网络药理学研究发展的问题和对策

近年来,以整体、系统为特征的网络药理学在中医药的研究发展中发挥了重要作用,开展了中药及其复方的多成分、多靶标和多效应的研究,并在预测药物靶标、药效机制、毒理和治疗适应疾病、了解药物和疾病的生物学基础以及寻找疾病、证候和中药质量控制的标志物等方面取得了许多成果,并制订了网络药理学研究的指南。然而,网络药理学的发展存在诸多问题尚待解决,例如,网络药理学的理论及学科内涵和外延尚不清楚,现有技术和方法对发现新化合物和新靶标的能力不足,所依赖数据库的准确性、适应性和可靠性有待提高,缺少中药化合物的剂量、比例和联合作用于靶标效应的定量综合分析技术和方法,缺少多成分、多靶标和多效应的高通量验证技术和方法,以及研究存在质量参差不齐、缺乏标准数据等问题。今后的发展需要进一步提出网络药理学的理论,界定学科的内涵和外延;升级管理并综合利用好各种网络药理学相关数据库,深入研究开发新一代中医药数据库;加强开发并引入相关能够自我学习和自主识别的人工智能技术,为发现新化合物及其靶标作用提供有效的工具;开发定量的网络药理学分析技术和方法和多分子、多靶标/非靶标之间相互关系的高通量分析和验证技术,为促进网络药理学的发展、进一步开展中医药网络药理学研究提供新技术新方法和规范标准。

慢性乙型病毒性肝炎中医证候生物学基础的研究思路

慢性乙型病毒性肝炎(chronic viral hepatitis B,CHB)是危害我国人民健康的重大传染病。鉴于中医对乙肝辨证施治的特色和优势,本文回顾了迄今CHB的证候客观化研究,并针对其存在的问题,从"病-证结合"研究出发,提出了还原论与整体论、控制论与系统论相结合,基于系统生物学的CHB中医证候生物学基础的研究思路、方法和研究途径。

医学发展趋势和前景分析

为了预测医学发展前景,把握医学发展大方向,课题组采用问卷调查、数据库分析、专家咨询和研讨等多种形式,对21世纪世界医学发展趋势与前景进行了深入分析,提出4项预测,并据此就我国医学发展总体目标提出了实施前移战略和下移战略,落实模式转变和系统整合,以及从观念上实现5个转变,从医疗卫生服务模式上实现6个转移等建议,从而提高健康科技水平,适应人民健康、社会发展的需求以及医学自身发展的需求。

中药对大鼠自发性慢性胰腺炎的干预作用及其方证病态基础

目的探讨桂枝汤、柴胡桂枝汤、小柴胡汤和卡莫司他对大鼠自发性慢性胰腺炎的干预作用及其方证病态基础。方法57只雄性4周龄WBN/Kob大鼠随机分为5组模型组、桂枝汤组、柴胡桂枝汤组、小柴胡汤组和卡莫司他组,每组大鼠均予以相应药物干预,共12周。每4周取大鼠胰腺组织观察胰腺湿重;HE染色观察胰腺组织病理学改变;RT-PCR技术检测大鼠胰腺胰腺炎相关蛋白(pancreatitis-associatedprotein,PAP)mRNA的表达水平;免疫组织化学方法检测胰腺PAP蛋白的表达。结果模型组自12周龄起胰腺组织发生胰腺炎病理学改变;桂枝汤组未观察到胰腺炎病理学改变;小柴胡汤组和卡莫司他组在16周龄时,胰腺组织均发生明显的胰腺炎病理学改变。桂枝汤组抑制PAPmRNA表达的作用大于其他各中药干预组。桂枝汤组和柴胡桂枝汤组在12周龄时,未发现胰腺PAP的表达。结论桂枝汤、柴胡桂枝汤、小柴胡汤和卡莫司他对大鼠自发性慢性胰腺炎具有不同程度的防治作用,其中以桂枝汤的作用最为明显。“太阳表证”可能是大鼠自发性慢性胰腺炎的中医基本证候病机,PAP的表达可能是其证候病机的病态基础之一。

医学发展调查报告

为进一步了解我国医学发展的状况、存在的问题,分析医学发展的趋势和前景,课题组重点针对医学的发展趋势与前景、发展战略与发展模式、医学诊疗康复策略、临床应对慢性疾病和老年病、医学研究思路、内容与方法、医疗卫生保健体系等方面的问题,进行了问卷调查。结果显示:中西医结合在未来中国医学发展的各项调查中占绝对优势;中医在“医学诊疗康复策略”和“应对慢性疾病、老年病”方面具有优势;西医在“研究思路、内容与方法等方面”具有优势。认为未来中国医学发展的前景是中西医并存者为主流,并预示未来中国的医学发展形成新医学的可能性。

