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基于网络药理学和分子对接探讨苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病的作用机制 被引量:1
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作者 舒燕霞 郭江涛 +4 位作者 徐文芬 张永萍 孙开芬 石兴雨 曾令琴 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第22期5484-5492,共9页
目的运用网络药理学及分子对接技术,探究苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分和潜在作用机制。方法通过文献搜集苗药黑骨藤的化学成分,利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和Swiss ADME数据库筛选黑骨藤的主要活性成分,采用Swiss Tar... 目的运用网络药理学及分子对接技术,探究苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分和潜在作用机制。方法通过文献搜集苗药黑骨藤的化学成分,利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和Swiss ADME数据库筛选黑骨藤的主要活性成分,采用Swiss Target Prediction和SEA数据库预测活性成分的作用靶点。通过GeneCards、OMIM数据库检索AD相关靶点,经Venny2.1.0获取成分-疾病交集靶点,结合STRING数据库和Cytoscape3.8.0软件对交集靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析。再借助HIPLOT数据库对交集靶点进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。最后,利用AutoDock Tools1.5.6软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接。结果苗药黑骨藤的活性成分共24个,对应靶点574个,1513个AD靶点,交集靶点159个;GO分析得到2661条生物过程,587条分子功能,311条细胞成分;KEGG分析得到AD主要参与神经退行性疾病-多发性疾病途径、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症中的蛋白多糖等相关通路。分子对接结果显示,山柰酚、槲皮素、汉黄芩素、丹参酮ⅡA、杠柳苷元等与类固醇受体辅助活化因子(SRC)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)3、血管内皮生长因子(VEGF)A蛋白等具有较强结合能力。结论通过成分-靶点-通路网络及分子对接验证,筛选出黑骨藤抗AD的有效成分,并探究其抗AD作用机制,为苗药黑骨藤抗AD的新药开发和应用提供思路和理论依据。 展开更多
关键词 黑骨藤 网络药理学 分子对接 阿尔茨海默病
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基于网络药理学和分子对接探讨石吊兰治疗结核的作用机制
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作者 舒燕霞 刘趣 +3 位作者 徐文芬 孙庆文 李云超 陈亮 《贵州科学》 2023年第5期23-32,共10页
目的:探讨石吊兰治疗结核病的潜在活性成分及其作用机制。方法:借助Swiss ADME、PubChem、Swiss Target Prediction、SEA Search Server、UniProt等数据库检索石吊兰活性成分及其对应靶点,通过GeneCards、OMIM及Drugbank数据库检索结核... 目的:探讨石吊兰治疗结核病的潜在活性成分及其作用机制。方法:借助Swiss ADME、PubChem、Swiss Target Prediction、SEA Search Server、UniProt等数据库检索石吊兰活性成分及其对应靶点,通过GeneCards、OMIM及Drugbank数据库检索结核疾病相关靶点,并经Venny 2.1.0获取成分-疾病交集靶点。采用Cytoscape 3.9.1软件和String数据库进行“药物-成分-靶点”网络和蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析,并筛选PPI网络中的核心靶点。运用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过Cytoscape 3.9.1软件构建“成分-靶点-通路”网络。最后,利用AutoDock Tools 1.5.7软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接。结果:共筛选出石吊兰的活性成分30个、对应靶点510个、结核疾病相关靶点1050个、活性成分与结核病的交集靶点119个。PPI网络共筛选得核心靶点36个,包括STAT3、MAPK1、AKT1、TNF、SRC等。GO功能富集条目共558个(P<0.05),其中生物过程353个、分子功能114个、细胞组分91个;KEGG通路富集分析共得到156个条目(P<0.05),主要涉及癌症、甲型流感、糖尿病中AGE-RAGE、乙型肝炎、结核等信号通路。分子对接结果显示,石吊兰中石吊兰素、去甲氧基苏打基亭、5,7,3′-二羟基-6,8,4′-三甲氧基黄酮、槲皮素等活性成分与STAT3、MAPK1、AKT1等蛋白的结合能均小于-5 kcal·mol^(-1),均具有较强的结合活性。结论:本研究初步探讨了石吊兰抗结核的活性成分及相关信号通路,其作用机制涉及多个靶点基因及通路,与中药多成分、多靶点、多通路协同作用的治病特点不谋而合,为石吊兰抗结核的进一步研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 石吊兰 结核病 网络药理学 分子对接 作用机制
