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崖壁植物太行菊与长裂太行菊全基因组大小及特征分析
被引量:
1
1
作者
王祎玲
臧恩
+5 位作者
张昊
刘志霞
兰亚飞
何珊
郝伟丽
曹艳玲
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1582-1589,共8页
太行菊(Opisthopappus taihangensis)、长裂太行菊(O.longilobus),为太行山特有多年生崖壁草本植物,菊科(Compositae)重要野生资源,具有较高的经济与生态价值。为确定适合两物种的全基因组测序策略,该研究利用流式细胞法和高通量测序技...
太行菊(Opisthopappus taihangensis)、长裂太行菊(O.longilobus),为太行山特有多年生崖壁草本植物,菊科(Compositae)重要野生资源,具有较高的经济与生态价值。为确定适合两物种的全基因组测序策略,该研究利用流式细胞法和高通量测序技术,分析两物种基因组大小、杂合率、重复序列及GC含量等信息。结果表明:(1)流式细胞法估算太行菊基因组大小约为2.1 Gb,长裂太行菊基因组大小约为2.4 Gb。(2)高通量测序修正后太行菊基因组大小为3.13 Gb,重复序列比例为84.35%,杂合度为0.99%,GC含量为36.56%;长裂太行菊基因组为3.18 Gb,重复序列比例为83.83%,杂合度为1.17%,GC含量为36.62%。(3)初步组装后GC含量分布及平均深度存在异常,出现分层现象,可能是两物种基因组杂合率较高所致。综上结果表明,太行菊、长裂太行菊均属于高重复、高杂合、大基因组的复杂基因组,建议使用Illumina+PacBio测序组装策略,进行全基因组测序分析。
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关键词
太行菊
长裂太行菊
基因组调查
基因组大小
高通量测序
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职称材料
气候因素对大果榆分布的影响
被引量:
1
2
作者
叶航
王智
+5 位作者
侯慧敏
武佳慧
高悦
韩伟
臧恩
王祎玲
《常熟理工学院学报》
2020年第2期118-124,共7页
气候是决定植被类型和分布的主要因素之一,气候变化会导致植物分布区和植物群落结构发生改变.大果榆(Ulmus macrocarpa Hance)属于榆科(Ulmaceae)榆属(Ulmus L.)植物,具有较高的经济价值与医用价值,是榆科植物中重要的种质资源.本文利...
气候是决定植被类型和分布的主要因素之一,气候变化会导致植物分布区和植物群落结构发生改变.大果榆(Ulmus macrocarpa Hance)属于榆科(Ulmaceae)榆属(Ulmus L.)植物,具有较高的经济价值与医用价值,是榆科植物中重要的种质资源.本文利用基于最大熵模型(Maximum Entropy)的MaxEnt软件和GIS分析技术,对大果榆在当代气候背景条件下的适生区与潜在分布区进行预测分析.结果表明:模型具有良好的模拟结果,当前大果榆潜在分布区主要集中在山西、陕西、河北、河南等地区.影响大果榆分布的主效生态因子有年平均温、月均气温变化范围、等温性、温度季节性变化方差、年平均降水量、最湿润月降水量和降水季节性变化方差,其累计贡献率达99.9%.根据大果榆预测分布概率将其划分为4个气候适宜性等级.基于气候适宜性等级分组的PCA结果表明:PC1(77.25%)与PC2(22.70%)总共可以解释99.95%的大果榆种群气候差异.非参检验和多因素方差检验结果表明不同分组间的气候条件存在显著差异(P<0.05).本文研究结果为大果榆生态适宜区的界定与保护提供了理论基础,对大果榆种质资源的开发与合理利用具有指导意义.
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关键词
大果榆
气候因子
MAXENT
预测分布
适生区域
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职称材料
化龙山七筋姑种内二倍体与四倍体表型分化分析
3
作者
张昊
臧恩
+3 位作者
高悦
韩伟
曹艳玲
王祎玲
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2114-2121,共8页
七筋姑(Clintonia udensis Trautv.et Mey.)属百合科(Liliaceae)七筋姑属(Clintonia Raf.),多年生草本,具有二倍体(2n=14)和四倍体(4n=28)两种倍性。在陕西化龙山地区,二倍体主要分布在南坡海拔2450 m处,四倍体主要生长在北坡海拔1900 ...
