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基于TCGA数据筛选乳腺癌预后相关的tsRNA标志物
1
作者
傅雨琦
钟山亮
+2 位作者
胡缓缓
袁胜龙
黄新恩
《临床检验杂志》
CAS
2024年第3期212-219,共8页
目的筛选乳腺癌中差异表达的转运RNA衍生小RNA(tsRNA),构建与乳腺癌患者预后相关的预测模型。方法收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌患者的tsRNA表达谱以及临床相关数据,利用最小绝对值收敛和选择算子算法(LASSO)筛选出关键tsR...
目的筛选乳腺癌中差异表达的转运RNA衍生小RNA(tsRNA),构建与乳腺癌患者预后相关的预测模型。方法收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌患者的tsRNA表达谱以及临床相关数据,利用最小绝对值收敛和选择算子算法(LASSO)筛选出关键tsRNA,构建风险评分模型和列线图预测模型。结果从乳腺癌差异表达的106条tsRNA中识别了11条非零系数的tsRNA,据此构建了评估乳腺癌预后的风险评分模型和列线图预测模型,经测试集和校准曲线证实两模型均具有良好的预测能力。进一步预测上述11条tsRNA的靶基因,发现其富集了8条KEGG通路,包括多条与肿瘤的进展相关的通路;经相关性分析发现,NR2C2和ZNFX1与tRF-21-YBOZZ7ND的表达水平呈负相关。结论成功构建了风险评分模型和列线图预测模型,有望为乳腺癌的预后评估提供新的方法。
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关键词
乳腺癌
tsRNA
预后
生存率
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职称材料
ACS NSQIP手术风险计算器预测开腹宫颈癌根治术手术风险的价值
2
作者
袁盛龙
胡缓缓
贡震
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2024年第2期140-145,共6页
目的评估美国外科医师学会国家外科质量改进计划(ACS NSQIP)手术风险计算器预测我国的早期宫颈癌患者行开腹宫颈癌根治术手术风险。方法收集2021年1-12月在南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)妇科行开腹宫颈癌根治术139例患者...
目的评估美国外科医师学会国家外科质量改进计划(ACS NSQIP)手术风险计算器预测我国的早期宫颈癌患者行开腹宫颈癌根治术手术风险。方法收集2021年1-12月在南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)妇科行开腹宫颈癌根治术139例患者的临床资料。通过ACS NSQIP手术风险计算器获得预测的术后并发症发生率,并与实际发生率进行比较。采用逻辑回归、C-统计量(C-statistic)、Brier值进行分析。结果ACS NSQIP手术风险计算器所预测的开腹宫颈癌根治术后严重并发症、总体并发症、静脉血栓、再入院和二次手术、切口感染发生率均与实际发生率差异较大;预测的平均住院时间亦与实际住院时间存在显著差异[(3.93±0.42)d vs.(13.11±4.71)d,P<0.001]。结论ACS NSQIP手术风险计算器不能准确预测我国开腹宫颈癌根治术患者的术后并发症及住院时间。
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关键词
宫颈癌
经腹根治术
术后并发症
手术风险计算器
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职称材料
生殖道微生物群与子宫内膜癌相关性研究
3
作者
胡缓缓
贡震
《中国肿瘤外科杂志》
CAS
2023年第3期305-309,共5页
子宫内膜癌是妇科常见三大恶性肿瘤之一,发病率不断上升,严重威胁女性身体健康。随着16S rRNA基因测序技术的飞速进步,越来越多的研究结果显示,女性生殖道微生物群的改变可能导致子宫内膜癌的发生或加重其进展。文章对女性生殖道微生物...
