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宁夏枸杞根际土壤链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组测序和次级代谢产物分析
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作者 胡运琪 许建韧 +5 位作者 沈晓华 林文星 吴秀丽 南泽东 马晓莉 江志波 《中国医药生物技术》 2023年第2期99-109,共11页
目的 分析链霉菌Ⅱ-2-2-2基因序列,挖掘潜在次级代谢能力生物合成基因簇。方法 采用IlluminaHiSeq+PacBio测序技术获得链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组草图序列,经antiSMASH(v6.0.1)平台分析次级代谢产物合成基因簇,采用高效液相色谱-四极杆-飞... 目的 分析链霉菌Ⅱ-2-2-2基因序列,挖掘潜在次级代谢能力生物合成基因簇。方法 采用IlluminaHiSeq+PacBio测序技术获得链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组草图序列,经antiSMASH(v6.0.1)平台分析次级代谢产物合成基因簇,采用高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱技术对发酵液进行网络化分析。结果 自宁夏枸杞须根附近的土壤中分离得到一株菌株Ⅱ-2-2-2,经鉴定其与缺乏研究的Streptomycesacrimycini CSSP430 16S rRNA基因序列的相似度达99.64%。其基因组草图序列4 409 970 bp,G+C含量占66.43%,3974个蛋白质编码基因,10个rRNA操纵子和72个tRNA。Anti SMASH分析基因序列至少包含5条次级代谢产物合成基因簇,可能编码线性含唑肽类、核糖体合成和翻译后修饰的肽、非核糖体肽、聚酮类和萜类化合物。获得82个正负模式的离子,并将二级碎片离子在全球天然产物交互分子网络平台进行聚类分析和数据库搜索,发现了24个化学结构。结论 链霉菌Ⅱ-2-2-2具有丰富的次级代谢能力并可能成为研究和开发新抗生素的重要资源。 展开更多
关键词 链霉菌Ⅱ-2-2-2 生物合成基因簇 基因组挖掘 分子网络 次级代谢物
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高原土壤菌株的分离及抗菌活性初步评价
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作者 郭欢欢 林文星 +4 位作者 胡运琪 马晓莉 南泽东 江志波 吴秀丽 《农业与技术》 2023年第6期88-91,共4页
为了发现特殊生态环境的微生物资源,对青海湖土壤以及青藏高原的一个大型真菌进行微生物菌种分离,对部分菌株发酵提取物采用平板检测法进行抗菌活性评价。结果显示,共发现49株菌株,其中1株放线菌和5株真菌的发酵液对普通变形杆菌(Proteu... 为了发现特殊生态环境的微生物资源,对青海湖土壤以及青藏高原的一个大型真菌进行微生物菌种分离,对部分菌株发酵提取物采用平板检测法进行抗菌活性评价。结果显示,共发现49株菌株,其中1株放线菌和5株真菌的发酵液对普通变形杆菌(Proteus vulgaris)具有明显的生长抑制作用。研究结果表明,青藏高原土壤微生物资源具有发掘新结构抗生素的价值。 展开更多
关键词 菌株分离 真菌 放线菌 抗菌活性
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宁夏枸杞根际土壤链霉菌V-1-3次级代谢产物分析 被引量:2
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作者 胡运琪 马晓莉 +7 位作者 贾荣亮 林文星 郭欢欢 李彬 李舂龙 南泽东 吴秀丽 江志波 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期647-653,共7页