中医复杂性研究的探索

本文在既往提出中医复杂系统的研究目标、任务、研究途径、方法论和研究方法的基础上,从系统的"关系"、"演化"、"涌现"、"不确定性"以及"复杂网络"5个方面,介绍了目前对中医复杂性研究热点问题和研究方法的探索,并提出今后需要探讨的问题和研究的方向。

关于培育“创新医药学”的思考

“创新医药学”是要在中、西医学和其他学科互相交叉渗透、共同发展中,融合中、西医学的优势,逐渐形成具有中国特色的新医学模式和新医学体系。为发展“创新医药学”,在迄今中西医结合研究和应用成果的基础上,提出了培育“创新医药学”的战略目标和主要任务,并对如何实现思路、模式和内容上的创新提出了构想,预测了“创新医药学”的发展远景。

复杂网络理论及其在中医学研究中的应用

中医学是从整体上把握疾病的变化规律的系统医学。通过回顾复杂网络的基本统计特性、介绍几种主要网络的拓扑结构模型以及基本分析方法,提出利用复杂网络理论研究中医学的基本思路。应用复杂网络对慢性病毒性乙型肝炎(乙肝)症候人群网络进行实证研究,结果发现乙肝症候人群网络具有小世界等特征。研究还显示了乙肝人群分布具有中医学证候分类的特征,为中医复杂系统研究及中医临床诊断提供一种可行的研究方法。

肝炎后肝硬化中医证候与疾病信息相似度分析

目的探讨肝炎后肝硬化中医证候与临床症状及生物学指标间的相似性。方法在对变量进行归一化处理的基础上,采用夹角余弦、相关系数、相似度D及谱图相似度等4种相似度分析方法对279例肝炎后肝硬化患者临床表征信息(症状)、生物学指标和证候进行相似性分析。结果获得相应的相似度矩阵,以分别反映中医证候和症状与生物学指标之间的相似性,4种方法得到的结果基本一致,相似度D法、夹角余弦法和谱图相似度法与传统的相关系数法相比匹配度显著提高,灵敏度高、取舍定量合理,方法可靠,较切合临床实际。结论通过相似度分析方法所得证候与临床信息间的相似关系与临床实际基本相符。该技术可简化临床指标数量,为寻找中医证候特征提供简捷、可靠的方法。

黄芩素抑制人乳腺癌细胞侵袭和迁移的实验研究

目的探讨黄芩素(baicalein)对人乳腺癌MDA-MB-231细胞侵袭和迁移的作用及其机制。方法 MTT法检测Baicalein对细胞活力的影响;Transwell小室测定其侵袭力和迁移力;细胞划痕实验测定细胞运动能力;Western blot检测细胞MMP2、MMP9和uPA的表达。结果与对照组相比,50、100μmol·L-1的baicalein明显抑制了MDA-MB-231细胞的侵袭(P<0.01)和迁移(P<0.01)。其中,baicalein对细胞侵袭抑制率分别为15%和44%,对细胞迁移的抑制率分别为50%和77%。50μmol·L-1的baicalein抑制了MMP2的表达水平,100μmol·L-1的baicalein分别抑制了MMP9和uPA的表达水平。结论 baicalein能够抑制MDA-MB-231细胞侵袭和迁移,其机制可能与直接抑制细胞侵袭和迁移能力,抑制MMP2、MMP9和uPA的表达有关。

TNF-α、TGF-β1和IL-10基因多态性与乙型肝炎后肝硬化的关系

目的:探讨上海人群中TNF-α、TGF-β1及IL-10单核苷酸多态性与乙型肝炎后肝硬化的关联.方法:运用PCR-RFLP结合测序的方法,测定119例健康对照者与169例肝硬化患者TNF-α基因-308G/A、TGF-β1基因-509T/C、IL-10基因-592A/C的多态性,并确定其基因型与等位基因频率的分布.结果:乙型肝炎后肝硬化患者TNF-α的GG基因型和G等位基因出现的频率明显高于健康对照者(P<0.001,OR>3);TGF-β1-509位点的3种基因型整体间没有差异,但T等位基因出现的频率明显高于健康对照者(P<0.05);IL-10-592A/C的多态性在乙型肝炎后肝硬化患者与健康对照者之间差异没有统计学意义.结论:TNF-α-308G/A与TGF-β1-509T/C的多态性可能与乙型肝炎后肝硬化的遗传易感性有关.

