一起由副溶血性弧菌引起的食物中毒事件的病原检测及溯源分析

目的:对一起农村自办婚宴发生的食物中毒事件进行病原检测及溯源分析。方法:对采集的粪便、肛拭子、手涂抹样等样本进行病原学检测,对检出的副溶血性弧菌进行血清凝集、3种毒力基因检测、MIC药敏试验和PFGE分型。结果:该起食物中毒事件共涉及10例病例,发病时间较集中,首末病例发病时间间隔4.75 h,患者主要症状为腹痛、腹泻、恶心、呕吐等。采集的样本中共检出5株副溶血性弧菌,分为3种血清型,4种PFGE型,毒力基因均为tlh+tdh+trh-,对头孢唑啉全部耐药。结论:该起农村自办婚宴食物中毒事件由副溶血性弧菌感染引起。

6起副溶血性弧菌食源性疾病聚集事件分离株病原学特征分析

目的:分析北京市昌平区2018—2019年6起副溶血性弧菌食源性疾病聚集事件分离株的血清型、耐药性、毒力基因和分子特征。方法:对6起事件中的23株副溶血性弧菌进行血清学分型、毒力基因检测、微量肉汤稀释药敏实验和脉冲场凝胶电泳。结果:21株人源分离株鉴定为3种血清型(O3:K6、O4:K8和O4:KUT),主要为O3:K6型,毒力基因均为tlh^(+)、tdh^(+)、trh^(-);2株食品分离株血清型为O8:K20,毒力基因为tlh^(+)、tdh^(-)、trh^(-)。药敏结果显示,对头孢唑啉12株菌敏感,5株耐药,6株中介;对氨苄西林1株菌中介,其余菌株敏感;对其他15种抗生素23株菌均敏感。PFGE聚类分析显示,23株副溶血性弧菌分为8种PFGE带型,5起事件的人源分离株属于优势PFGE带型PT06。结论:6起事件中的副溶血性弧菌血清型主要为O3:K6,多数菌株属于优势带型PT06,无多重耐药菌出现,人源分离株均携带毒力基因tlh和tdh。

新型冠状病毒核酸检测混采阳性样本的溯源检测和分析

目的对某新型冠状病毒(以下简称新冠病毒)核酸检测阳性的混采鼻咽拭子样本进行溯源检测和分析,为新型冠状病毒感染(以下简称新冠感染)疫情大规模核酸筛查混采阳性样本的溯源提供参考。方法用实时荧光RTPCR方法对某一批次混采A+B组2合1鼻咽拭子新冠病毒核酸阳性样本及同批次复核C、D单管鼻咽拭子新冠病毒核酸阳性样本进行复测,并对混采A+B组阳性样本进行污染鉴定、突变株检测和全基因组测序实验。将测序结果与同批次检出的C、D单管阳性样本序列进行比对分析。结果A+B组混采及单管C、D单管样本复测均阳性;A+B混采样本排除DNA污染;A+B混采样本及C、D单管阳性样本中新冠病毒均为德尔塔变异株类似株(B.1.617.2突变株),全基因组序列一致性为100%,这三件阳性样本的病毒来源一致。结论新冠感染疫情大规模人群核酸筛查出现混采阳性而复核单管阴性时,需利用多种实验方法对混采阳性和其他相关样本检测,结合流调资料进行溯源分析,降低感染病例漏检率。

健康人与腹泻患者粪便标本中金黄色葡萄球菌检出情况及特征分析

目的了解北京市昌平区健康人与腹泻患者粪便标本中金黄色葡萄球菌(SA)检出情况,及其肠毒素分布、耐药类型和PFGE型别。方法对2018年549份健康人和704份腹泻患者的粪便标本进行SA菌检测,并对菌株进行肠毒素(SEs)/类肠毒素(SEls)、耐药和PFGE分型检测。结果SA菌检出率健康人为17.12%,腹泻患者为11.93%,差异有统计学意义(χ^(2)=6.82,P<0.01)。腹泻患者来源SA菌SEs/SEls基因总检出率为70.24%,健康人为53.19%,差异有统计学意义(χ^(2)=5.43,P=0.02);腹泻患者来源SA菌中sea、seg、sei、seln、selx、sely等基因检出率均高于健康人(P值均<0.05)。健康人来源和腹泻患者来源SA菌均对青霉素耐药率最高,其次为红霉素和克林霉素。腹泻患者检出10株MRSA菌,检出率11.90%,健康人检出12株,检出率12.77%,差异无统计学意义(χ^(2)=0.03,P=0.86)。PFGE分析显示,两种来源SA菌的PFGE带型散在分布,呈多样性。结论北京市昌平区健康人/腹泻患者来源SA菌携带多种肠毒素基因,存在不同程度的耐药性和多重耐药现象,且出现MRSA菌株,PFGE带型多样。