目的获得链霉菌V-1-3的基因组序列信息,分析其次级代谢产物生物合成基因簇并预测其代谢产物,为发现潜在新抗生素奠定基础。方法基于16S rRNA基因序列进行菌株属水平鉴定,利用Illumina HiSeq+PacBio测序技术对菌株V-1-3进行基因组测序,采... 目的获得链霉菌V-1-3的基因组序列信息,分析其次级代谢产物生物合成基因簇并预测其代谢产物,为发现潜在新抗生素奠定基础。方法基于16S rRNA基因序列进行菌株属水平鉴定,利用Illumina HiSeq+PacBio测序技术对菌株V-1-3进行基因组测序,采用antiSMASH(v6.0.1)在线工具分析次级代谢产物生物合成基因簇,液-质联用技术检测产生的次级代谢产物。结果链霉菌V-1-3基因组序列全长8243417 bp,平均(G+C)含量为72.14%,共编码7578个基因,预测到33个生物合成基因簇,利用液-质联用检测到4个代谢物:oxalomycin B、geosmin、coelichelin和ishigamide。结论来自盐碱地的链霉菌V-1-3具有丰富的次级代谢产物生物合成基因簇,能产生多种次级代谢产物,具有进一步发掘新抗生素的价值。 展开更多
关键词 盐碱地 链霉菌 全基因组测序 次级代谢产物
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发热、乏力、呼吸困难1个月,心肺复苏术后6小时
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作者 黄志军 孟新科 +1 位作者 柏承文 胡运琪 《中国医刊》 CAS 2010年第3期81-83,共3页
1病例摘要患者男,28岁,民工。因“反复发热、乏力、进行性呼吸困难1个月,呼吸心搏骤停并复苏术后6小时”人院。患者1个月前,无明显诱因出现持续低热、乏力、进行性消瘦,伴上腹胀痛及劳力性呼吸困难。院外未做特殊检查,口服中药,... 1病例摘要患者男,28岁,民工。因“反复发热、乏力、进行性呼吸困难1个月,呼吸心搏骤停并复苏术后6小时”人院。患者1个月前,无明显诱因出现持续低热、乏力、进行性消瘦,伴上腹胀痛及劳力性呼吸困难。院外未做特殊检查,口服中药,发热症状反复出现,具体热型不详。其他症状持续存在并进行性加重。6小时前, 展开更多
关键词 进行性呼吸困难 心肺复苏术 反复发热 乏力 劳力性呼吸困难 呼吸心搏骤停 进行性消瘦 进行性加重
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青藏高原盐湖土壤菌株分离及其抗菌活性初步评价 被引量:1
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作者 郭欢欢 胡运琪 +3 位作者 闻颖 马晓莉 南泽东 江志波 《当代化工研究》 2022年第21期53-55,共3页
目的:采用放线菌和真菌培养基对青海省柴旦木湖四份盐湖土壤进行研究。方法:青海大柴旦木湖四份盐湖土壤样本,用特定培养基进行微生物分离培养并借助电子显微镜获得菌株微观图像。对菌株代谢产物进行萃取和富集并在金黄色葡萄球菌模型... 目的:采用放线菌和真菌培养基对青海省柴旦木湖四份盐湖土壤进行研究。方法:青海大柴旦木湖四份盐湖土壤样本,用特定培养基进行微生物分离培养并借助电子显微镜获得菌株微观图像。对菌株代谢产物进行萃取和富集并在金黄色葡萄球菌模型评价抑菌活性。结果:分离得到25株真菌和13株放线菌。其中7株菌株的代谢产物对金黄色葡萄球菌具有不同程度的生长抑制活性。结论:本实验为深入研究青藏高原高原微生物资源和发掘特殊生境微生物来源的活性次级代谢产物奠定基础,也为微生物药物的开发和寻找新型结构的分子生物学元件提供可培养的实验菌株。 展开更多
关键词 青藏高原 盐湖土壤 微生物分离 抗菌活性
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宁北盐碱地土壤微生物的分离和抗菌活性筛选
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作者 马晓莉 丁范范 +4 位作者 魏纪元 周乐瑞 胡运琪 南泽东 江志波 《生物学杂志》 CAS 2024年第4期50-56,共7页
