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iRSC-PseAAC:基于有效降维算法LDA预测蛋白质中的氧化还原敏感半胱氨酸位点
1
作者
魏欣
刘春生
+3 位作者
吕哲
林刚
胡思亲
贾建华
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1009-1016,共8页
氧化还原敏感半胱氨酸(RSC)硫醇参与了许多生物过程,并发挥着重要作用。因此,有必要对氧化还原敏感半胱氨酸进行准确鉴定。然而,传统的氧化还原敏感半胱氨酸鉴定非常昂贵且耗时。目前,迫切需要一种数学计算方法来识别序列信息,快速准确...
氧化还原敏感半胱氨酸(RSC)硫醇参与了许多生物过程,并发挥着重要作用。因此,有必要对氧化还原敏感半胱氨酸进行准确鉴定。然而,传统的氧化还原敏感半胱氨酸鉴定非常昂贵且耗时。目前,迫切需要一种数学计算方法来识别序列信息,快速准确地鉴定出氧化还原敏感半胱氨酸。在此,我们开发了一种名为iRSC-PseAAC的有效预测器,它采用降维算法LDA结合支持向量机来预测氧化还原敏感半胱氨酸位点。在交叉验证中,特异性(Sp)、灵敏性(Sn)、准确性(Acc)和马修斯相关系数(MCC)的结果分别为0.841、0.868、0.859和0.692。在独立数据集的结果中,特异性(Sp)、灵敏性(Sn)、准确性(Acc)和马修斯相关系数(MCC)分别为0.906、0.882、0.890和0.767。与现有的预测方法相比,iRSC-PseAAC具有明显的改进效果。本研究提出的方法还可用于计算蛋白质组学中的许多问题。
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关键词
氧化还原敏感半胱氨酸
特征提取
词嵌入
线性判别分析
机器学习
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职称材料
一种强反射表面高光去除方法
2
作者
林刚
魏欣
+2 位作者
吕哲
余志坚
胡思亲
《电脑知识与技术》
2024年第8期20-23,34,共5页
针对陶瓷、塑料和玻璃等材质在较为复杂的曲面形状下容易产生多区域、大面积的过饱和高光反射以及光照不均等现象,传统基于局部区域的高光去除方法存在工作量大且效果不佳的问题,难以达到预期目标。因此,本文提出一种基于多角度光源采...
针对陶瓷、塑料和玻璃等材质在较为复杂的曲面形状下容易产生多区域、大面积的过饱和高光反射以及光照不均等现象,传统基于局部区域的高光去除方法存在工作量大且效果不佳的问题,难以达到预期目标。因此,本文提出一种基于多角度光源采集的多幅图像,结合整体图像融合和同态滤波方法,实现高光图像整体去除,极大缓解光照不均的问题,提高图像整体质量。为了验证此方法的普适性和鲁棒性,使用此方法分别对手机外壳、矿泉水瓶、塑料袋、金属零件、玻璃瓶和陶瓷盘等六种不同材质或空间形状进行高光去除实验。实验结果表明,本文提出的高光去除方法能有效去除图像的所有高光区域,显著缓解图像光照不均问题,增强图像对比度,特别是对存在大面积高光或暗影区域的图像的质量改善具有显著作用。
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关键词
高光去除
图像融合
同态滤波
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职称材料
题名
iRSC-PseAAC:基于有效降维算法LDA预测蛋白质中的氧化还原敏感半胱氨酸位点
1
作者
魏欣
刘春生
吕哲
林刚
胡思亲
贾建华
机构
江西服装学院商学院数理统计教研室
江西服装学院商学院智慧物流教研室
江西服装学院大数据学院信息工程教研室
江西服装学院大数据学院数据科学教研室
景德镇陶瓷大学信息工程学院生物信息研究室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1009-1016,共8页
基金
国家自然科学基金项目(No.61761023)
江西省自然科学基金项目(No.20202BABL202004)
江西省教育厅科研项目(No.GJJ212419,No.GJJ2202814,No.GJJ2202813)资助。
文摘
氧化还原敏感半胱氨酸(RSC)硫醇参与了许多生物过程,并发挥着重要作用。因此,有必要对氧化还原敏感半胱氨酸进行准确鉴定。然而,传统的氧化还原敏感半胱氨酸鉴定非常昂贵且耗时。目前,迫切需要一种数学计算方法来识别序列信息,快速准确地鉴定出氧化还原敏感半胱氨酸。在此,我们开发了一种名为iRSC-PseAAC的有效预测器,它采用降维算法LDA结合支持向量机来预测氧化还原敏感半胱氨酸位点。在交叉验证中,特异性(Sp)、灵敏性(Sn)、准确性(Acc)和马修斯相关系数(MCC)的结果分别为0.841、0.868、0.859和0.692。在独立数据集的结果中,特异性(Sp)、灵敏性(Sn)、准确性(Acc)和马修斯相关系数(MCC)分别为0.906、0.882、0.890和0.767。与现有的预测方法相比,iRSC-PseAAC具有明显的改进效果。本研究提出的方法还可用于计算蛋白质组学中的许多问题。
关键词
氧化还原敏感半胱氨酸
特征提取
词嵌入
线性判别分析
机器学习
Keywords
redox-sensitive cysteine(RSC)
feature extraction
word embedding
linear discriminant analysis
machine learning
分类号
Q754 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
一种强反射表面高光去除方法
2
作者
林刚
魏欣
吕哲
余志坚
胡思亲
机构
江西服装学院大数据学院
出处
《电脑知识与技术》
2024年第8期20-23,34,共5页
基金
江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ2202814,GJJ212419)资助。
文摘
针对陶瓷、塑料和玻璃等材质在较为复杂的曲面形状下容易产生多区域、大面积的过饱和高光反射以及光照不均等现象,传统基于局部区域的高光去除方法存在工作量大且效果不佳的问题,难以达到预期目标。因此,本文提出一种基于多角度光源采集的多幅图像,结合整体图像融合和同态滤波方法,实现高光图像整体去除,极大缓解光照不均的问题,提高图像整体质量。为了验证此方法的普适性和鲁棒性,使用此方法分别对手机外壳、矿泉水瓶、塑料袋、金属零件、玻璃瓶和陶瓷盘等六种不同材质或空间形状进行高光去除实验。实验结果表明,本文提出的高光去除方法能有效去除图像的所有高光区域,显著缓解图像光照不均问题,增强图像对比度,特别是对存在大面积高光或暗影区域的图像的质量改善具有显著作用。
关键词
高光去除
图像融合
同态滤波
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
iRSC-PseAAC:基于有效降维算法LDA预测蛋白质中的氧化还原敏感半胱氨酸位点
魏欣
刘春生
吕哲
林刚
胡思亲
贾建华
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
一种强反射表面高光去除方法
林刚
魏欣
吕哲
余志坚
胡思亲
《电脑知识与技术》
2024
0
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职称材料
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