子宫内膜癌是妇科常见三大恶性肿瘤之一,发病率不断上升,严重威胁女性身体健康。随着16S rRNA基因测序技术的飞速进步,越来越多的研究结果显示,女性生殖道微生物群的改变可能导致子宫内膜癌的发生或加重其进展。文章对女性生殖道微生物群的鉴定及其与子宫内膜癌发生发展的相关性进行综述,对未来把微生物作为靶标应用于子宫内膜癌防治的可能性进行展望。
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关键词
女性生殖道微生物群
子宫内膜癌
16S
rRNA
微生物移
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职称材料
题名
基于TCGA数据筛选乳腺癌预后相关的tsRNA标志物
1
作者
傅雨琦
钟山亮
胡缓缓
袁胜龙
黄新恩
机构
南京医科大学附属肿瘤医院/江苏省肿瘤医院肿瘤内科
南京医科大学附属肿瘤医院/江苏省肿瘤医院江苏省临床检验中心
南京医科大学附属妇产医院/南京市妇幼医院妇科
出处
《临床检验杂志》
CAS
2024年第3期212-219,共8页
基金
江苏省干部保健科研项目(BJ21030)。
文摘
目的筛选乳腺癌中差异表达的转运RNA衍生小RNA(tsRNA),构建与乳腺癌患者预后相关的预测模型。方法收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌患者的tsRNA表达谱以及临床相关数据,利用最小绝对值收敛和选择算子算法(LASSO)筛选出关键tsRNA,构建风险评分模型和列线图预测模型。结果从乳腺癌差异表达的106条tsRNA中识别了11条非零系数的tsRNA,据此构建了评估乳腺癌预后的风险评分模型和列线图预测模型,经测试集和校准曲线证实两模型均具有良好的预测能力。进一步预测上述11条tsRNA的靶基因,发现其富集了8条KEGG通路,包括多条与肿瘤的进展相关的通路;经相关性分析发现,NR2C2和ZNFX1与tRF-21-YBOZZ7ND的表达水平呈负相关。结论成功构建了风险评分模型和列线图预测模型,有望为乳腺癌的预后评估提供新的方法。
关键词
乳腺癌
tsRNA
预后
生存率
Keywords
breast cancer
transferred RNA-derived small RNA
prognosis
survival rate
分类号
R446 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
ACS NSQIP手术风险计算器预测开腹宫颈癌根治术手术风险的价值
2
作者
袁盛龙
胡缓缓
贡震
机构
南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健医院)妇科
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2024年第2期140-145,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(编号:81872485)
南京市卫生科技发展专项资金资助项目(编号:ZKX21048)。
文摘
目的评估美国外科医师学会国家外科质量改进计划(ACS NSQIP)手术风险计算器预测我国的早期宫颈癌患者行开腹宫颈癌根治术手术风险。方法收集2021年1-12月在南京医科大学附属妇产医院(南京市妇幼保健院)妇科行开腹宫颈癌根治术139例患者的临床资料。通过ACS NSQIP手术风险计算器获得预测的术后并发症发生率,并与实际发生率进行比较。采用逻辑回归、C-统计量(C-statistic)、Brier值进行分析。结果ACS NSQIP手术风险计算器所预测的开腹宫颈癌根治术后严重并发症、总体并发症、静脉血栓、再入院和二次手术、切口感染发生率均与实际发生率差异较大;预测的平均住院时间亦与实际住院时间存在显著差异[(3.93±0.42)d vs.(13.11±4.71)d,P<0.001]。结论ACS NSQIP手术风险计算器不能准确预测我国开腹宫颈癌根治术患者的术后并发症及住院时间。
关键词
宫颈癌
经腹根治术
术后并发症
手术风险计算器
Keywords
cervical cancer
open radical hysterectomy
post-operative complications
surgical risk calculator
分类号
R713.4 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
生殖道微生物群与子宫内膜癌相关性研究
3
作者
胡缓缓
贡震
机构
南京医科大学附属妇产医院/南京市妇幼保健院妇科
出处
《中国肿瘤外科杂志》
CAS
2023年第3期305-309,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(项目编号:81872485)
南京市卫生科技发展专项资金资助项目(项目编号:ZKX21048)。
文摘
子宫内膜癌是妇科常见三大恶性肿瘤之一,发病率不断上升,严重威胁女性身体健康。随着16S rRNA基因测序技术的飞速进步,越来越多的研究结果显示,女性生殖道微生物群的改变可能导致子宫内膜癌的发生或加重其进展。文章对女性生殖道微生物群的鉴定及其与子宫内膜癌发生发展的相关性进行综述,对未来把微生物作为靶标应用于子宫内膜癌防治的可能性进行展望。
关键词
女性生殖道微生物群
子宫内膜癌
16S
rRNA
微生物移
Keywords
Female reproductive tract microbiota
Endometrial cancer
16S rRNA
Microbic transplantation
分类号
R71 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于TCGA数据筛选乳腺癌预后相关的tsRNA标志物
傅雨琦
钟山亮
胡缓缓
袁胜龙
黄新恩
《临床检验杂志》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
ACS NSQIP手术风险计算器预测开腹宫颈癌根治术手术风险的价值
袁盛龙
胡缓缓
贡震
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
3
生殖道微生物群与子宫内膜癌相关性研究
胡缓缓
贡震
《中国肿瘤外科杂志》
CAS
2023
0
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职称材料
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