基于CiteSpace的国内外CADD领域研究现状与趋势分析

目的近年来,计算机辅助药物设计(computer aided drug design,CADD)发展迅速,受到了中外学者和医药界的广泛关注。系统了解CADD领域的发展进程,对科研人员和药物研发机构的研究方向和工作开展具有十分重要的指导意义和参考价值。方法以中国知网(CNKI)和Web of Science(WOS)数据库作为数据来源,利用可视化工具CiteSpace软件,采用定性与定量相结合的研究方法总结归纳了2010—2022年区间段内发表的CADD文献,绘制科学知识图谱,从研究热点和演进趋势等方面展开分析。结果与结论研究结果显示,国内外关于CADD研究的侧重点各有不同,加快人工智能算法的实际应用,提高计算机药物设计的效率将成为新的研究方向。

基于分子生成模型的SOS1抑制剂衍生物设计

针对现有SOS1抑制剂中新颖结构数量较少的问题,提出一种结合RNN及Transformer的改进分子生成算法R-T。首先用ChEMBL数据集对Transformer模型预训练,通过数据增强方法提高模型学习分子表征的能力;然后用SOS1抑制剂对预训练模型进行微调,运用强化学习方法设计MRTX0902的衍生物,并与对Specs库进行虚拟筛选的方法比较生成分子的质量。结果表明,R-T算法能生成多样性高、易合成的候选SOS1抑制剂,多样性为0.693,可合成性为3.14。这表明其在生成新颖化学结构上的有效性。

基于复杂网络的中药半枝莲系统生物学信息挖掘方法

目的:半枝莲在中医临床上被广泛运用,挖掘其系统生物学信息具有重要意义。方法:本文整合半枝莲天然化合物和基因组学数据,运用Herb-Prince复杂网络算法挖掘半枝莲潜在关联基因、基因族和KEGG信号通路,并通过文献进行验证。结果:筛选出与半枝莲关联系数较高的Top 100基因、4个基因族和Top 10 KEGG信号通路。结论:相关结果与半枝莲临床和药理研究高度一致,为科研人员从分子水平研究半枝莲药理活性提供决策支持。

基于多核集群系统的并行编程模型的研究

并行计算技术是计算机技术发展的重要方向之一。当前并行程序模型主要有消息传递模型和共享存储模型两种。随着处理器多核技术的发展,在一枚多核处理器中集成两个或多个完整的计算引擎(内核),并充分利用多核计算机的特性,发挥多核计算机的性能成为一个很重要的研究方向。介绍一种新的MPI实现机制,这种机制集成了共享存储模型和消息通信模型的优点,在节点内使用共享存储模型,在节点间使用消息传递模型,并且通过自动生成线程级的任务来获得更好的性能。

基于复杂网络方法的中医药治疗肺癌研究

介绍中医药治疗肺癌的相关研究情况,阐述复杂网络算法及其在中医药领域的相关应用,分析复杂网络算法中的相关基础数据,指出存在的问题并对未来研究方向提出建议。

单点登录系统的设计与实现

随着信息技术的广泛应用,用户在进行业务处理时可能需要同时访问多个业务系统。针对这种状况,有必要研究基于数字证书和SSL/TLS通道的单点登陆系统,实现"一点登录、多点漫游"。介绍了单点登录系统的设计和实现。

中医药高等院校医药信息技术实践教育中心建设探讨

南京中医药大学医药信息技术实践教育中心,依托于计算机科学与技术、软件工程和医学信息学科,以培养医药信息技术"实用型、创新性"本科人才为目标,课程实施以实验教学为主,教学环节直接对接医药技术产业链。通过校内实践教育中心和校外实践教育基地资源共享和优势互补,促进教学相长,校企共进。同时,通过专业实践教学体系改革,提高学生的实践技能和创新能力,并带动计算机科学与技术、软件工程等相关专业的建设。

基于属性相似度的中药加权网络构建及社团划分方法

目的基于名中医治疗肺癌的临床病案,探索运用复杂网络模型发现中医用药规律,为进一步传承名老中医临床经验提供基础。方法基于国医堂名老中医治疗肺癌的2666条处方数据,兼顾方剂信息和药物属性信息,依据节点关联度和属性相似度构建中药加权网络,找出核心药物,并进行药物社团划分,最后分析实验结果。结果中药加权网络包含482个药物节点,4184条边,找出核心药物20味,划分出9个重叠药物社团,模块度为0.318。结论在临床方剂数据上运用复杂网络模型,可以更直观地展示药物间的联系,基于属性相似度挖掘出药物社团,为中医临床用药提供有力工具。

基于射频识别技术的中药饮片行业产品电子代码编码方案研究

统一合理的电子标签编码方案是构建中药饮片物联管控系统的基础。运用EPC编码结构模型,采用EPC 96位通用标识符(EPC GID-96)编码方案,充分考虑中药饮片企业在种植、生产、仓储和销售各个环节的应用需求,对代码段合理分配,设计构建了中药饮片行业EPC编码方案,为中药饮片生产质量管控与追溯提供了标签编码基础。

基于G-Means的中医药可穿戴设备的数据汇聚方法研究

目的主要研究高效的数据汇聚方法,以减少中医药可穿戴设备节点的能量消耗,并延长中医药可穿戴设备网络的生存周期。方法通过G-Means算法,按照中医可穿戴设备节点的地理位置,将节点划分为多个服从高斯分布的簇集。根据节点的剩余能量与地理位置为所有簇集内可穿戴设备节点分配权重,所计算的权重值为每个簇集选取合适的簇头节点。网络内所有节点数据经簇头节点收集并汇聚至中医医生观测平台。结果文中的方法在场景1与场景2中所有节点在网络前100轮的平均能耗分别为0.0262 J与0.0555 J,比同类型方法均降低10%以上。文中所提方法在场景1与场景2下首个节点的失效时间为910轮与849轮,比同类型方法均延长10%以上。结论高效中医药可穿戴设备的数据汇聚方法优化中医药可穿戴设备网络的拓扑结构,提高设备节点的能效性,并延长网络的生存周期。

