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牦牛FSHB基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
胡双阁
王琴
+1 位作者
李恒
字向东
《中国草食动物科学》
CAS
2021年第1期1-7,共7页
通过PCR技术以及生物信息学软件,对牦牛FSHB基因进行克隆和生物信息学分析。结果表明:牦牛FSHB基因的c DNA序列区长645 bp,编码的氨基酸129个;同源性和分子进化树分析结果显示,其CDS区碱基序列与普通牛的关系最近,然后依次是水牛、山羊...
通过PCR技术以及生物信息学软件,对牦牛FSHB基因进行克隆和生物信息学分析。结果表明:牦牛FSHB基因的c DNA序列区长645 bp,编码的氨基酸129个;同源性和分子进化树分析结果显示,其CDS区碱基序列与普通牛的关系最近,然后依次是水牛、山羊、绵羊、梅花鹿、马、人和小家鼠。牦牛FSHB蛋白的分子量14683,分子式C637H978N170O193S18,等电点6.27,总原子数1996,半衰期估计30 h,不稳定指数45.8,脂肪指数61.9;该蛋白属于非跨膜蛋白,α螺旋、延伸链、β转角和无规卷曲分别为30、29、6和64个,所占的比例分别为23.26%、22.48%、4.65%和49.61%。该基因编码的氨基酸在第18位点和第19位点可能存在信号肽。该研究探明牦牛FSHB基因与其他种属的差异,为进一步研究牦牛FSHB基因结构、功能及其与繁殖功能的关系提供了理论基础。
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关键词
牦牛
FSHB
克隆
序列分析
进化树
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职称材料
牦牛NGF基因克隆及其在生殖器官中的表达定位
被引量:
2
2
作者
邬建飞
刘宇
+5 位作者
马瑶
蒋旭东
胡双阁
龚三你
字向东
卢建远
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期778-790,共13页
旨在探究NGF基因的生物学特性及其在母牦牛生殖器官中的表达特性。本研究收集黄体期母牦牛的心、肝、脾、肺、肾以及胎牛期、卵泡期、黄体期、妊娠期母牦牛的卵巢、子宫和输卵管(n=3),利用RT-PCR克隆牦牛NGF基因,并对其序列进行生物信...
旨在探究NGF基因的生物学特性及其在母牦牛生殖器官中的表达特性。本研究收集黄体期母牦牛的心、肝、脾、肺、肾以及胎牛期、卵泡期、黄体期、妊娠期母牦牛的卵巢、子宫和输卵管(n=3),利用RT-PCR克隆牦牛NGF基因,并对其序列进行生物信息学分析,利用RT-qPCR技术分析NGF基因的组织表达特性,利用免疫组化技术(IHC)定位NGF蛋白在牦牛生殖器官中的表达分布。结果显示,牦牛NGF基因CDS区全长为726 bp,共编码241个氨基酸,编码的蛋白质属于碱性不稳定亲水蛋白;NGF氨基酸系统进化树结果显示,牦牛首先与黄牛聚为一类,与其他物种的同源性均高于87%,说明该基因在进化过程中表现出高度保守性。RT-qPCR结果显示,牦牛NGF基因在卵巢中的表达量极显著高于心、肝、肾、脾、肺、子宫和输卵管(P<0.01)。黄体期卵巢中NGF的相对表达量最高,极显著高于胎牛期、卵泡期和妊娠期(P<0.01);妊娠期子宫NGF相对表达量较高,显著高于胎牛期和卵泡期(P<0.05);各时期输卵管的NGF mRNA表达差异不显著。IHC结果显示,NGF蛋白主要在牦牛卵泡的颗粒细胞和卵巢上皮层细胞中表达,且在颗粒层细胞表达最高;在子宫内膜和输卵管的黏膜上皮细胞也有表达。综上,牦牛NGF基因序列在进化过程中较为保守,在卵巢中表达量较高,可能在维持母牦牛卵巢机能和妊娠以及促进黄体功能方面发挥重要的调控作用。
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关键词
牦牛
NGF基因
卵巢
组织表达
免疫组化
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职称材料
牦牛FGG组织表达与雌性生殖器官中定位分析
被引量:
2
3
作者
蒋旭东
刘宇
+3 位作者
邬建飞
胡双阁
卢建远
字向东
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期286-294,共9页
旨在克隆获得牦牛纤维蛋白原γ链(FGG)基因,明确其在组织中的表达特性,探讨FGG对母牦牛繁殖的影响。采集母牦牛的心、肝、脾、肺、卵巢、输卵管和子宫等组织样以及颗粒细胞,利用RT-PCR克隆FGG基因并利用RT-qPCR和免疫组化检测其组织表...
