干巴菌菌丝体与原基的比较转录组学分析

干巴菌是云南省一种重要的野生食用真菌,但其发育过程的相关分子机制尚未被揭示。研究旨在以干巴菌G46号菌株基因组作为参考基因组,对干巴菌菌丝体、干巴菌原基进行转录组测序及有参分析。结果表明,差异表达基因(DEG)总数为4197个,2051个上调,2146个下调。GO富集分析表明,DEG在生物过程的多个条目中呈现出显著的富集现象,具体包括代谢过程、细胞过程以及单有机体过程等;在细胞组分的分类中,DEG显著富集于细胞、细胞部分、细胞器部分等条目;在分子功能的层面上,DEG还显著富集于催化活性、结合、转运体等关键条目中。这一发现揭示了DEG在生物体内具有广泛而多样的功能和作用。KEGG通路富集分析结果显示,DEG主要富集于MAPK信号通路、内质网中的蛋白质加工、氨基糖和核苷酸糖代谢通路等。内质网中的蛋白质加工、氨基糖和核苷酸糖代谢等途径相关DEG在原基期大部分上调表达。此外,共1742个碳水化物活性酶(CAZymes)相关DEG表达,其中碳水化合物结合模块(CBMs)与糖苷水解酶(GHs)的DEG数量最多,分别占40.01%和29.56%。这些基因主要参与糖类底物降解,表明原基形成需要大量物质和能量。同时,降解木质纤维素的基因富集,暗示干巴菌的原基发育可能与其共生植物密切相关。