温度条件下,随着储藏温度越低,花粉保存活力越高,在-80℃储藏60 d后,‘华桑’有活力的花粉最高为87.4%。综上所述,‘华桑’花粉在19℃温度下制作及-80℃保存处理后,花粉活力最高。本研究探索桑花粉的制备与贮存条件,有助于解决因气候、地域不同对杂交带来的影响,为桑树杂交育种以及生产实践以供参考依据。 展开更多
关键词 桑树 花粉 生活力 制作条件 贮存温度
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3个桑树品种花粉与叶、皮、花序的蛋白质、氨基酸含量及热值比较 被引量:1
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作者 邢炳媛 郭新淼 +3 位作者 潘欣然 肖竞淇 陈怡 孙志超 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第1期285-290,共6页
为研究桑树花粉产量及各组织部位蛋白质、氨基酸含量及热值情况,本研究以3个桑树品种(‘冀桑2号’,‘辽鲁6号’,‘河北华桑’)为研究对象,测定并分析3个桑树品种最佳产粉条件及花粉产量,比较其花粉、花序、叶、皮蛋白质、氨基酸含量和... 为研究桑树花粉产量及各组织部位蛋白质、氨基酸含量及热值情况,本研究以3个桑树品种(‘冀桑2号’,‘辽鲁6号’,‘河北华桑’)为研究对象,测定并分析3个桑树品种最佳产粉条件及花粉产量,比较其花粉、花序、叶、皮蛋白质、氨基酸含量和热值。研究结果表明,22℃45%RH为‘鲁6’最佳产粉条件,32℃45%RH为‘冀桑2号’,‘河北华桑’最佳产粉条件,且‘河北华桑’产粉量最高为1.687 g/100 g;3个桑树品种不同组织部位之间蛋白质含量中,‘冀桑2号’花粉含量最高,达到1 531.94 mg/L;在热值测量中,‘冀桑2号’花粉的热值为最高,达20 168 J/g;3个桑树品种不同组织部位氨基酸总含量中,‘冀桑2号’花粉最为丰富,为64.030 mg/g。本研究为桑花粉的开发利用提供了理论基础。 展开更多
关键词 桑树 花粉 蛋白质 氨基酸 热值
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