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系统性红斑狼疮与子痫前期因果关系的孟德尔随机化分析
1
作者
桂琦
侯伟
+3 位作者
胡甲琳
姜淑芳
游艳琴
卢彦平
《发育医学电子杂志》
2024年第6期415-421,共7页
目的探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)与子痫前期(preeclampsia,PE)之间的因果关系。方法通过R包TwoSampleMR(v 0.6.4)从IEU OpenGWAS数据库中筛选与SLE具有显著差异的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorph...
目的探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)与子痫前期(preeclampsia,PE)之间的因果关系。方法通过R包TwoSampleMR(v 0.6.4)从IEU OpenGWAS数据库中筛选与SLE具有显著差异的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)作为工具变量,共获取包含7071163个SNP的SLE数据集和包含24165538个SNP的PE数据集。采用逆方差加权(inverse-variance weighting,IVW)法、孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)-Egger回归法、加权中位数(weighted median estimator,WME)法、简单模式(simple mode,SM)、加权模式(weighted mode,WM)进行MR分析,通过计算优势比(odds ratio,OR)值和95%CI评价SLE和PE之间的因果关系,并进行Cochran's Q异质性检验、MR-Egger回归水平多效性检验和留一法评估验证数据的稳定性和可靠性。结果共纳入42个SNP作为工具变量。IVW分析提示SLE与PE发病风险之间存在因果关系(OR=1.038,95%CI:1.003~1.073,P<0.05),MR-Egger分析也提示SLE与PE之间存在因果关系(OR=1.094,95%CI:1.020~1.174,P<0.05),在WME、SM及WM分析中未发现两者存在因果关系。Cochran's Q异质性检验和MR-Egger水平多效性检验显示,SNP之间不存在异质性及水平多效性。留一法检验提示没有单个SNP对整体结果有较大影响。结论MR分析提示SLE可增加PE的发病风险。
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关键词
孟德尔随机化
系统性红斑狼疮
子痫前期
全基因组关联分析
单核苷酸多态性
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职称材料
题名
系统性红斑狼疮与子痫前期因果关系的孟德尔随机化分析
1
作者
桂琦
侯伟
胡甲琳
姜淑芳
游艳琴
卢彦平
机构
解放军医学院
南开大学医学院
解放军总医院第一医学中心妇产科
解放军总医院第七医学中心妇产医学部
出处
《发育医学电子杂志》
2024年第6期415-421,共7页
基金
军队计生专项课题(20JSZ11)。
文摘
目的探究系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)与子痫前期(preeclampsia,PE)之间的因果关系。方法通过R包TwoSampleMR(v 0.6.4)从IEU OpenGWAS数据库中筛选与SLE具有显著差异的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)作为工具变量,共获取包含7071163个SNP的SLE数据集和包含24165538个SNP的PE数据集。采用逆方差加权(inverse-variance weighting,IVW)法、孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)-Egger回归法、加权中位数(weighted median estimator,WME)法、简单模式(simple mode,SM)、加权模式(weighted mode,WM)进行MR分析,通过计算优势比(odds ratio,OR)值和95%CI评价SLE和PE之间的因果关系,并进行Cochran's Q异质性检验、MR-Egger回归水平多效性检验和留一法评估验证数据的稳定性和可靠性。结果共纳入42个SNP作为工具变量。IVW分析提示SLE与PE发病风险之间存在因果关系(OR=1.038,95%CI:1.003~1.073,P<0.05),MR-Egger分析也提示SLE与PE之间存在因果关系(OR=1.094,95%CI:1.020~1.174,P<0.05),在WME、SM及WM分析中未发现两者存在因果关系。Cochran's Q异质性检验和MR-Egger水平多效性检验显示,SNP之间不存在异质性及水平多效性。留一法检验提示没有单个SNP对整体结果有较大影响。结论MR分析提示SLE可增加PE的发病风险。
关键词
孟德尔随机化
系统性红斑狼疮
子痫前期
全基因组关联分析
单核苷酸多态性
Keywords
Mendelian randomization
Systemic lupus erythematosus
Preeclampsia
Genome-wide association study
Single nucleotide polymorphism
分类号
R59 [医药卫生—内科学]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
系统性红斑狼疮与子痫前期因果关系的孟德尔随机化分析
桂琦
侯伟
胡甲琳
姜淑芳
游艳琴
卢彦平
《发育医学电子杂志》
2024
0
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