20Y-STR检测试剂盒应用于Y-STR数据库的研究

目的:建立20个Y-STR基因座的复合扩增体系,进行体系评估,并评价其法医学应用价值;结合Y-STR DNA数据库,在大数据背景下探索Y-STR DNA检测试剂盒的应用。方法:采用五色荧光标记技术,对自行设计的20个YSTR基因座多重扩增引物进行复合扩增和毛细管电泳检测,检测其扩增效率,引物间的扩增平衡性以及特异性,结合Y-STR DNA数据库应用对家系亲缘关系排查进行验证研究。结果:研究建立的同时检测20个Y-STR基因座五色荧光检测方法,特异性好,分型结果准确稳定,灵敏度高,实际案例常见生物检材的检验结果良好,与目前已有的试剂盒,例如YFiler的结果一致,能够用于Y-STR DNA数据库建设。结论:20Y-STR基因座复合扩增检测法可以用于中国人群的Y-STR分型筛查,有望应用于法医物证实际检验工作,并有助于我国建立Y-STR DNA数据库,成为公安大数据的良好数据供体。

深圳地区育龄人群G6PD基因突变谱特征分析

目的:分析深圳地区育龄人群葡萄糖-6磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症的发生率及基因突变特征。方法:采集深圳地区体检育龄夫妇外周血样本,采用葡萄糖-6磷酸脱氢酶/6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(G6PD/6GPD)比值法、突变阻滞聚合酶链扩增系统(ARMS-PCR)结合二代测序(NGS)全序列分析方法,对样本进行G6PD基因突变检测和分析。结果:5640例样本G6PD酶活性异常比例为6.4%(360/5640),G6PD基因突变比率为7.8%(442/5640)。酶活性正常的5280例样本中(男性1331例、女性3949例)基因突变占1.8%(96/5280),男女性样本漏诊率分别为0.3%(3/1331)和2.4%(93/3949),而在1109例G6PD酶活性异常样本(包括之前收集的749例阳性样本)中,有25例样本未发现基因变异,误诊率2.2%(25/1109)。本研究共检出23种基因突变类型,发现c.460A>G、c.226A>C、c.-6T>C、c.452C>G 4种未见报道的基因突变类型。结论:深圳地区常见G6PD缺乏症致病基因突变类型主要为c.1376 G>T、c.1388 G>A、c.95 A>G、c.871 G>A、c.392 G>T、c.1024C>T 6种,与中国人G6PD缺乏症常见基因突变类型基本一致。本研究发现4例尚未见报道的可能致病性突变,其与酶活性缺乏的具体关系尚需进一步深入研究。

GATA3基因rs3824662位点多态性与妊娠期糖尿病相关性研究

目的探讨GATA3(GATA binding protein 3)基因rs3824662位点单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)孕妇遗传易感性的相关性。方法选取2012年7月—2013年5月在深圳市布吉人民医院和深圳市龙岗人民医院就诊的GDM孕妇241例为患者组,同期入院的健康孕妇139例为对照组。采用飞行时间质谱技术检测GATA3基因rs3824662位点的基因型,采用二元逻辑回归在3种不同遗传模型中分析该位点与GDM易感性的关系。结果对妊娠年龄和孕前BMI等多项混杂因素进行校正后的加性[OR(95%CI)=1.127(0.490,2.591);P=0.779]、显性[OR(95%CI)=0.976(0.638,1.492);P=0.910]及隐性[OR(95%CI)=1.153(0.515,2.584);P=0.729]遗传模型均显示rs3824662位点多态性与GDM无相关性。结论GATA3基因rs3824662位点单核苷酸多态性(SNP)与GDM的发生在中国人群中可能不具有相关性。