肝细胞癌中与m^(6)A相关的lncRNAs挖掘及DACH1在其预后的免疫特性

探讨N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m^(6)A)修饰相关长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)及细胞命运决定因子1(Dachshund homolog1,DACH1)对肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)预后及免疫浸润的影响.运用生物信息学方法构建DACH1与m^(6)A相关LncRNAs的风险模型、进行了聚类分析、免疫浸润和肿瘤微环境(Tumor micro-environment,TME)分析、评估了风险评分及临床相关性.研究结果表明,有56个与m^(6)A相关的LncRNAs参与了肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)的进展,通过单、多因素及LASSO回归分析,最终筛选出11个与DACH1表达最相关的m^(6)A相关联LncRNAs,包括:AC027097.1、LINC01138、LINC01224、DDX11-AS1、MKLN1-AS、AL031985.3、AC098484.1、AL158166.1、POLH-AS1、WAC-AS1和NRAV,这些LncRNAs与免疫细胞浸润有密切相关;进一步的RT-qPCR、WB和IHC实验结果显示,HCC细胞中DACH1的mRNA表达显著低于正常肝细胞;而正常肝细胞和肝组织中的DACH1蛋白表达水平明显高于HCC细胞;此外,用5-aza-2dc(甲基化抑制剂)处理HCC细胞后,细胞迁移距离显著缩短,提示DACH1去甲基化后,可能影响其抑癌功能.本研究通过生物信息学分析和实验验证发现了11个与DACH1表达相关的m^(6)A修饰LncRNAs,并且DACH1在HCC发生、发展及免疫浸润中扮演了关键的抑癌角色,为HCC的早期诊断及临床预后提供了理论依据.