目的:本研究采用网络药理学的方法探讨四逆加人参汤调治胃癌相关性疲乏(Gastric Cancer Related Fatigue,GCRF)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)收集并筛选四逆加人参汤中药成分及其相关作用靶点,运用Unipro...目的:本研究采用网络药理学的方法探讨四逆加人参汤调治胃癌相关性疲乏(Gastric Cancer Related Fatigue,GCRF)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)收集并筛选四逆加人参汤中药成分及其相关作用靶点,运用Uniprot数据库对获得的靶点进行标化;利用OMIM、Gene Cards、TTD、Dis Ge NET数据库分别收集"胃癌相关性疲乏"疾病靶点;应用筛选的中药成分及靶点,通过Cytoscape 3.7.2软件构建"中药-成分-靶点"网络图;应用韦恩在线绘制平台获取疾病和中药相互作用交集靶点,导入STRING 11.0数据库作互作分析,得到核心蛋白基因,并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图,筛选并获得核心靶点;将数据导入Matescape平台,进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;最后构建"药物-成分-靶点-通路"网络图。结果:筛选得到四逆加人参汤中药有效成分112个,作用靶点226个,其中山奈酚、槲皮素、β-谷甾醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、芒柄花素为主要活性成分。筛选得到疾病基因1 786个。共获得中药-疾病交集基因134个,筛选得到核心靶点23个,其中排名居前五位的核心基因分别是信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(Mitogen-Activated Protein Kinase 1,MAPK1)、丝裂原活化蛋白激酶3(Mitogen-Activated Protein Kinase 3,MAPK3)、肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)。GO富集分析共涉及生物过程(BP)899个,细胞组分(CC)21个,分子功能(MF)41个,KEGG通路富集分析显示蛋白主要富集在肿瘤(Cancer)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)等信号通路上。结论:四逆加人参汤调治GCRF具有"多成分-多靶点-多途径"的特点与优势,为进一步研究四逆加人参汤调治GCRF的物质基础与分子机制提供了理论依据。展开更多
文摘目的:本研究采用网络药理学的方法探讨四逆加人参汤调治胃癌相关性疲乏(Gastric Cancer Related Fatigue,GCRF)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)收集并筛选四逆加人参汤中药成分及其相关作用靶点,运用Uniprot数据库对获得的靶点进行标化;利用OMIM、Gene Cards、TTD、Dis Ge NET数据库分别收集"胃癌相关性疲乏"疾病靶点;应用筛选的中药成分及靶点,通过Cytoscape 3.7.2软件构建"中药-成分-靶点"网络图;应用韦恩在线绘制平台获取疾病和中药相互作用交集靶点,导入STRING 11.0数据库作互作分析,得到核心蛋白基因,并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图,筛选并获得核心靶点;将数据导入Matescape平台,进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;最后构建"药物-成分-靶点-通路"网络图。结果:筛选得到四逆加人参汤中药有效成分112个,作用靶点226个,其中山奈酚、槲皮素、β-谷甾醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、芒柄花素为主要活性成分。筛选得到疾病基因1 786个。共获得中药-疾病交集基因134个,筛选得到核心靶点23个,其中排名居前五位的核心基因分别是信号转导因子和转录激活因子3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3,STAT3)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(Mitogen-Activated Protein Kinase 1,MAPK1)、丝裂原活化蛋白激酶3(Mitogen-Activated Protein Kinase 3,MAPK3)、肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)。GO富集分析共涉及生物过程(BP)899个,细胞组分(CC)21个,分子功能(MF)41个,KEGG通路富集分析显示蛋白主要富集在肿瘤(Cancer)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)等信号通路上。结论:四逆加人参汤调治GCRF具有"多成分-多靶点-多途径"的特点与优势,为进一步研究四逆加人参汤调治GCRF的物质基础与分子机制提供了理论依据。