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PGC-1α敲降对斑马鱼细胞冷应激过程的影响
被引量:
3
1
作者
胡成枫
王晓煜
陈良标
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期4422-4429,共8页
过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator activated receptorγ,PPARγ)辅助激活因子1α(PPARγcoactivator-1α,PGC-1α)作为一个重要的转录激活因子,参与多种生理活动的调节。本研究探究了PGC-1α在斑马鱼(Danio rerio...
过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator activated receptorγ,PPARγ)辅助激活因子1α(PPARγcoactivator-1α,PGC-1α)作为一个重要的转录激活因子,参与多种生理活动的调节。本研究探究了PGC-1α在斑马鱼(Danio rerio)ZF4细胞(胚胎发育3 d成纤维样细胞)冷应激过程中所起的作用。通过慢病毒质粒转染干扰PGC-1α基因的表达,并用嘌呤霉素筛选得到稳转细胞系,给与其18℃7 d和10℃7 d的低温刺激后使用CM-H2DCFDA探针染色,通过流式细胞仪检测细胞内活性氧(reactive oxygen species,ROS)含量;JC-1探针染色,流式细胞仪检测低温处理后PGC-1α敲降的细胞线粒体膜电位的变化。研究表明,在低温刺激下,PGC-1α基因未敲降的ZF4细胞内ROS含量升高,线粒体膜电位下降;而在PGC-1α基因敲降的ZF4细胞内,ROS含量在前者的水平上进一步升高,线粒体膜电位的下降也加剧,故PGC-1α在ZF4细胞冷应激过程中对细胞起到保护作用,能维持细胞内ROS含量和线粒体膜电位水平。本研究对PGC-1α基因在斑马鱼ZF4细胞冷应激过程中所起的功能进行初步探究,为鱼类在低温下的适应性研究提供依据。
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关键词
PGC-1Α
ZF4
细胞
低温刺激
ROS
线粒体膜电位
原文传递
罗氏沼虾亲虾越冬池中不同基质上微生物群落多样性分析
被引量:
3
2
作者
谢芹
江敏
+7 位作者
胡成枫
张健龙
王城峰
童晓岚
顾德平
胡伟国
于忠利
戴习林
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期336-347,共12页
【目的】了解罗氏沼虾亲虾越冬时循环养殖系统对水质的调控效果,探明其中微生物群落的作用。【方法】采集循环养殖系统运行88 d后的越冬池池水、池中人工水草(普通纤维膜)以及外置式生物滤器中的纳米纤维膜等3种不同基质上的微生物,利用...
【目的】了解罗氏沼虾亲虾越冬时循环养殖系统对水质的调控效果,探明其中微生物群落的作用。【方法】采集循环养殖系统运行88 d后的越冬池池水、池中人工水草(普通纤维膜)以及外置式生物滤器中的纳米纤维膜等3种不同基质上的微生物,利用DNA抽提、PCR扩增和定量以及高通量Mi Seq测序技术等对3种不同基质上的微生物进行16S r RNA基因序列V4-V5区的测定和分析,并根据测序得到的双端测序读长(Pair-end reads)进行质量控制和过滤,之后进行操作分类单元(OTU)聚类分析,并基于OTU对微生物群落的多样性指数和群落结构进行分析;每3-4 d对越冬池池水水质进行监测。【结果】养殖池塘的水质保持在良好的状态,其中氨氮和亚硝氮浓度控制在0.17±0.08 mg/L和0.28±0.15 mg/L;不同基质上的微生物组成和多样性都不相同。在3种基质上共检测并鉴定出细菌64种,隶属于9门64属,包括变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)、酸杆菌门(Acidobacteria)和绿菌门(Chlorobi)。从属水平上对3种基质上的细菌进行分析,发现养殖池水中含量最高的为丛毛单菌科下的一个未分类类群(Comamonadaceae_unclassified),其也是3种基质的共有优势类群;普通纤维膜上为Inhella,纳米纤维膜上则是小纺锤状菌属(Fusibacter)。3种基质上细菌群落多样性顺序为:纳米纤维膜>普通纤维膜>养殖池水。通过对亲虾越冬养殖全过程的水质监测,发现越冬期间亲虾池水质始终保持在良好状态,并且在循环水系统开启约40 d后水质达到了相对稳定的状态。【结论】通过在育苗池中悬挂人工水草,配合内含纳米纤维膜的外置式生物滤器,可使罗氏沼虾越冬亲虾池保持良好的水质。随着新型材料科学的发展,开发出适用于水产养殖业的滤料很有必要。
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关键词
生物膜
高通量测序
微生物群落多样性
罗氏沼虾
水质
原文传递
自噬在细胞冷应激中的作用研究
被引量:
5
3
作者
胡春兰
陈良标
+1 位作者
胡成枫
韩兵社
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2016年第9期1077-1083,共7页
有研究证明,自噬在生物应对多种不良环境过程中发挥着重要作用,但是自噬在细胞应对低温环境过程中的功能研究却甚少。该研究给予He La细胞(人子宫颈癌细胞)不同程度的急性冷刺激,探讨此过程中自噬的发生和功能。将He La细胞培养于37...
