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题名iPath在生物海洋学中的应用
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作者
舒王欣泽
孙军
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机构
山东大学海洋研究院
天津科技大学印度洋生态系统研究中心
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出处
《海洋通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期581-593,共13页
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基金
国家自然科学基金(41876134,41676112)
天津市自然科学重点基金(17JCZDJC40000)
+2 种基金
天津市“131”创新群体项目(20180314)
天津市高等学校创新团队培养计划(TD12-5003)
长江学者奖励计划(T2014253)。
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文摘
iPath是一个用于细胞路径可视化和代谢途径分析的免费网页应用程序。iPath中的路径是通过交互式浏览器查看的,它提供各种代谢途径的直接导航,使人们能够方便地访问相关的化合物和酶。本文简要介绍了最新的iPath3.0版本(http://pathways.embl.de)(基于4个KEGG的全局地图,158个传统的KEGG路径图,192个KEGG模板,以及其他代谢元素,组成了一个相互连接、手工绘制的代谢网络),并举例说明其在生物海洋学研究中的应用,以期引起国内学者对此工具的重视,促进其在生物海洋学研究中的应用。
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关键词
iPath
代谢途径
可视化
KEGG路径
组学
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Keywords
iPath
metabolic pathways
visualization
KEGG pathway
omics
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分类号
Q819
[生物学—生物工程]
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