基于MDE的AADL构件组合兼容的方法

实时嵌入式系统建模语言—体系结构分析与设计语言AADL是一种基于组件的半形式化建模语言,当AADL构件模型进行组合时,因为一些交互活动的序列不匹配从而导致构件组合行为不兼容,提出了一种基于模型驱动方法 MDE的AADL构件组合兼容方法。利用MDE异构模型转换框架将AADL模型转换至接口自动机IA,利用形式化方法验证IA的兼容性,使用IA Tool构建IA模型的构件兼容运行环境,将构造的环境映射到AADL组件,能够解决AADL构件组合的行为兼容性问题。

基于复杂网络的名老中医治疗肺癌用药规律研究

目的研究名老中医治疗肺癌的临床病案数据,探索运用复杂网络模型发现病机与中医用药规律。方法基于1090条包含病机、处方的肺癌病案有效诊疗数据,采用复杂网络分析方法,兼顾方剂和中药属性信息,构建中药带权网络,依据节点重要性挖掘核心病机的核心中药。结果针对气阴两虚、痰瘀郁肺、癌毒走注、痰瘀郁毒、热毒痰瘀阻肺以及热毒痰瘀互结六个病机,在包含401个中药节点的中药带权网络范围内找出各自对应的核心药物。结论复杂网络模型可以直观展示病机与药物间的联系,为进一步深化中医对肺癌的理论认识,传承名老中医临床经验提供基础。

混合神经网络模型在人体活动识别中的研究

针对人体活动识别问题与其在实际情况中的应用,综合考量卷积神经网络与作为循环神经网络变体的门控循环单元,设计能自动提取传感器数据特征和记忆时序性活动数据的CNN-GRU混合神经网络模型,并予以改良。使用该模型在公开的数据集上进行实验,较其他的模型效果更加理想。在人体活动识别的处理中,CNN-GRU模型能达到预期的高准确率。在数据集时序性依赖较强的情况下,CNN-GRU模型能拥有更好的准确度和稳定性。

Android应用交互及任务栈处理

针对Android应用开发中应用内部及应用之间的交互非常频繁的问题,对应用交互的模式、返回路径、传输媒介与任务栈等进行研究,旨在提高应用的系统效率.Intent组件是应用之间交互的媒介,对Intent组件的主要属性、显式Intent与隐式Intent两种启动目标组件方式进行了详细的说明,并提供了具体的实现代码.在不同应用之间的交互情境下选择不同的Intent启动方式有利于提高交互的效率.在Activity的返回路径上,提出任务栈返回与Task Stack Builder对象管理返回两种模式及解决方案,解决了顺序路径的返回及指定路径的返回等问题,并在多个型号的设备上进行了测试验证.

中药饮片条码识别移动客户端系统

利用Android SDK,开发中药饮片条码识别系统,在智能终端手机上运用Android控件扫描条码,连接网络访问中药饮片条码信息系统,实现饮片生产及质检等信息的实时查询。

Android开发中利用反射获取存储路径的研究

Android应用的开发中对存储的访问非常频繁,但是Android各个版本对存储的支持比较混乱,部分版本甚至没有公开的API支持对扩展存储访问.对Android的内置、外置存储设备进行研究后,提出将存储分为内部存储、外部存储及扩展存储三个类型.分析了各个存储的类型的特点及访问方式,重点讨论了扩展存储的访问方式,提出利用JAVA的反射机制来获取Android平台的扩展存储目录,解决了Android不同版本对存储进行访问的兼容性问题.通过分析工具分析了反射机制在此应用中的效率问题,并在不同Android版本的设备上进行了测试.

基于校企产学研合作的医药信息技术实践教育中心建设

为了进一步提高学生的专业技能与创新能力,以培养医药信息技术"实用型、创新性"本科人才为目标,建立了校企产学研合作模式的医药信息技术实践教育中心。该中心采取校内实践教育中心和校外实践教育基地资源共享和优势互补,促进教学相长、校企共进,提高了学生自主学习和实践创新能力,从而有利于培养理论基础扎实、工程实践能力强的多层次、实用型中医药信息工程应用型创新人才。

基于物联网的中药饮片质量追溯系统的架构

针对中药饮片质量有效追溯的强烈要求,文章提出了基于物联网的中药饮片质量追溯系统的架构,该架构将物联网的相关技术应用于中药饮片行业,实现从种植生产各个环节的信息可回溯,在此基础上,给出了基于物联网的中药饮片质量追溯系统的架构的工作流程以及具体的方案。

商业智能与中药企业QSMES的集成应用研究

文章分析研究了中药企业的质量标准生产执行系统(QSMES)的特点,并阐述了QSMES在辅助决策支持上的不足,基于商业智能理论,介绍了商业智能与中药企业QSMES集成的体系结构,以及相应的系统解决方案。分别阐述了商业智能中数据仓库、联机事务分析(OLAP)以及数据挖掘功能的具体应用方法。将中药企业的QSMES数据资源转化为有用的信息和知识,为企业管理人员的决策提供可靠的支持。

基于Web Service的中药种植气象信息手机报警系统

文章设计并实现了一款基于Web Service的中药种植气象信息手机报警系统,该系统通过SOAP协议调用Web服务从互联网上获取天气信息,使用Android内置数据库SQLite来存储数据,通过Android控件在智能终端手机上显示报警信息。