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龟裂链霉菌M527荧光定量PCR内参基因的选择及其稳定性评估
1
作者
徐洁
胡叶锋
+2 位作者
廖芷君
马正
俞晓平
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2020年第3期429-436,共8页
龟裂链霉菌Streptomyces rimosus M527是龟裂霉素(rimocidin)的生产菌,其对多种植物病原真菌具有较强的拮抗作用。为从转录水平分析菌株M527以及其抗性突变株中龟裂霉素的合成调控机制,荧光定量PCR内参基因的选择与稳定性评估显得尤为...
龟裂链霉菌Streptomyces rimosus M527是龟裂霉素(rimocidin)的生产菌,其对多种植物病原真菌具有较强的拮抗作用。为从转录水平分析菌株M527以及其抗性突变株中龟裂霉素的合成调控机制,荧光定量PCR内参基因的选择与稳定性评估显得尤为重要。本研究选用16SrRNAsr、hrd Bsr、rpoAsr、sigFsr、sigBsr、gyrBsr这6个基因作为候选内参基因,使用geNorm、NormFinder、BestKeeper三个软件分析在野生型龟裂链霉菌M527、高产龟裂霉素抗性突变株M527-GR7和低产龟裂霉素抗性突变株M527-GR21中候选内参基因的稳定性,筛选出稳定性最高的内参基因。结果显示,sigBsr基因在菌株M527及抗性突变株M527-GR7和M527-GR21中表达稳定性最好。通过以基因sigBsr、16S rRNAsr、rpoAsr为内参基因,检测龟裂霉素生物合成基因簇中的结构基因rim Gsr在菌株M527-GR7中不同时间的相对表达量,发现基因sigBsr作为内参基因时能得到更准确的结果。
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关键词
龟裂链霉菌M527
荧光定量PCR
内参基因
稳定性
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题名
龟裂链霉菌M527荧光定量PCR内参基因的选择及其稳定性评估
1
作者
徐洁
胡叶锋
廖芷君
马正
俞晓平
机构
中国计量大学生命科学学院/浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室
出处
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2020年第3期429-436,共8页
基金
国家自然科学基金(31772213,31972320)
浙江省杰出青年基金(LR17C140002)。
文摘
龟裂链霉菌Streptomyces rimosus M527是龟裂霉素(rimocidin)的生产菌,其对多种植物病原真菌具有较强的拮抗作用。为从转录水平分析菌株M527以及其抗性突变株中龟裂霉素的合成调控机制,荧光定量PCR内参基因的选择与稳定性评估显得尤为重要。本研究选用16SrRNAsr、hrd Bsr、rpoAsr、sigFsr、sigBsr、gyrBsr这6个基因作为候选内参基因,使用geNorm、NormFinder、BestKeeper三个软件分析在野生型龟裂链霉菌M527、高产龟裂霉素抗性突变株M527-GR7和低产龟裂霉素抗性突变株M527-GR21中候选内参基因的稳定性,筛选出稳定性最高的内参基因。结果显示,sigBsr基因在菌株M527及抗性突变株M527-GR7和M527-GR21中表达稳定性最好。通过以基因sigBsr、16S rRNAsr、rpoAsr为内参基因,检测龟裂霉素生物合成基因簇中的结构基因rim Gsr在菌株M527-GR7中不同时间的相对表达量,发现基因sigBsr作为内参基因时能得到更准确的结果。
关键词
龟裂链霉菌M527
荧光定量PCR
内参基因
稳定性
Keywords
Streptomyces rimosus M527
real-time quantitative PCR
internal reference genes
stability
分类号
S467 [农业科学—植物保护]
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作者
出处
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被引量
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1
龟裂链霉菌M527荧光定量PCR内参基因的选择及其稳定性评估
徐洁
胡叶锋
廖芷君
马正
俞晓平
《中国生物防治学报》
CSCD
北大核心
2020
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