高通量测序分析吉西他滨化疗耐药复发性膀胱癌的核心基因

目的:通过生物信息学方法探讨膀胱癌吉西他滨化疗耐药机制,寻找导致耐药发生的核心基因。方法:通过高通量测序技术筛选差异基因(differentially expressed genes,DEGs),利用GSEA软件获得KEEG信号通路及GO富集分析结果。STRING数据库构建蛋白互作网络,筛选前10位核心基因(高度连接基因)。从筛选的基因中通过Cyto-Hubba插件运用4种不同算法制成蛋白交互韦恩图,筛选出关键核心基因。结果:测序显示DEGs为1157个,上调基因281个,下调基因876个。GO富集分析表明DEGs主要参与了肌系统过程、肌细胞收缩、细胞核分裂等生物学过程。KEEG分析DEGs主要参与的信号通路包括细胞周期、cGMP-PKG、肌肉平滑肌收缩等通路。蛋白-蛋白互作网(PPI network)细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子(cyclin-dependent kinase 1,CDK1)为最核心基因。结论:CDK1可能作为一种调控吉西他滨耐药机制的重要靶基因,可为探究膀胱癌吉西他滨耐药的发病机制、特异性靶点及新靶向药物研发提供理论基础及方向。

FKBP脯氨酰异构酶1010、Ⅰ型胶原蛋白型胶原蛋白α1链在肾癌组织中的表达及预后影响因素分析

目的 探讨FKBP脯氨酰异构酶10(FKBP10)、Ⅰ型胶原蛋白α1链(COL1A1)在肾癌组织中的表达及预后影响因素。方法 选取65例肾癌患者,采用定量聚合酶链反应(qPCR)法检测肾癌组织中FKBP10、COL1A1 mRNA表达水平,根据随访结果分为预后良好组和预后不良组,比较两组患者的FKBP10、COL1A1 mRNA表达水平;肾癌患者预后不良的影响因素采用Cox回归模型分析。结果 随访1年,65例肾癌患者中,预后不良20例,预后良好45例。预后不良组肾癌患者肾癌组织中FKBP10、COL1A1 mRNA表达水平均明显高于预后良好组,差异均有统计学意义(P﹤0.01)。单因素分析结果显示,肿瘤大小、TNM分期、病理类型、FKBP10表达情况、COL1A1表达情况均可能是肾癌患者预后不良的影响因素(P﹤0.05);多因素分析结果显示,FKBP10、COL1A1高表达均是肾癌患者预后不良的独立危险因素(P﹤0.05)。结论 FKBP10、COL1A1高表达与肾癌患者的预后不良有关,且均是肾癌患者预后不良的独立危险因素。