旨在克隆获得牦牛纤维蛋白原γ链(FGG)基因,明确其在组织中的表达特性,探讨FGG对母牦牛繁殖的影响。采集母牦牛的心、肝、脾、肺、卵巢、输卵管和子宫等组织样以及颗粒细胞,利用RT-PCR克隆FGG基因并利用RT-qPCR和免疫组化检测其组织表达。获得到牦牛FGG基因cDNA序列,编码区全长1 332 bp,编码443个氨基酸,FGG蛋白属于酸性亲水稳定蛋白。FGG基因核苷酸序列进化树显示牦牛先与黄牛聚为一类。RT-qPCR显示FGG基因在检测的7个组织均有表达,肝脏表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05);在卵泡不同发育阶段的颗粒细胞中均有表达,且大卵泡颗粒细胞表达量最高,显著高于其他发育阶段(P<0.05);妊娠期卵巢和子宫中表达量显著高于空怀期(P<0.05)。IHC显示FGG蛋白主要在卵巢颗粒细胞、卵泡腔、输卵管黏膜和子宫内膜中表达。牦牛FGG基因在物种间具有较高的保守性,组织表达广泛,可能在牦牛繁殖调控中发挥着重要作用。
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关键词
牦牛
纤维蛋白原γ链
表达特性
荧光定量PCR
免疫组化
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职称材料
牦牛ATF4基因组织表达与雌性生殖器官中定位分析
被引量:
2
4
作者
蒋旭东
邬建飞
+5 位作者
刘宇
胡双阁
马瑶
龚三你
卢建远
字向东
《西南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2022年第2期125-134,共10页
旨在克隆牦牛转录激活因子4(ATF4)基因,并检测其在不同组织的表达及雌性生殖器官中定位分析,探索ATF4在母牦牛繁殖的影响.以牦牛为实验对象,利用RT-PCR克隆得到牦牛ATF4基因CDS序列,生物信息学分析牦牛CDS区,RT-qPCR检测ATF4基因在牦牛...
旨在克隆牦牛转录激活因子4(ATF4)基因,并检测其在不同组织的表达及雌性生殖器官中定位分析,探索ATF4在母牦牛繁殖的影响.以牦牛为实验对象,利用RT-PCR克隆得到牦牛ATF4基因CDS序列,生物信息学分析牦牛CDS区,RT-qPCR检测ATF4基因在牦牛不同组织中的表达模式,免疫组化(IHC)分析ATF4蛋白在雌性生殖器官中定位.结果表明,获得到牦牛ATF4基因cDNA序列,编码区全长1 047 bp,编码348个氨基酸,ATF4蛋白属于酸性亲水不稳定蛋白.RT-qPCR显示,ATF4基因在检测的8个组织中均有表达,在子宫和卵巢的表达量显著高于其它组织(P<0.05);妊娠期子宫、卵巢和输卵管中ATF4基因的表达量显著高于空怀期(P<0.05).IHC显示ATF4蛋白主要在牦牛卵巢的颗粒细胞、卵泡液、输卵管黏膜上皮、子宫内膜和子宫基质细胞中表达.这些结果说明ATF4基因在动物进化中比较保守,组织表达广泛,并在子宫和卵巢高表达,可能在牦牛繁殖调控中发挥重要作用.
