2006～2008年华东地区新城疫病毒HN基因序列分析

为研究新城疫病毒（Newcastle disease virus，NDV）的HN（血凝素-神经氨酸酶，hemagglutinin—neuraminidase）基因分子流行病学规律，利用RT—PCR扩增了2006～2008年间分离自我国华东地区的43株NDV的HN基因片段。基因序列分析显示，分离株中基因Ⅰ型2株，基因Ⅱ型3株，基因Ⅵ型1株，其它37株都属于基因Ⅶd亚型。根据遗传发生进化树可将基因Ⅶd亚型进一步分为Ⅶd1和Ⅶd2两个亚型，基因Ⅶd1亚型HN蛋白的第102、118、443位氨基酸分别为T，A和T，而基因Ⅶd2亚型则分别为I，E和M。另外，研究表明HN蛋白线性表位发生E347K突变的变异株的分离率在我国呈上升趋势。