微生物检测技术在生活饮用水检验中的应用研究

微生物存在于自然界的水体中,如湖泊、河流和地下水等,可能对人体健康造成严重威胁。基于此,本文论述了生活饮用水微生物检验的重要性,探讨了微生物检测技术在生活饮用水检验中的价值,并提出了相关检测方法,旨在普及相关领域知识,增强人们饮用水安全意识。

儿童诺如病毒性胃肠炎的治疗和预防

诺如病毒性胃肠炎主要是通过接触感染者及食用被病毒污染的水、食物等引起传播。诺如病毒所致的急性肠胃炎属于自限性疾病,但诺如病毒具有潜伏期短、变异快、环境抵抗力强、传播途径多样的特点,对于儿童群体来说,具有群体暴发、反复感染、反复发病的风险性。本文针对诺如病毒所致的儿童急性肠胃炎的治疗和预防措施进行介绍。

北京市昌平区临床分离沙门菌株分子分型与耐药分析

目的了解北京市昌平区沙门菌临床菌株血清型、分子特征及耐药性。方法对2017年昌平区分离的沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果42株沙门菌主要血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。PFGE分析得到31种PFGE带型,菌株相似系数为56.9%~100.0%。沙门菌对萘啶酸、链霉素、氨苄西林和磺胺异恶唑的耐药率较高,分别为57.14%、42.86%、40.48%和40.48%;19株(45.24%)沙门菌同时耐受3种及以上抗生素。结论北京市昌平区引起腹泻的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,对萘啶酸、磺胺异恶唑、链霉素和氨苄西林等抗生素耐药率高,多重耐药严重,且PFGE带型呈高度多态性。

2012-2019年北京市昌平区散发腹泻病例四种病毒监测结果分析

目的对北京市昌平区2012-2019年散发腹泻病例4种病毒监测结果进行分析,了解其流行特征。方法采集此期间辖区2家哨点医院肠道门诊散发腹泻病例便样本960份,提取核酸后用实时荧光RT-PCR方法检测A组轮状病毒、GⅠ/GⅡ组诺如病毒、星状病毒和肠道腺病毒,用描述性流行病学方法从时间、性别和年龄分布分析其流行特征。结果960份便样本的病毒总检出率为32.29%(310/960),GⅠ/GⅡ组诺如病毒、A组轮状病毒、星状病毒和肠道腺病毒检出率分别为18.96%(182/960)、10.63%(102/960)、1.98%(19/960)和0.73%(7/960);在不同年份、性别和年龄组中,均为GⅠ/GⅡ组诺如病毒检出率最高,A组轮状病毒次之;GⅠ/GⅡ组诺如病毒春季检出率最高(28.33%,68/240),冬季次之(22.50%,54/240);A组轮状病毒冬季检出率最高(25.42%,61/240),春季次之(9.58%,23/240)。结论GⅠ/GⅡ组诺如病毒和A组轮状病毒是北京市昌平区冬春季散发腹泻病例的主要病原。

北京市昌平区2012—2016年肠集聚性黏附大肠埃希氏菌耐药性、毒力基因及分子特征

目的了解昌平区肠集聚性黏附大肠埃希氏菌(EAEC)耐药性、毒力基因携带情况及分子特征。方法对2012—2016年北京市昌平区分离的15株EAEC毒株进行复核;以药敏实验检测菌株对16种抗菌药物的耐药性;以PCR法检测8种毒力的携带情况;采用多位点序列分型(MLST)及脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)进行分子分型分析。结果 15株EAEC耐药率为100.0%,耐多药率为80.0%。每株携带2~5个毒力基因,共有10种毒力基因谱;8个毒力基因阳性率由高到低分别为aap(100.0%)、CVD432(93.3%)、aggA(60.0%)、agg3A(40.0%)、astA(33.3%)、pic(20.0%)、aafA(13.3%),未检出pet阳性。MLST分型分析将15株EAEC菌分为9个ST型,其中有4个新ST型(STcpEC1、STcpEC2、STcpEC3、STcpEC4),以STcpEC1为优势ST型(占33.3%)。PFGE分析得到13种PFGE带型,相同ST型菌株PFGE带型、毒力基因相似系数均较高。结论北京市昌平区近5年EAEC菌耐药率、多重耐药率较高,毒力基因aap、CVD432、aggA检出率高,STcpEC1为优势ST型,PFGE带型具有高度多态性。