基于SIMCA法的肝炎后肝硬化中医证候判别研究

目的探讨SIMCA(soft independent modeling of class analogy)法对肝炎后肝硬化中医证候判识的可行性。方法在对变量进行归一化处理的基础上,用SIMCA法对268例肝炎后肝硬化患者临床症状、体征和生物学指标进行分析,获得相应SIMCA距离并以之对肝硬化证候进行识别,再运用秩和检验分析误判原因。结果 5种中医证候(肝郁脾虚证、肝肾阴虚证、脾肾阳虚证、湿热内蕴证及瘀热蕴结证)的识别率在最近类中为72.39%,在次近类中为17.91%,总识别率为90.30%。其中,对肝肾阴虚证的识别率最高,总识别率为95.24%。秩和检验分析结果表明,在最近类中,未得到识别者与得到识别者比较,在某些对证候判识起关键作用的症状变量得分方面差异有统计学意义(P<0.05)。结论采用SIMCA法对肝炎后肝硬化中医证候进行判识,与临床实际证候拟合度较高。依据SIMCA法建立证候辨识系统可为中医证候判别提供参考。

黄芪汤和茵陈蒿汤改善大鼠肝纤维化的效果及分子机制--差异基因表达谱的比较分析

目的:探讨黄芪汤和茵陈蒿汤抑制二甲基亚硝胺(DMN)诱导的大鼠肝纤维化中对信号传导通路调节的差异。方法:大鼠被随机分为正常组、黄芪汤组、茵陈蒿汤组和模型组,并予以DMN造模及相应药物治疗。观察各组肝组织病理学变化和羟脯氨酸含量;采用全基因组芯片检测,进行差异基因,富集功能GOs及信号通路分析。结果:与正常组相比,模型组出现显著的肝损伤和肝纤维化,肝组织羟脯氨酸(Hyp)含量显著升高(P<0.01)。与模型组比较,黄芪汤和茵陈蒿汤均显著改善肝组织病理,降低Hyp含量(P<0.01)。黄芪汤、茵陈蒿汤与模型组比较的差异基因分别为373个和432个,共有基因189个。各用药组都作用于Notch介导的上皮间质转化(EMT)通路、Notch和细胞粘附细胞基质糖复合物通路。黄芪汤还作用于血管内皮生长因子与促血管生成素通路、血小板反应素通路等;茵陈蒿汤还作用于细胞黏附-细胞外基质重塑通路、EMT通路等。结论:黄芪汤和茵陈蒿汤都能显著抑制DMN诱导的大鼠肝纤维化。黄芪汤益气扶正的功效主要与调节Notch诱导的EMT信号通路相关,茵陈蒿汤清热利湿的祛邪作用侧重于调节细胞黏附-细胞外基质(ECM)信号通路。

乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞MicroRNAs表达谱的差异性分析

背景与目的:已有研究表明,MicroRNAs(miRNAs)的异常表达参与了乳腺癌的发生和发展,常起到抑癌基因或癌基因作用。本研究旨在探讨乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞miRNAs的差异性表达,并预测异常表达的miRNAs可能调控的靶基因。方法:培养乳腺癌细胞株MCF-7和正常乳腺上皮细胞株HBL-100,分别提取细胞总RNA,并进行质检;利用miRNAs芯片技术,检测乳腺癌细胞和正常乳腺上皮细胞miRNAs的表达,对其表达谱进行差异性分析;采用实时定量RT-PCR进行验证;运用MiRanda、TargetScan、PicTar、DIANA-microT软件预测miRNAs可能调控的靶基因。结果:从MCF-7细胞与HBL-100细胞提取到的总RNA纯度较高,其A260/A280为1.90,A260/A230为2.0;琼脂糖凝胶实验结果显示总RNA完整性好。通过miRNAs表达谱的差异性分析,获得173个与乳腺癌相关的miRNAs,其中113个表达上调,60个表达下调;实时定量PCR检测到mir-18a和mir-195在MCF-7细胞中高表达;对乳腺癌细胞显著异常表达的mir-200b进行信息学分析,共筛选出68个靶基因。结论:获得了乳腺癌细胞与乳腺上皮细胞miRNAs的差异表达谱,其中部分miRNAs可能通过调控其靶基因而参与乳腺癌的发病机制。