七筋姑(Clintonia udensis Trautv.et Mey.)属百合科(Liliaceae)七筋姑属(Clintonia Raf.),多年生草本,具有二倍体(2n=14)和四倍体(4n=28)两种倍性。在陕西化龙山地区,二倍体主要分布在南坡海拔2450 m处,四倍体主要生长在北坡海拔1900 m左右,成为研究种内多倍体分化的理想材料。该研究从七筋姑营养和繁殖系统出发,研究其不同倍性的表型分化,揭示不同倍性的生态适应特征,为阐明七筋姑种内多倍体的演化提供线索。研究表明:(1)在根、茎、叶、花、果实、种子的11个性状中,二倍体的果实体积性状最为稳定(CV=0.02),叶长性状遗传多样性最高(CV=0.85);四倍体中果实体积性状也最为稳定(CV=0.06),而花数量性状多样性最高(CV=0.42)。(2)四倍体的果实体积平均值明显高于二倍体,但种子数量平均值显著少于二倍体,果实体积和种子体积性状在不同倍性间的分化占比最高(Vst=0.69)。(3)四倍体营养器官表型性状的遗传变异丰富度低于二倍体,其平均变异系数(CV=0.16)小于二倍体的变异系数(CV=0.44);在繁殖系统表型性状中,四倍体的遗传变异丰富度高于二倍体,平均变异系数(CV=0.30)大于二倍体(CV=0.26)。(4)显著性分析表明,二倍体与四倍体表型性状差异显著(P<0.05),而繁殖系统性状在不同倍性间无显著差异(P>0.05);PCA分析同样显示二倍体与四倍体间存在明显差异。四倍体显著的表型差异是对低海拔环境长期适应的结果。
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关键词
七筋姑
表型性状
多倍体
分化
化龙山
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职称材料
落实部门职责分工 加强“瘦肉精”监管工作
4
作者
臧恩
《农业知识(科学养殖)》
2011年第1期45-45,共1页
为进一步加强生猪质量安全监管,经国务院和中央机构编制委员会办公室同意,中央机构编制委员会办公室于2010年10月底印发了《关于进一步加强“瘦肉精”监管丁作的意见》,为进一步落实“瘦肉精”监管工作的部门职责分工,完善体制机制...
为进一步加强生猪质量安全监管,经国务院和中央机构编制委员会办公室同意,中央机构编制委员会办公室于2010年10月底印发了《关于进一步加强“瘦肉精”监管丁作的意见》,为进一步落实“瘦肉精”监管工作的部门职责分工,完善体制机制和崎管的全过程覆盖提供了组织保障。
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关键词
“瘦肉精”
监管工作
职责分工
实部
机构编制
安全监管
生猪质量
办公室
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职称材料
题名
崖壁植物太行菊与长裂太行菊全基因组大小及特征分析
被引量:
1
1
作者
王祎玲
臧恩
张昊
刘志霞
兰亚飞
何珊
郝伟丽
曹艳玲
机构
山西师范大学生命科学学院
出处
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第9期1582-1589,共8页
基金
国家自然科学基金(31970358)
山西省回国留学人员科研项目(2020-090)
山西省研究生教育创新项目(2020SY323)。
文摘
太行菊(Opisthopappus taihangensis)、长裂太行菊(O.longilobus),为太行山特有多年生崖壁草本植物,菊科(Compositae)重要野生资源,具有较高的经济与生态价值。为确定适合两物种的全基因组测序策略,该研究利用流式细胞法和高通量测序技术,分析两物种基因组大小、杂合率、重复序列及GC含量等信息。结果表明:(1)流式细胞法估算太行菊基因组大小约为2.1 Gb,长裂太行菊基因组大小约为2.4 Gb。(2)高通量测序修正后太行菊基因组大小为3.13 Gb,重复序列比例为84.35%,杂合度为0.99%,GC含量为36.56%;长裂太行菊基因组为3.18 Gb,重复序列比例为83.83%,杂合度为1.17%,GC含量为36.62%。(3)初步组装后GC含量分布及平均深度存在异常,出现分层现象,可能是两物种基因组杂合率较高所致。综上结果表明,太行菊、长裂太行菊均属于高重复、高杂合、大基因组的复杂基因组,建议使用Illumina+PacBio测序组装策略,进行全基因组测序分析。
关键词
太行菊
长裂太行菊
基因组调查
基因组大小
高通量测序
Keywords
Opisthopappus taihangensis
O.longilobus
genome survey
genome size
high-throughput sequencing
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
气候因素对大果榆分布的影响
被引量:
1
2
作者
叶航
王智
侯慧敏
武佳慧
高悦
韩伟
臧恩
王祎玲
机构
山西师范大学生命科学学院
出处
《常熟理工学院学报》
2020年第2期118-124,共7页
文摘
气候是决定植被类型和分布的主要因素之一,气候变化会导致植物分布区和植物群落结构发生改变.大果榆(Ulmus macrocarpa Hance)属于榆科(Ulmaceae)榆属(Ulmus L.)植物,具有较高的经济价值与医用价值,是榆科植物中重要的种质资源.本文利用基于最大熵模型(Maximum Entropy)的MaxEnt软件和GIS分析技术,对大果榆在当代气候背景条件下的适生区与潜在分布区进行预测分析.结果表明:模型具有良好的模拟结果,当前大果榆潜在分布区主要集中在山西、陕西、河北、河南等地区.影响大果榆分布的主效生态因子有年平均温、月均气温变化范围、等温性、温度季节性变化方差、年平均降水量、最湿润月降水量和降水季节性变化方差,其累计贡献率达99.9%.根据大果榆预测分布概率将其划分为4个气候适宜性等级.基于气候适宜性等级分组的PCA结果表明:PC1(77.25%)与PC2(22.70%)总共可以解释99.95%的大果榆种群气候差异.非参检验和多因素方差检验结果表明不同分组间的气候条件存在显著差异(P<0.05).本文研究结果为大果榆生态适宜区的界定与保护提供了理论基础,对大果榆种质资源的开发与合理利用具有指导意义.