多重巢式PCR应用于1起聚集性发热疫情的病原诊断

目的增强实验室对突发发热疫情的快速诊断能力,完善、优化聚集性发热的病原检测方法。方法采用多重巢式PCR扩增法,对1起聚集性发热疫情样本进行病原筛查,同时对扩增产物测序,进行BLAST比对,进行血清型分型,比较不同引物的扩增效果。结果采集7份病例咽拭子标本,以呼吸道病毒核酸多重联检试剂盒进行14种病毒筛查,其中4份为腺病毒阳性,阳性率为57.1%。采用3组巢式引物进行扩增,腺病毒阳性样本6份,均为腺病毒3型;测序成功的5株核苷酸、蛋白质序列同源性均为100.0%。第3组巢式引物扩增、分析效果较好,阳性率为71.4%。结论成品试剂盒可进行不明原因发热疫情的病原筛查;多重巢式PCR扩增法可增加病毒检出率,对病毒分型和序列分析。

1株分离于肿物积液的单增李斯特菌的病原学特点及分子特征

目的了解1株分离于肿物积液的单增李斯特菌的病原学特点和分子特征。方法对该菌株进行血清型、毒力基因、耐药性、脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)等分析。结果该菌株属于1/2b血清型、ST87型,携带12种毒力基因(actA,hlyA,prfA,flaA,plcA,plcB,Inl 1A,Inl 1B,Inl 1C,Inl J,iap,Mpl)。该菌株与LM263(江苏)、LM417(上海)的PFGE带型一致,与2株北京分离株(LM188、LM403)的PFGE带型相差一条带,相似性为95%。该菌株对青霉素G、苯唑西林、氨苄西林、头孢克洛、头孢噻肟、克拉霉素等6种抗生素耐药,对其他18种抗生素敏感或中介。结论该菌株属于引起李斯特菌病的常见血清型(1/2b)和ST型(ST87),具有强致病性,其PFGE型别已在中国其他地区出现。该菌对青霉素类抗生素耐药,应选用其他药物进行治疗。

北京市昌平区2016年健康人群脑膜炎奈瑟菌携带状况、血清群及药物敏感性

目的了解2016年北京市昌平区健康人群中脑膜炎奈瑟菌的携带率和血清群分布,以及对抗生素的敏感性。方法参照《流行性脑脑膜炎奈瑟菌诊断标准》WS 295—2008进行菌株分离及鉴定,用PCR法对菌株进行血清分群,用K-B纸片法对菌株进行抗生素药物敏感性实验,对分离的其他口腔细菌进行16SrRNA测序鉴定。结果收集2016年昌平区2016年9—10月健康人群咽拭子共计252份,分离得到11株(4.37%)脑膜炎奈瑟菌(Nm):属于4个血清群,依次为B群(6株),W135群(3株),C群(1株),X群(1株);抗生素药敏试验结果表明,对头孢噻肟,头孢曲松,美罗培南,利福平完全敏感(100.00%),对环丙沙星,复方新诺明完全耐药(100.00%);27.27%的菌株对四环素耐药,54.55%的菌株对头孢西丁耐药,36.36%的菌株对阿奇霉素不敏感。结论昌平区健康人群携带脑膜炎奈瑟菌以B群为主,对头孢类,碳青霉烯类,安莎霉素类药物敏感,对氟喹诺酮类,磺胺类耐药,并出现对大环内酯类药物不敏感菌株。

北京市昌平区副溶血性弧菌临床分离株病原学特征与耐药分析

目的了解北京市昌平区副溶血性弧菌血清型分布、分子流行病学特征、毒力基因携带情况等病原学特征及耐药性。方法对2015—2019年北京市昌平区分离到的134株副溶血性弧菌进行血清分型、多位点序列分型(MLST)、3种毒力基因(tlh、tdh、trh)荧光PCR检测和12种抗生素耐药性分析。结果134株菌共分为13个血清型,以O3:K6血清型为主(73.88%);共鉴定出31个ST型,以ST655(59.70%)为主;共分为两种毒力基因谱,以tlh+tdh+trh-(94.78%)为主;对头孢唑啉耐药率(97.01%)最高,其次为氨苄西林(56.72%)。结论北京市昌平区引起腹泻的副溶血性弧菌有较严重的耐药性,血清型以O3:K6为主,ST型以ST655为主,多数菌株毒力基因为tlh+tdh+trh-。