偏最小二乘法在肝炎后肝硬化中医证候分类建模中的应用

目的:探讨偏最小二乘法(partial least-squares,PLS)在肝炎后肝硬化中医证候分类模型建立中的应用及临床价值。方法:拟定中医四诊等生物信息采集基本要求,用临床流行病学调查方法,采集278例肝炎后肝硬化患者症状、体征、舌象、脉象及临床实验室指标等生物信息;采用逐步回归方法筛选各证候相关指标,设证候类型为因变量矩阵,相关临床信息为自变量矩阵,所有变量均经列最大化处理后导入PLS程序中进行计算,采用留一法(Leave-One-Out,LOO)完成建模和样本的预测。结果:逐步回归建立的5个证候类型回归方程的决定系数R2均在0.7以上;在此基础上,基于PLS建立的肝炎后肝硬化中医证候判识模型对肝郁脾虚、肝肾阴虚、脾肾阳虚、湿热内蕴和瘀热蕴结等主证候的预测准确率分别为73.02%、68.71%、92.45%、84.17%和68.71%。结论:PLS法能提高中医临床生物信息的利用度,在中医复杂证候建模的研究中有一定的推广应用价值。

中药网络药理学研究进展

药物承担着防治疾病、提高人们健康水平的作用,同时,医药产业也已成为社会经济建设不可或缺的部分。传统药物的发现主要集中于单一靶点的高特异性抑制剂。然而,通过大规模功能基因组研究证实,只有不到10%的单基因敲除具有治疗价值,而且,单一分子靶点的高特异性药物对复杂疾病通常难以获得良效,

激素性股骨头坏死遗传易感性的研究进展

激素性股骨头坏死的发病机制目前尚未明确,近年来的研究表明激素性股骨头坏死患者的发病与遗传易感因素有关。本文就激素代谢、转运、抵抗和激素受体基因以及血液凝溶系统、脂肪代谢、骨代谢的相关基因多态性与股骨头坏死对激素敏感性的关联研究概况予以综述,讨论了研究的有关问题及对策,并就研究前景进行了展望。

慢性乙型病毒性肝炎肝肾阴虚证与湿热蕴结证患者外周血的差异基因表达谱分析

目的:通过检测和分析慢性乙型病毒性肝炎(以下简称乙肝)肝肾阴虚证、湿热蕴结证患者的差异基因表达谱,探讨乙肝中医证候分型与基因表达之间的关联。方法:从上海龙华医院肝科选择乙肝患者中诊断为肝肾阴虚证和湿热蕴结证者各3例,并选择3例健康者作为对照。采集乙肝患者和健康者的外周血样本,提取白细胞中的总RNA,运用基因芯片技术检测外周血基因表达情况,并对其表达谱进行比较。另外选择肝肾阴虚证和湿热蕴结证患者各10例和健康者10例,使用实时定量逆转录酶-聚合酶链式反应法验证部分基因的表达情况。结果:在乙肝肝肾阴虚证和湿热蕴结证患者之间、乙肝患者与健康者之间,基因表达谱都存在明显的差异表达。两种证型患者之间共有403个差异表达的基因,其中,239条基因表达有显著性差异(|差异倍数|≥2,P<0.05),基因表达上调的有142条,下调的有97条。肝肾阴虚证单独调变的基因主要与过氧化物酶的活性和干细胞的维持等相关,湿热蕴结证单独调变的基因主要与细胞因子、免疫应答和炎症反应等相关。实时定量逆转录酶-聚合酶链式反应验证ATP结合盒亚家族C成员3、过氧化物酶增殖体激活受体α等基因的表达与基因芯片检测结果趋势一致。结论:乙肝肝肾阴虚证和湿热蕴结证患者白细胞中基因表达存在差异,提示乙肝中医临床辨证分型具有分子生物学基础,与基因差异表达密切相关。

基于灰色系统理论的中医五脏系统分析

应用灰色系统理论结合中医基础理论,对乙型肝炎中医五脏系统进行分析.在介绍4种灰色关联分析方法的基础上,提出采用灰色综合关联方法分析了乙型肝炎中医五脏系统之间的关联性以及各个子系统的主导临床表现行为.同时,研究了与乙型肝炎五脏系统有关的54种常见临床症状、体征指标间的相互关联,并进行灰色聚类评价,旨在为中医临床诊断和中医复杂系统研究提供参考.

基于粗糙集与广义关联度系数的贝叶斯中医证候分类模型

文章主要探讨了一种贝叶斯分类方法在肝炎后肝硬化中医诊断中的应用,介绍了粗糙集理论、广义关联度系数以及贝叶斯分类模型等数据挖掘技术。并且,运用粗糙集理论及广义关联度系数方法,对287例肝炎后肝硬化的症状、体征进行了属性选择。进一步,利用树增广的朴素贝叶斯分类算法,构建了肝炎后肝硬化中医证候分类模型。实验表明这种模型对肝炎后肝硬化的6种主要证候分类的符合率达83%。研究结果对肝炎后肝硬化的中医临床诊断具有参考意义。