基于生物信息学分析细胞周期蛋白B1与肺腺癌患者预后及浸润性免疫细胞的关系

目的通过生物信息学探索细胞周期蛋白B1(CCNB1)与肺腺癌患者预后及浸润性免疫细胞的关系。方法从TCGA下载肺腺癌患者CCNB1基因转录表达数据及临床信息。通过临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)进一步研究肺腺癌中的CCNB1蛋白表达情况。受试者工作特征(ROC)曲线获取区分肺腺癌与邻近正常组织的CCNB1基因最佳截断值。利用单因素及多因素COX及Kaplan-Meier方法评估CCNB1与预后的关系。利用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用肿瘤免疫估计资源(TIMER)评估CNNB1基因与肿瘤浸润性免疫细胞的关系。结果CNNB1基因及蛋白在肺腺癌组织中的表达显著上调。CCNB1在男性、淋巴结转移、高TNM分期、吸烟、吸烟超过40年的患者中高表达,在年龄超过60岁的患者中低表达(P均<0.05)。Kaplan-Meier曲线表明,CCNB1高表达组的肺腺癌患者的预后比低表达组的患者更差[42.2个月vs 54.4个月,HR(95%CI):1.586(1.186~2.120),P=0.002],各亚组分析也显示了相同的结果。ROC曲线表明,区分肺腺癌与正常组织的最佳CCNB1值为3.483,AUC值为0.980(95%CI:0.967~0.993),其敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值及约登指数分别为98.3%、93.5%、62.4%、99.8%、91.8%。相关分析表明,CCNB1表达与CD4^(+)T细胞(r=-0.2,P<0.001)、B细胞(r=-0.255,P<0.001)及树突状状细胞(r=-0.124,P=0.006)的浸润丰度具有负相关性,与中性粒细胞(r=0.173,P<0.001)及CD8^(+)T细胞(r=0.109,P=0.015)浸润丰度具有正相关性。结论高表达的CCNB1与肺腺癌预后不良和免疫浸润显著相关,可作为预后生物标志物及免疫治疗的潜在靶点。