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大孔吸附树脂分离纯化红禾麻总黄酮工艺的优化 被引量:7
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作者 孙开芬 陈胤睿 +2 位作者 徐文芬 舒燕霞 石兴雨 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期2619-2623,共5页
目的 优化大孔吸附树脂分离纯化红禾麻总黄酮工艺。方法 选择D101、HP20、HPD300、HPD722、AB-8型树脂,测定它们对总黄酮的吸附率、解吸率。以吸附率、比吸附量为指标,单因素试验优化上样液质量浓度、径高比、上样体积、上样体积流量、... 目的 优化大孔吸附树脂分离纯化红禾麻总黄酮工艺。方法 选择D101、HP20、HPD300、HPD722、AB-8型树脂,测定它们对总黄酮的吸附率、解吸率。以吸附率、比吸附量为指标,单因素试验优化上样液质量浓度、径高比、上样体积、上样体积流量、洗脱液体积分数、洗脱液体积、洗脱体积流量。结果 D101型树脂具有较好的吸附与洗脱效果。最佳条件为径高比1∶7,上样体积流量4 mL/min,上样体积50 mL,9 BV水除杂,12 BV 70%乙醇洗脱,洗脱体积流量1 mL/min。总黄酮质量分数从7.04%升至23.89%,固形物含量从1.50 g降至0.38 g。结论 D101型大孔吸附树脂适合分离纯化红禾麻总黄酮。 展开更多
关键词 红禾麻 总黄酮 分离纯化工艺 大孔吸附树脂
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双羊喉痹通颗粒HPLC指纹图谱及4个成分含量测定
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作者 陈贇 曾令琴 +4 位作者 徐文芬 赵武霞 刘趣 张敏杰 舒燕霞 《中药材》 CAS 北大核心 2022年第8期1919-1923,共5页
目的:建立双羊喉痹通颗粒HPLC指纹图谱,并进行多指标成分同时定量分析。方法:采用HPLC法建立双羊喉痹通颗粒的指纹图谱,并对10批样品指纹图谱进行相似度评价,以相应对照品进行共有峰指认,并通过与该制剂原药材的相关性分析进行共有峰归... 目的:建立双羊喉痹通颗粒HPLC指纹图谱,并进行多指标成分同时定量分析。方法:采用HPLC法建立双羊喉痹通颗粒的指纹图谱,并对10批样品指纹图谱进行相似度评价,以相应对照品进行共有峰指认,并通过与该制剂原药材的相关性分析进行共有峰归属。同时以没食子酸、岩白菜素、绿原酸、木犀草苷4个成分为指标,建立其含量测定方法。结果:10批样品指纹图谱标定18个共有峰,通过与对照品比对,指认2号峰为没食子酸,6号峰为岩白菜素,7号峰为咖啡酸,8号峰为绿原酸,12号峰为木犀草苷,15号峰为异绿原酸A,16号峰为异绿原酸C。上述4个成分含量分别为0.051~0.135 mg/g、0.568~0.672 mg/g、0.044~0.084 mg/g、0.042~0.126 mg/g。结论:该研究建立的双羊喉痹通颗粒HPLC指纹图谱和多指标成分含量同时测定方法专属性强,重复性好,简便可靠,能较全面地反映该制剂的内在质量,可用于双羊喉痹通颗粒的质量控制和评价。 展开更多
关键词 双羊喉痹通颗粒 指纹图谱 多指标含量测定 质量控制 高效液相色谱法
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苗族药红禾麻生态适应性及品质区划分析 被引量:1
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作者 舒燕霞 孙开芬 +3 位作者 徐文芬 陈胤睿 孙庆文 王波 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期160-169,共10页
目的:探索苗族药红禾麻潜在适宜分布区及其优质药材产区空间分布状况。方法:基于200个红禾麻分布位点及120个生态因子,利用最大熵模型(MaxEnt)及地理信息系统(ArcGIS)软件预测其潜在适生区。采用高效液相色谱法(HPLC)测定33批黔产红禾... 目的:探索苗族药红禾麻潜在适宜分布区及其优质药材产区空间分布状况。方法:基于200个红禾麻分布位点及120个生态因子,利用最大熵模型(MaxEnt)及地理信息系统(ArcGIS)软件预测其潜在适生区。采用高效液相色谱法(HPLC)测定33批黔产红禾麻中芦丁、山柰酚-3-O-芸香糖苷、槲皮苷的含量,结合前期所测药材总多糖、总黄酮的含量数据,分析红禾麻主要药效成分与生态因子的相关性,并借助ArcGIS中协同克里金插值法进行品质区划。结果:红禾麻在我国最适分布区为云南、贵州、四川、湖南及湖北等地,其高、中适生区面积占总分布面积的59.48%。影响红禾麻生长分布的主要生态因子为10月降水量、坡度、冷季最低温、海拔、6月太阳辐射强度及4月降水量;温度、辐射强度、降水量、土壤组分及性质等对红禾麻次生代谢产物的积累影响较大。红禾麻药材品质研究结果表明,其高品质区主要包括贵州省雷山县、凯里市、清镇市、平坝县、惠水县、龙里县、开阳县及江口县等地。结论:红禾麻在国内分布区域广,但适宜分布区主要集中在西南部及华中部分地区,贵州境内红禾麻种植基地可优选黔东南及黔中地区的部分县市。该研究对红禾麻潜在适生区及其在贵州的最佳种植区进行了预测,可为红禾麻引种栽培及规模化种植选址提供科学参考。 展开更多
关键词 最大熵模型(MaxEnt) 地理信息系统(ArcGIS) 红禾麻 适宜性评价 品质区划 空间插值
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