有研究证明,自噬在生物应对多种不良环境过程中发挥着重要作用,但是自噬在细胞应对低温环境过程中的功能研究却甚少。该研究给予He La细胞(人子宫颈癌细胞)不同程度的急性冷刺激,探讨此过程中自噬的发生和功能。将He La细胞培养于37°C(对照组)或经不同程度的低温(10、18、28°C)处理,观察对照组与低温处理组细胞表达自噬标志物EGFP-LC3(enhanced green fluorescent protein-microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3)的变化,以监测自噬小体形成。结果显示,低温处理诱导He La细胞发生不同程度的自噬现象:10°C处理3~6 h的细胞内的自噬小体增多且体积增大,18°C处理的细胞内的自噬小体在3 d时最明显,28°C处理的细胞始终维持在较低水平。研究还发现,He La细胞在自噬减弱消失的同时发生细胞死亡,自噬特异性的化学抑制剂Bafilomycin A1处理可以进一步降低不同程度的低温胁迫下He La细胞的存活率,表明自噬在细胞低温应激过程中发挥着保护作用。Bafilomycin A1处理伴随有细胞内活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平增高,提示低温胁迫下自噬可能通过调控细胞内ROS水平来保护细胞。该研究结果表明,自噬在真核细胞冷应激中具有重要作用。
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关键词
自噬
冷应激
活性氧
HELA细胞
原文传递
题名
PGC-1α敲降对斑马鱼细胞冷应激过程的影响
被引量:
3
1
作者
胡成枫
王晓煜
陈良标
机构
上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室科技部海洋生物科学国际联合研究中心水产科学国家级实验教示范中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第10期4422-4429,共8页
基金
国家自然科学基金(No.41761134050)资助
文摘
过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator activated receptorγ,PPARγ)辅助激活因子1α(PPARγcoactivator-1α,PGC-1α)作为一个重要的转录激活因子,参与多种生理活动的调节。本研究探究了PGC-1α在斑马鱼(Danio rerio)ZF4细胞(胚胎发育3 d成纤维样细胞)冷应激过程中所起的作用。通过慢病毒质粒转染干扰PGC-1α基因的表达,并用嘌呤霉素筛选得到稳转细胞系,给与其18℃7 d和10℃7 d的低温刺激后使用CM-H2DCFDA探针染色,通过流式细胞仪检测细胞内活性氧(reactive oxygen species,ROS)含量;JC-1探针染色,流式细胞仪检测低温处理后PGC-1α敲降的细胞线粒体膜电位的变化。研究表明,在低温刺激下,PGC-1α基因未敲降的ZF4细胞内ROS含量升高,线粒体膜电位下降;而在PGC-1α基因敲降的ZF4细胞内,ROS含量在前者的水平上进一步升高,线粒体膜电位的下降也加剧,故PGC-1α在ZF4细胞冷应激过程中对细胞起到保护作用,能维持细胞内ROS含量和线粒体膜电位水平。本研究对PGC-1α基因在斑马鱼ZF4细胞冷应激过程中所起的功能进行初步探究,为鱼类在低温下的适应性研究提供依据。
关键词
PGC-1Α
ZF4
细胞
低温刺激
ROS
线粒体膜电位
Keywords
PGC-1α
ZF4 cells
Cold stimulation
ROS
Mitochondrial membrane potential
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
罗氏沼虾亲虾越冬池中不同基质上微生物群落多样性分析
被引量:
3
2
作者
谢芹
江敏
胡成枫
张健龙
王城峰
童晓岚
顾德平
胡伟国
于忠利
戴习林
机构
上海海洋大学水产与生命学院
上海市水产养殖工程技术研究中心
陶氏化学(中国)投资有限公司
上海市奉贤区水产技术推广站
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期336-347,共12页
基金
上海市虾类产业技术体系建设项目[沪农科产字(2014)第5号]
上海市教委重点学科建设项目(No.J50701)
上海市高校知识服务平台项目(No.ZF1206)~~
文摘
