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嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖及促生长特性相关基因挖掘
被引量:
1
1
作者
苏仪梅
孙安妮
+3 位作者
黄毓燕
杨婷婷
李杨瑞
邢永秀
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第10期2831-2843,共13页
【目的】挖掘嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖和促生长特性相关基因,为探究其促生长作用机制提供理论参考。【方法】利用Nanopore测序技术平台对CA1菌株进行全基因组测序,将其基因组序列与GO、NR、KEGG、COG等数据库进行比对,获得基因功能注释...
【目的】挖掘嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖和促生长特性相关基因,为探究其促生长作用机制提供理论参考。【方法】利用Nanopore测序技术平台对CA1菌株进行全基因组测序,将其基因组序列与GO、NR、KEGG、COG等数据库进行比对,获得基因功能注释信息,挖掘分析其功能特异性基因;使用基质培法收集甘蔗根系分泌物,并分析根系分泌物对菌株CA1的趋化性、生物膜形成和定殖相关基因表达的影响。【结果】嗜麦芽窄食单胞菌CA1基因组大小为4371327 bp,携带6个质粒,GC含量64.58%,其中4696个基因被注释预测,包括4525个蛋白编码基因、87个tRNA、13个rRNA和1个tmRNA。GO、COG、KEGG和NR数据库分别成功注释2795、2078、2494和2584个基因。该菌基因组含有细菌趋化性(cheA、cheV、cheY)、生物膜形成(flhA、flk、flgG)、细菌黏附(pgaA、mrkD)、嗜铁(fes、fepA、fecA)、合成氨(gltP、gltB、gltD)和磷酸盐代谢(phoR、phoB、pstA)等促进植物生长和定殖相关的基因。趋化性试验结果显示,与对照组相比,根系分泌物处理下的菌落数显著增加(P<0.05,下同),且cheA、cheV和cheY基因的相对表达量显著升高,CA1生物膜形成显著增加。【结论】甘蔗根系分泌物有助于菌株CA1的趋化性及生物膜形成,提高与趋化性相关基因的表达量。菌株CA1基因组含有多个与促生长和定殖特性相关的基因,是其促生长特性的分子基础,细菌的趋化性和生物膜的形成是其定殖的关键步骤,根系分泌物有利于菌株的定殖。
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关键词
嗜麦芽窄食单胞菌
根系分泌物
趋化性
生物膜
全基因组
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职称材料
玉林红菇的综合开发利用现状研究
被引量:
3
2
作者
欧财篮
陈秋杏
+3 位作者
苏仪梅
牛俊奇
张玉
吴小青
《现代园艺》
2021年第1期95-96,167,共3页
红菇属于红菇目红菇科,是药食两用的野生菌。红菇含有丰富的氨基酸、多糖、脂肪酸、甾醇和多种人体必需的矿质元素,不仅具有美容养颜、滋阴补肾、产后补血之功效,而且具有抑菌、抗氧化、抗癌等功效,具有很高的食用和药用价值,发展前景...
红菇属于红菇目红菇科,是药食两用的野生菌。红菇含有丰富的氨基酸、多糖、脂肪酸、甾醇和多种人体必需的矿质元素,不仅具有美容养颜、滋阴补肾、产后补血之功效,而且具有抑菌、抗氧化、抗癌等功效,具有很高的食用和药用价值,发展前景广阔。综述了红菇的生长特性、种植方式、药用价值、食用方式和开发利用现状等方面,可为今后综合开发利用红菇资源提供理论指导。
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关键词
红菇
食用价值
利用现状
发展前景
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职称材料
题名
嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖及促生长特性相关基因挖掘
被引量:
1
1
作者
苏仪梅
孙安妮
黄毓燕
杨婷婷
李杨瑞
邢永秀
机构
广西大学农学院/广西高校作物栽培学与耕作学重点实验室
广西农业科学院甘蔗研究所/广西甘蔗遗传改良重点实验室/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第10期2831-2843,共13页
基金
国家自然科学基金项目(31971858)
广西甘蔗遗传改良重点实验室开放项目(19-185-24-K-03-01)。
文摘
【目的】挖掘嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖和促生长特性相关基因,为探究其促生长作用机制提供理论参考。【方法】利用Nanopore测序技术平台对CA1菌株进行全基因组测序,将其基因组序列与GO、NR、KEGG、COG等数据库进行比对,获得基因功能注释信息,挖掘分析其功能特异性基因;使用基质培法收集甘蔗根系分泌物,并分析根系分泌物对菌株CA1的趋化性、生物膜形成和定殖相关基因表达的影响。【结果】嗜麦芽窄食单胞菌CA1基因组大小为4371327 bp,携带6个质粒,GC含量64.58%,其中4696个基因被注释预测,包括4525个蛋白编码基因、87个tRNA、13个rRNA和1个tmRNA。GO、COG、KEGG和NR数据库分别成功注释2795、2078、2494和2584个基因。该菌基因组含有细菌趋化性(cheA、cheV、cheY)、生物膜形成(flhA、flk、flgG)、细菌黏附(pgaA、mrkD)、嗜铁(fes、fepA、fecA)、合成氨(gltP、gltB、gltD)和磷酸盐代谢(phoR、phoB、pstA)等促进植物生长和定殖相关的基因。趋化性试验结果显示,与对照组相比,根系分泌物处理下的菌落数显著增加(P<0.05,下同),且cheA、cheV和cheY基因的相对表达量显著升高,CA1生物膜形成显著增加。【结论】甘蔗根系分泌物有助于菌株CA1的趋化性及生物膜形成,提高与趋化性相关基因的表达量。菌株CA1基因组含有多个与促生长和定殖特性相关的基因,是其促生长特性的分子基础,细菌的趋化性和生物膜的形成是其定殖的关键步骤,根系分泌物有利于菌株的定殖。
关键词
嗜麦芽窄食单胞菌
根系分泌物
趋化性
生物膜
全基因组
Keywords
Stenotrophomonas maltophilia
root exudates
chemotaxis
biofilm
whole genome
分类号
S566.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
玉林红菇的综合开发利用现状研究
被引量:
3
2
作者
欧财篮
陈秋杏
苏仪梅
牛俊奇
张玉
吴小青
机构
玉林师范学院生物与制药学院
出处
《现代园艺》
2021年第1期95-96,167,共3页
基金
玉林市科技创新能力建设项目——桂东南特色野菜种质资源的调查和开发利用研究(玉市科能20183202)
大学生创新训练项目(202010606159和202010606228)。
文摘
红菇属于红菇目红菇科,是药食两用的野生菌。红菇含有丰富的氨基酸、多糖、脂肪酸、甾醇和多种人体必需的矿质元素,不仅具有美容养颜、滋阴补肾、产后补血之功效,而且具有抑菌、抗氧化、抗癌等功效,具有很高的食用和药用价值,发展前景广阔。综述了红菇的生长特性、种植方式、药用价值、食用方式和开发利用现状等方面,可为今后综合开发利用红菇资源提供理论指导。
关键词
红菇
食用价值
利用现状
发展前景
分类号
S646 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
嗜麦芽窄食单胞菌CA1定殖及促生长特性相关基因挖掘
苏仪梅
孙安妮
黄毓燕
杨婷婷
李杨瑞
邢永秀
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
玉林红菇的综合开发利用现状研究
欧财篮
陈秋杏
苏仪梅
牛俊奇
张玉
吴小青
《现代园艺》
2021
3
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职称材料
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