NSCL/P患者中异常表达microRNA与WNT家族的关联性研究

目的:探讨非综合征性唇腭裂患者中microRNA表达谱差异及显著改变microRNA与WNT家族的关联性。方法:采用涵盖当前miRbase数据库中所有人类microRNA的miRCURY^(TM)探针的基因芯片对4例非综合征性唇腭裂患者的唇腭组织与4例正常新生儿脐带组织所提取的microRNA进行分析研究,并对差异性表达显著的microRNA进行生物信息学分析。结果:共筛选出254个与非综合征性唇腭裂相关的差异表达microRNA:181个在非综合征性唇腭裂组织中表达上调,73个表达下调(P<0.05)。根据差异倍数与P值大小,选取十个表达差异较大的microRNAs进行生物信息学靶基因预测,结果显示hsa-miR-1260b,hsa-miR-205-5p,hsa-miR-24-3p,hsa-miR-27b-3p和hsa-miR-720均靶向结合于Wnt5a、Wnt9b、Wnt10a等Wnt家族的信号分子。结论:差异表达较显著的microRNA通过与Wnt家族信号分子靶向结合参与调控唇腭裂的发育过程。

NSCL/P患儿异常表达miRNAs的生物信息学分析

目的:利用芯片杂交技术筛选出非综合征性唇腭裂(NSCL/P)患儿组织中异常表达的microRNAs(miRNAs),并进行系统的生物信息学分析,预测其参与的生物学过程及信号通路。方法:收集4例健康新生儿的脐带组织和4例2岁以内NSCL/P患儿唇腭组织,分别进行miRNAs芯片杂交的比对研究,筛选出异常表达miRNAs,并将其分别通过TARGETSCANVERT、MIRDB和RNA22-HSA 3个数据库进行生物信息学预测并取交集得到靶基因,进行基因功能富集分析(gene ontology)和生物通路富集分析(pathway enrichment)。结果:样本中检测出异常表达的miRNAs 254条(上调表达181条,下调表达73条,P<0.05)。对异常表达的miRNAs进行生物信息学预测并取交集得到靶基因5 029个。异常表达的miRNAs靶基因富集于解剖结构的发育、细胞黏附、细胞凋亡、细胞分化和细胞迁移等多个生物学过程;异常表达的miRNAs靶基因信号通路富集于Wnt、m TOR、c GMP-PKG、TGFβ、PI3K-Akt等信号通路。结论:NSCL/P异常表达miRNAs预测出的靶基因富集于多个信号通路和生物学功能,其相关信号通路与生物学功能提示基因与环境因素能够影响NSCL/P的形成。

从细胞因子角度看肿瘤微环境对免疫细胞及肿瘤细胞的影响

近年来,肿瘤微环境对肿瘤细胞影响的研究逐渐深入,肿瘤微环境可以通过多种途径影响肿瘤细胞的变化,此变化过程与细胞因子密切相关。细胞因子来自肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞,在体内通过多种方式参与肿瘤的演进转归过程,发挥协同或拮抗效应。尽管它们自身并不具备明确的抗瘤或者抑瘤能力,但却是肿瘤微环境与肿瘤细胞信息交换的桥梁。因此针对细胞因子的合理引导可能是抗肿瘤免疫治疗的重要环节。文章就细胞因子影响微环境中免疫细胞变化以及加强肿瘤细胞遗传不稳定性并破坏肿瘤细胞DNA的机制进行综述。

非综合征性唇腭裂患者四例microRNA的表达分析

目的寻找可能导致非综合征性唇腭裂的microRNA。方法采用丹麦Exiqon公司microRNA基因芯片技术对4例非综合征性唇腭裂患者的唇腭组织与4例正常胎儿的脐带组织进行检测比对。结果实验组(唇腭裂患儿组)与对照组(正常胎儿组)出现差异表达的microRNA共254条,其中实验组较对照组表达上调的181条,表达下调的73条。结论差异表达较显著的microRNA可能与非综合征性唇腭裂的发生存在关联。