关键词
大果榆
气候因子
MAXENT
预测分布
适生区域
Keywords
Ulmus macrocarpa Hance
climate factor
MaxEnt
predictive distribution
suitable distribution region
分类号
Q948 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
化龙山七筋姑种内二倍体与四倍体表型分化分析
3
作者
张昊
臧恩
高悦
韩伟
曹艳玲
王祎玲
机构
山西师范大学生命科学学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第12期2114-2121,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31970358)。
文摘
七筋姑(Clintonia udensis Trautv.et Mey.)属百合科(Liliaceae)七筋姑属(Clintonia Raf.),多年生草本,具有二倍体(2n=14)和四倍体(4n=28)两种倍性。在陕西化龙山地区,二倍体主要分布在南坡海拔2450 m处,四倍体主要生长在北坡海拔1900 m左右,成为研究种内多倍体分化的理想材料。该研究从七筋姑营养和繁殖系统出发,研究其不同倍性的表型分化,揭示不同倍性的生态适应特征,为阐明七筋姑种内多倍体的演化提供线索。研究表明:(1)在根、茎、叶、花、果实、种子的11个性状中,二倍体的果实体积性状最为稳定(CV=0.02),叶长性状遗传多样性最高(CV=0.85);四倍体中果实体积性状也最为稳定(CV=0.06),而花数量性状多样性最高(CV=0.42)。(2)四倍体的果实体积平均值明显高于二倍体,但种子数量平均值显著少于二倍体,果实体积和种子体积性状在不同倍性间的分化占比最高(Vst=0.69)。(3)四倍体营养器官表型性状的遗传变异丰富度低于二倍体,其平均变异系数(CV=0.16)小于二倍体的变异系数(CV=0.44);在繁殖系统表型性状中,四倍体的遗传变异丰富度高于二倍体,平均变异系数(CV=0.30)大于二倍体(CV=0.26)。(4)显著性分析表明,二倍体与四倍体表型性状差异显著(P<0.05),而繁殖系统性状在不同倍性间无显著差异(P>0.05);PCA分析同样显示二倍体与四倍体间存在明显差异。四倍体显著的表型差异是对低海拔环境长期适应的结果。
关键词
七筋姑
表型性状
多倍体
分化
化龙山
Keywords
Clintonia udensis
phenotypic traits
polyploid
differentiation
Hualong Mountains
分类号
Q944.1 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
落实部门职责分工 加强“瘦肉精”监管工作
4
作者
臧恩
出处
《农业知识(科学养殖)》
2011年第1期45-45,共1页
文摘
为进一步加强生猪质量安全监管,经国务院和中央机构编制委员会办公室同意,中央机构编制委员会办公室于2010年10月底印发了《关于进一步加强“瘦肉精”监管丁作的意见》,为进一步落实“瘦肉精”监管工作的部门职责分工,完善体制机制和崎管的全过程覆盖提供了组织保障。
关键词
“瘦肉精”
监管工作
职责分工
实部
机构编制
安全监管
生猪质量
办公室
分类号
S816 [农业科学—饲料科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
崖壁植物太行菊与长裂太行菊全基因组大小及特征分析
王祎玲
臧恩
张昊
刘志霞
兰亚飞
何珊
郝伟丽
曹艳玲
《广西植物》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
2
气候因素对大果榆分布的影响
叶航
王智
侯慧敏
武佳慧
高悦
韩伟
臧恩
王祎玲
《常熟理工学院学报》
2020
1
下载PDF
职称材料
3
化龙山七筋姑种内二倍体与四倍体表型分化分析
张昊
臧恩
高悦
韩伟
曹艳玲
王祎玲
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
下载PDF
职称材料
4
落实部门职责分工 加强“瘦肉精”监管工作
臧恩
《农业知识(科学养殖)》
2011
0
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职称材料
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