一种基于合成肽段涂层的单细胞蛋白质组学快速检测方法

单细胞层面的蛋白质组学研究极具挑战.本文报道了一种简单、快速的单细胞蛋白质组学方法(Mad-CASP),创新地设计了一套质谱兼容的合成肽段:(1)样品制备过程中,合成肽段的包被可以有效地减少样品损失;(2)质谱数据采集时,合成肽段的信号被摒除,对样品信号无影响;(3)全流程无需特殊设备,可在3~4小时内完成96孔样品的高通量制备.结合图谱库和新的质谱数据采集模式,Mad-CASP技术可从单个HeLa细胞中鉴定出124093个蛋白质.随后利用Mad-CASP技术分析了来自健康人和冠状动脉慢性完全闭塞(CTO)患者的240个外周血CD34^(+)单细胞.基于单细胞蛋白图谱,本研究首次揭示外周血CD34^(+)细胞的功能亚型,证实其在CTO进展中的“双刃剑”作用,提示靶向乙醛脱氢酶2在CTO治疗中的潜在作用.综上,本研究利用Mad-CASP技术首次解析了循环CD34^(+)细胞的单细胞蛋白质图谱,提示Mad-CASP技术在稀缺临床样本的单细胞蛋白质组学检测方面极具潜力.