从宁北盐碱土壤中分离得到具有一定形态特征的单菌落45株,利用基因组提取技术,对菌株16S rRNA序列进行测序及菌属鉴定。结果显示,有16株放线菌,含13株链霉菌属,3株拟无枝酸菌属。抗菌活性实验结果表明,16株菌株均具有抑菌活性,其中,12... 从宁北盐碱土壤中分离得到具有一定形态特征的单菌落45株,利用基因组提取技术,对菌株16S rRNA序列进行测序及菌属鉴定。结果显示,有16株放线菌,含13株链霉菌属,3株拟无枝酸菌属。抗菌活性实验结果表明,16株菌株均具有抑菌活性,其中,12株菌株次级代谢产物对普通变形杆菌具有显著抗菌活性,12株菌株次级代谢产物对金黄色葡萄球菌具有明显抑制活性,9株菌株次级代谢产物对白色念珠菌具有一定的生长抑制活性。研究表明,从宁北盐碱土壤中分离得到的微生物菌株具有较强抗菌或抑菌活性,不仅丰富了特殊生境微生物资源,也为进一步从活性菌株中分离抗菌活性先导化合物奠定了基础。 展开更多
关键词 盐碱地土壤 微生物 放线菌 次级代谢产物 抗菌活性
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传统中药地骨皮化学成分和药理活性研究进展 被引量:35
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作者 陈靖枝 卢星 +5 位作者 胡运琪 郭欢欢 马晓莉 郭鑫 江志波 王芳 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期3066-3075,共10页
地骨皮Lycii Cortex为茄科Solanaceae枸杞属植物的干燥根皮,在传统中医药中具有重要的地位,具有凉血除蒸,清肺降火之功效,临床主要用于治疗阴虚潮热、骨蒸盗汗、咳嗽、咳血及内热消渴等症。地骨皮化学成分丰富多样,结构独特,含有如萜类... 地骨皮Lycii Cortex为茄科Solanaceae枸杞属植物的干燥根皮,在传统中医药中具有重要的地位,具有凉血除蒸,清肺降火之功效,临床主要用于治疗阴虚潮热、骨蒸盗汗、咳嗽、咳血及内热消渴等症。地骨皮化学成分丰富多样,结构独特,含有如萜类、甾醇类、有机酸、苯丙素类、生物碱、环肽类等类型。现代药理研究表明,地骨皮的粗提物或单体成分具有降血糖、降血压、降血脂、抗菌、抗病毒等多种药理活性。该文对地骨皮的化学成分及药理作用的研究概况进行了综述,为进一步明确其药效物质,推动医药学事业的发展,保障“健康中国”计划奠定基础。 展开更多
关键词 地骨皮 枸杞 化学成分 药理作用
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过山蕨中1个新结构三萜皂苷的结构鉴定
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作者 江志波 陈靖枝 +7 位作者 郭欢欢 胡运琪 郭鑫 马晓莉 杨静玲 王芳 张岱州 吴秀丽 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1155-1159,共5页
对过山蕨水提物化学成分进行了研究。采用硅胶柱色谱、凝胶(Sephadex LH-20)柱色谱、制备高效液相色谱等方法分离纯化过山蕨水提物中的化学成分,并根据波谱数据进行结构鉴定。从中分离鉴定了5个化合物,分别为aspleniumside G(1),trans-p... 对过山蕨水提物化学成分进行了研究。采用硅胶柱色谱、凝胶(Sephadex LH-20)柱色谱、制备高效液相色谱等方法分离纯化过山蕨水提物中的化学成分,并根据波谱数据进行结构鉴定。从中分离鉴定了5个化合物,分别为aspleniumside G(1),trans-p-coumaric acid(2),trans-p-coumaric acid 4-O-β-D-glucoside(3),cis-p-coumaric acid 4-O-β-D-glucoside(4)和(E)-ferulic acid-4-O-β-D-glucoside(5)。其中化合物1为新结构三萜皂苷类化合物。 展开更多
关键词 过山蕨 化学成分 分离鉴定 三萜皂苷
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