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关键词
牦牛
ATF4基因
基因克隆
实时定量PCR
免疫组化
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职称材料
题名
牦牛FSHB基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
胡双阁
王琴
李恒
字向东
机构
西南民族大学畜牧兽医学院
出处
《中国草食动物科学》
CAS
2021年第1期1-7,共7页
基金
中央高校基本科研业务费专项资金项目(2015NZYTD02)。
文摘
通过PCR技术以及生物信息学软件,对牦牛FSHB基因进行克隆和生物信息学分析。结果表明:牦牛FSHB基因的c DNA序列区长645 bp,编码的氨基酸129个;同源性和分子进化树分析结果显示,其CDS区碱基序列与普通牛的关系最近,然后依次是水牛、山羊、绵羊、梅花鹿、马、人和小家鼠。牦牛FSHB蛋白的分子量14683,分子式C637H978N170O193S18,等电点6.27,总原子数1996,半衰期估计30 h,不稳定指数45.8,脂肪指数61.9;该蛋白属于非跨膜蛋白,α螺旋、延伸链、β转角和无规卷曲分别为30、29、6和64个,所占的比例分别为23.26%、22.48%、4.65%和49.61%。该基因编码的氨基酸在第18位点和第19位点可能存在信号肽。该研究探明牦牛FSHB基因与其他种属的差异,为进一步研究牦牛FSHB基因结构、功能及其与繁殖功能的关系提供了理论基础。
关键词
牦牛
FSHB
克隆
序列分析
进化树
Keywords
yak
FSHB
cloning
sequence analysis
phylogenetic tree
分类号
S823.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
牦牛NGF基因克隆及其在生殖器官中的表达定位
被引量:
2
2
作者
邬建飞
刘宇
马瑶
蒋旭东
胡双阁
龚三你
字向东
卢建远
机构
西南民族大学动物科学国家民委重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期778-790,共13页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFD0502303)
西南民族大学中央高校基本科研业务专项(2021PTJS26)。
文摘
旨在探究NGF基因的生物学特性及其在母牦牛生殖器官中的表达特性。本研究收集黄体期母牦牛的心、肝、脾、肺、肾以及胎牛期、卵泡期、黄体期、妊娠期母牦牛的卵巢、子宫和输卵管(n=3),利用RT-PCR克隆牦牛NGF基因,并对其序列进行生物信息学分析,利用RT-qPCR技术分析NGF基因的组织表达特性,利用免疫组化技术(IHC)定位NGF蛋白在牦牛生殖器官中的表达分布。结果显示,牦牛NGF基因CDS区全长为726 bp,共编码241个氨基酸,编码的蛋白质属于碱性不稳定亲水蛋白;NGF氨基酸系统进化树结果显示,牦牛首先与黄牛聚为一类,与其他物种的同源性均高于87%,说明该基因在进化过程中表现出高度保守性。RT-qPCR结果显示,牦牛NGF基因在卵巢中的表达量极显著高于心、肝、肾、脾、肺、子宫和输卵管(P<0.01)。黄体期卵巢中NGF的相对表达量最高,极显著高于胎牛期、卵泡期和妊娠期(P<0.01);妊娠期子宫NGF相对表达量较高,显著高于胎牛期和卵泡期(P<0.05);各时期输卵管的NGF mRNA表达差异不显著。IHC结果显示,NGF蛋白主要在牦牛卵泡的颗粒细胞和卵巢上皮层细胞中表达,且在颗粒层细胞表达最高;在子宫内膜和输卵管的黏膜上皮细胞也有表达。综上,牦牛NGF基因序列在进化过程中较为保守,在卵巢中表达量较高,可能在维持母牦牛卵巢机能和妊娠以及促进黄体功能方面发挥重要的调控作用。
关键词
牦牛
NGF基因
卵巢
组织表达
免疫组化
Keywords
yak
nerve growth factor-β(NGF)gene
ovary
tissue expression
immunohistochemistry
分类号
S823.85 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
牦牛FGG组织表达与雌性生殖器官中定位分析
被引量:
2
3
作者
蒋旭东
刘宇
邬建飞
胡双阁
卢建远
字向东
机构
西南民族大学动物科学国家民委重点实验室
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第11期286-294,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFD0502303)
西南民族大学中央高校基本科研业务专项(2021PTJS26)。