2020-2021年北京市昌平区诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情流行病学特征

目的 分析2020-2021年北京市昌平区诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情流行特征,为科学制定诺如病毒急性胃肠炎疫情防控措施提供依据。方法 收集2020-2021年北京市昌平区诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情流调和临床资料,用实时荧光PCR方法检测诺如病毒;采用描述性的流行病学方法,分析疫情三间分布等流行病学特征。结果2020-2021年北京市昌平区共报告51起诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情,疫情样本中诺如病毒检出率为20.08%(303/1 509);诺如病毒疫情冬季高发,发生在冬季的疫情占52.94%(27/51),其中12月占50.98%(26/51);城乡结合部的2个镇发生疫情起数最多,占47.06%(24/51),不同地区罹患率差异有统计学意义(χ^(2)=653.553,P<0.05);托幼机构发生疫情起数最多,占58.82%(30/51),不同人群罹患率差异有统计学意义(χ^(2)=797.526,P<0.05);病例最常见的症状是呕吐,占78.61%(305/388),呕吐、腹泻和发热症状在不同人群间差异有统计学意义(P均<0.05)。结论 城乡结合部和托幼机构更易发生诺如病毒疫情;一年四季均有诺如病毒疫情发生,冬季高发,12月为流行高峰;病例以呕吐为主要临床表现。

北京市昌平区食源性金黄色葡萄球菌药敏分析及分子流行病学特征研究

目的对北京市昌平区2011 2014年分离获得的74株食源性金黄色葡萄球菌耐药谱、毒力因子编码基因携带情况和分子流行病学特征进行研究分析,为金黄色葡萄球菌食源性疾病的预防控制提供参考。方法依据GB 4789.10-2010进行菌株分离和鉴定,用全自动微生物鉴定及药敏分析系统VITEK2 Compact进行16种药物敏感性试验,并使用检测试剂盒进行β-内酰胺酶的检测;利用PCR方法检测分离菌株肠毒素,杀白细胞素和耐热磷酸酶等毒力因子编码基因;脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对分离株进行分子分型。结果 74株金黄色葡萄球菌中68株(91.89%)有不同程度的耐药,其中对青霉素耐药率(87.84%)最高,其次为红霉素(44.59%)和克林霉素(39.19%)。毒力因子检测结果显示肠毒素阳性率64.86%(48/74),产2种以上肠毒素菌株占72.92%(35/48)。耐热磷酸酶阳性率89.19%,杀白细胞素编码基因luk F阳性率77.03%。PFGE分型结果显示除9株菌不可分型外,其余65株菌分为40个不同型别,无优势型别。结论昌平区2011 2014年分离的食源性金黄色葡萄球菌具有较强的耐药性、分子多态性和毒力因子携带率较高的特征,说明这些菌株可以导致潜在的食品安全问题。

北京市昌平区2010-2015年市售食品中单核细胞增生李斯特菌污染状况分析

目的了解北京市昌平区市售食品中单核细胞增生李斯特菌污染状况,为政府部门有效监管提供技术支持。方法 2010-2015年,在辖区内农贸市场、超市/便利店和餐饮单位抽取12类368件食品样品进行单核细胞增生李斯特菌检测。结果 368件食品样品中检出单核细胞增生李斯特菌16株,总检出率为4.35%。其中,不同类别食品中生禽肉检出率最高(25.71%),其次是生畜肉(11.11%)和鲜冻水产品(6.67%);各季度样品中三季度样品检出率最高(7.41%),其次是二季度(4.11%),一、四季度样品未检出;农贸市场、超市/便利店和餐饮单位等不同销售场所样品检出率分别为4.85%、4.11%和4.20%。结论 2010-2015年北京市昌平区市售生禽肉、生畜肉和鲜冻水产品存在单核细胞增生李斯特菌污染,且以三季度污染较为突出。