【目的】了解罗氏沼虾亲虾越冬时循环养殖系统对水质的调控效果,探明其中微生物群落的作用。【方法】采集循环养殖系统运行88 d后的越冬池池水、池中人工水草(普通纤维膜)以及外置式生物滤器中的纳米纤维膜等3种不同基质上的微生物,利用DNA抽提、PCR扩增和定量以及高通量Mi Seq测序技术等对3种不同基质上的微生物进行16S r RNA基因序列V4-V5区的测定和分析,并根据测序得到的双端测序读长(Pair-end reads)进行质量控制和过滤,之后进行操作分类单元(OTU)聚类分析,并基于OTU对微生物群落的多样性指数和群落结构进行分析;每3-4 d对越冬池池水水质进行监测。【结果】养殖池塘的水质保持在良好的状态,其中氨氮和亚硝氮浓度控制在0.17±0.08 mg/L和0.28±0.15 mg/L;不同基质上的微生物组成和多样性都不相同。在3种基质上共检测并鉴定出细菌64种,隶属于9门64属,包括变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)、酸杆菌门(Acidobacteria)和绿菌门(Chlorobi)。从属水平上对3种基质上的细菌进行分析,发现养殖池水中含量最高的为丛毛单菌科下的一个未分类类群(Comamonadaceae_unclassified),其也是3种基质的共有优势类群;普通纤维膜上为Inhella,纳米纤维膜上则是小纺锤状菌属(Fusibacter)。3种基质上细菌群落多样性顺序为:纳米纤维膜>普通纤维膜>养殖池水。通过对亲虾越冬养殖全过程的水质监测,发现越冬期间亲虾池水质始终保持在良好状态,并且在循环水系统开启约40 d后水质达到了相对稳定的状态。【结论】通过在育苗池中悬挂人工水草,配合内含纳米纤维膜的外置式生物滤器,可使罗氏沼虾越冬亲虾池保持良好的水质。随着新型材料科学的发展,开发出适用于水产养殖业的滤料很有必要。
关键词
生物膜
高通量测序
微生物群落多样性
罗氏沼虾
水质
Keywords
Biofilm
High-throughput sequencing
Microbial community diversity
Macrobrachium rosenbergii
Water quality
分类号
S917.1 [农业科学—水产科学]
S966.12 [农业科学—水产养殖]
原文传递
题名
自噬在细胞冷应激中的作用研究
被引量:
5
3
作者
胡春兰
陈良标
胡成枫
韩兵社
机构
上海海洋大学水产与生命学院
上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
出处
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2016年第9期1077-1083,共7页
基金
国家基金委重点项目(批准号:31130049)
上海市自然科学基金项目(批准号:13ZR1419500)
上海市教委水产高峰学科项目资助的课题~~
文摘
有研究证明,自噬在生物应对多种不良环境过程中发挥着重要作用,但是自噬在细胞应对低温环境过程中的功能研究却甚少。该研究给予He La细胞(人子宫颈癌细胞)不同程度的急性冷刺激,探讨此过程中自噬的发生和功能。将He La细胞培养于37°C(对照组)或经不同程度的低温(10、18、28°C)处理,观察对照组与低温处理组细胞表达自噬标志物EGFP-LC3(enhanced green fluorescent protein-microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3)的变化,以监测自噬小体形成。结果显示,低温处理诱导He La细胞发生不同程度的自噬现象:10°C处理3~6 h的细胞内的自噬小体增多且体积增大,18°C处理的细胞内的自噬小体在3 d时最明显,28°C处理的细胞始终维持在较低水平。研究还发现,He La细胞在自噬减弱消失的同时发生细胞死亡,自噬特异性的化学抑制剂Bafilomycin A1处理可以进一步降低不同程度的低温胁迫下He La细胞的存活率,表明自噬在细胞低温应激过程中发挥着保护作用。Bafilomycin A1处理伴随有细胞内活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平增高,提示低温胁迫下自噬可能通过调控细胞内ROS水平来保护细胞。该研究结果表明,自噬在真核细胞冷应激中具有重要作用。
关键词
自噬
冷应激
活性氧
HELA细胞
Keywords
autophagy
cold stress
ROS
HeLa cells
分类号
Q25 [生物学—细胞生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PGC-1α敲降对斑马鱼细胞冷应激过程的影响
胡成枫
王晓煜
陈良标
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
原文传递
2
罗氏沼虾亲虾越冬池中不同基质上微生物群落多样性分析
谢芹
江敏
胡成枫
张健龙
王城峰
童晓岚
顾德平
胡伟国
于忠利
戴习林
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
原文传递
3
自噬在细胞冷应激中的作用研究
胡春兰
陈良标
胡成枫
韩兵社
《中国细胞生物学学报》
CAS
CSCD
2016
5
原文传递
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