文摘
旨在克隆获得牦牛纤维蛋白原γ链(FGG)基因,明确其在组织中的表达特性,探讨FGG对母牦牛繁殖的影响。采集母牦牛的心、肝、脾、肺、卵巢、输卵管和子宫等组织样以及颗粒细胞,利用RT-PCR克隆FGG基因并利用RT-qPCR和免疫组化检测其组织表达。获得到牦牛FGG基因cDNA序列,编码区全长1 332 bp,编码443个氨基酸,FGG蛋白属于酸性亲水稳定蛋白。FGG基因核苷酸序列进化树显示牦牛先与黄牛聚为一类。RT-qPCR显示FGG基因在检测的7个组织均有表达,肝脏表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05);在卵泡不同发育阶段的颗粒细胞中均有表达,且大卵泡颗粒细胞表达量最高,显著高于其他发育阶段(P<0.05);妊娠期卵巢和子宫中表达量显著高于空怀期(P<0.05)。IHC显示FGG蛋白主要在卵巢颗粒细胞、卵泡腔、输卵管黏膜和子宫内膜中表达。牦牛FGG基因在物种间具有较高的保守性,组织表达广泛,可能在牦牛繁殖调控中发挥着重要作用。
关键词
牦牛
纤维蛋白原γ链
表达特性
荧光定量PCR
免疫组化
Keywords
Bos grunniens
fibrinogen gamma chain
expression characteristics
RT-qPCR
immunocytochemistry
分类号
S823.85 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
牦牛ATF4基因组织表达与雌性生殖器官中定位分析
被引量:
2
4
作者
蒋旭东
邬建飞
刘宇
胡双阁
马瑶
龚三你
卢建远
字向东
机构
西南民族大学动物科学国家民委重点实验室
出处
《西南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2022年第2期125-134,共10页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFD0502303)
西南民族大学中央高校基本科研业务专项资金项目(2021PTJS26)。
文摘
旨在克隆牦牛转录激活因子4(ATF4)基因,并检测其在不同组织的表达及雌性生殖器官中定位分析,探索ATF4在母牦牛繁殖的影响.以牦牛为实验对象,利用RT-PCR克隆得到牦牛ATF4基因CDS序列,生物信息学分析牦牛CDS区,RT-qPCR检测ATF4基因在牦牛不同组织中的表达模式,免疫组化(IHC)分析ATF4蛋白在雌性生殖器官中定位.结果表明,获得到牦牛ATF4基因cDNA序列,编码区全长1 047 bp,编码348个氨基酸,ATF4蛋白属于酸性亲水不稳定蛋白.RT-qPCR显示,ATF4基因在检测的8个组织中均有表达,在子宫和卵巢的表达量显著高于其它组织(P<0.05);妊娠期子宫、卵巢和输卵管中ATF4基因的表达量显著高于空怀期(P<0.05).IHC显示ATF4蛋白主要在牦牛卵巢的颗粒细胞、卵泡液、输卵管黏膜上皮、子宫内膜和子宫基质细胞中表达.这些结果说明ATF4基因在动物进化中比较保守,组织表达广泛,并在子宫和卵巢高表达,可能在牦牛繁殖调控中发挥重要作用.
关键词
牦牛
ATF4基因
基因克隆
实时定量PCR
免疫组化
Keywords
yak
ATF4 gene
gene cloning
RT-qPCR
immunohistochemistry
分类号
S823.85 [农业科学—畜牧学]
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题名
作者
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1
牦牛FSHB基因的克隆及生物信息学分析
胡双阁
王琴
李恒
字向东
《中国草食动物科学》
CAS
2021
1
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职称材料
2
牦牛NGF基因克隆及其在生殖器官中的表达定位
邬建飞
刘宇
马瑶
蒋旭东
胡双阁
龚三你
字向东
卢建远
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
下载PDF
职称材料
3
牦牛FGG组织表达与雌性生殖器官中定位分析
蒋旭东
刘宇
邬建飞
胡双阁
卢建远
字向东
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
下载PDF
职称材料
4
牦牛ATF4基因组织表达与雌性生殖器官中定位分析
蒋旭东
邬建飞
刘宇
胡双阁
马瑶
龚三你
卢建远
字向东
《西南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2022
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