2013-2019年北京市昌平区霍乱弧菌病原学和分子流行病学特征分析

目的了解2013—2019年北京市昌平区霍乱弧菌表型及其分子特征。方法采用常规培养方法对2013—2019年北京市昌平区疑似霍乱标本进行检测。对分离鉴定的O1群小川型霍乱弧菌,用NotⅠ和SfiⅠ两种内切酶进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)、用荧光PCR和普通PCR进行9种毒力基因检测,用微量肉汤稀释法进行21种药物敏感试验。结果 2013—2019年北京市昌平区共分离到29株O1群小川型霍乱弧菌,其中散发病例中分离到10株,一起聚集性疫情中分离到19株。29株菌经NotⅠ和SfiⅠ双酶切后可分成3种PFGE谱型(CP-01~03),3种PFGE谱型间的相似系数为78.50%~100.00%,以CP-02为主(27/29,93.10%)。所有菌株均不携带ctxAB基因,携带toxR和hlyA基因,其他毒力基因ompU、tcpA、tcpI、rtxC、zot和ace的携带率分别为89.66%、82.76%、82.76%、44.83%、6.90%和6.90%。29株菌药敏结果,除头孢唑啉(0.00%)和链霉素(3.45%)敏感率极低外,对其他19种抗菌素为敏感(82.76%~100.00%)。结论 2013—2019年北京市昌平区的O1群小川型霍乱弧菌为非产毒株,以PFGE谱型CP-02为主,毒力基因toxR和hlyA携带率高,对多数抗生素敏感,提示在防控工作中应关注此类菌株并制定相应的方针政策,减少疫情的发生。

北京市昌平区食源性单增李斯特菌特征分析

目的了解北京市昌平区食源性单增李斯特菌(Lm)的毒力基因携带情况、抗生素敏感性及分子特征。方法对2010-2016年12类食品中分离的22株Lm进行血清型、毒力基因、抗生素敏感性、多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。结果 22株Lm分为5种血清型(以1/2c、3a血清型为主);19种毒力基因携带谱(T1~T19),毒力基因阳性数为6~12个;对氨苄西林、青霉素、美罗培南、复方新诺明、万古霉素和环丙沙星敏感,出现对四环素、红霉素耐药菌株;分为8个序列型(ST)(包括7个新型STA1~STA7),STA3为主要型别;分为17种PFGE带型,其相似系数为63.5%~100.0%,PTⅠ为主要PFGE带型。结论昌平区食源性Lm以1/2c、3a血清型为主,STA3为主要型别,PTⅠ为主要PFGE带型,其毒力基因的携带具有差异性,出现对四环素、红霉素耐药株,为食源性Lm的研究提供了参考。

北京市昌平区农村生活饮用水微生物污染状况调查

目的研究北京市昌平区农村生活饮用水污染状况及常见微生物分布情况,为我国生活饮用水国家标准的修订、完善提供基础数据,从而保障农村居民生活饮水安全。方法 2016年5-8月采集北京市昌平区75个自然村自备井的水源管网末梢水和出厂水,共计105份水样,进行菌落总数、总大肠菌群、耐热大肠菌群、大肠埃希菌、霉菌和酵母、铜绿假单胞菌、克罗诺杆菌、粪链球菌、嗜水气单胞菌和致泻性大肠埃希菌等微生物的检测。结果昌平区农村生活饮用水菌落总数、总大肠菌群、耐热大肠菌群和大肠埃希菌检测合格率分别为96.19%(101/105)、70.48%(74/105)、87.62%(92/105)和89.52%(94/105),四项指标总合格率为68.57%(72/105),其他微生物检出率为67.62%(71/105),主要为铜绿假单胞菌35.24%(37/105)。结论北京市昌平农村地区自备井生活饮用水存在微生物污染问题,除《生活饮用水卫生标准》中规定的微生物指示菌污染外,还有铜绿假单胞菌、嗜水气单胞菌及不动杆菌等污染,因此除加强我国国家标准中规定微生物指示菌污染控制外,也要加强其他可能有致病性的水源性微生物控制,以减少水源性传染病的暴发和流行。

2016年北京市昌平区A组乙型溶血性链球菌及相关菌株检测和分析

目的对2016年北京市昌平区猩红热病原学监测结果进行分析。方法利用qPCR方法与传统划线分离方法检测病例携带A组乙型溶血性链球菌(GAS)的阳性率,对分离出的GAS进行emm分型。利用16S rRNA和梅里埃VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析系统对检测出的非GAS菌株进行鉴定。结果 2016年昌平区采集的132份病例样本中,通过平板划线分离检出GAS 13株(阳性率9.85%),通过qPCR检出GAS 19株(阳性率14.39%)。分离出的GAS的emm型别为emm1和emm12。分离出可培养的非GAS菌种63株,分属于5个不同菌属,共计13种菌种。结论昌平地区GAS的emm型别较为单一,利用qPCR方法比平板划线分离方法更敏感,检测出的阳性GAS率更高。通过分离咽拭子中其他菌株,同时使用16S rRNA方法和梅里埃VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析鉴定,两者阳性率有差异,16S rRNA方法更准确。