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苏尼特绵羊垂体季节性发情关键miRNA及其靶基因验证 被引量:3
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作者 范业锴 狄冉 +4 位作者 刘子嶷 李文韬 张伟峰 储明星 刘玉芳 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第12期109-115,共7页
为研究绵羊季节性发情性状相关分子调控机制,基于实验室前期不同光照下苏尼特绵羊垂体的转录组测序结果分析,筛选出与季节性发情相关的重要候选基因及其调控元件ARHGEF9-Novel_307、CACNB3-Novel_181、PBX1-Novel_387,为了进一步明确这... 为研究绵羊季节性发情性状相关分子调控机制,基于实验室前期不同光照下苏尼特绵羊垂体的转录组测序结果分析,筛选出与季节性发情相关的重要候选基因及其调控元件ARHGEF9-Novel_307、CACNB3-Novel_181、PBX1-Novel_387,为了进一步明确这些候选基因及其元件的功能,本研究通过荧光定量PCR(RT-qPCR)和生物信息学分析探讨其与绵羊季节性发情的关系。以饲养于不同光照羊舍中经双侧卵巢切除+雌二醇皮下注射(OVX+E2)处理的苏尼特绵羊为研究对象,采集垂体、下丘脑、子宫、心、肝、脾、肺和肾等组织进行研究。结果显示,ARHGEF9、CACNB3、PBX1和Novel_307、Novel_181、Novel_387均在垂体中表达。CACNB3、PBX1和Novel_307在短光照处理21 d(SP21)垂体组织中的表达显著高于长光照处理21 d(LP21),ARHGEF9、Novel_181、Novel_387在SP21垂体组织中的表达显著低于LP21,和转录组测序结果趋势相同。ARHGEF9-Novel_307、CACNB3-Novel_181、PBX1-Novel_387之间存在表达负相关性,与miRNA-mRNA整合分析结果一致;蛋白互作网络分析(PPI)表明,ARHGEF9、CACNB3、PBX1蛋白与DIO2、DIO3、TSHB等季节性发情标志蛋白存在关联性。综上所述,ARHGEF9、CACNB3、PBX1可能参与苏尼特羊季节性发情性状的形成,且Novel_307、Novel_181、Novel_387与候选基因之间存在负相关,可能调控候选基因的表达。 展开更多
关键词 苏尼特羊 MIRNA ARHGEF9 CACNB3 PBX1
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太行鸡MC1R基因的克隆测序、表达及生物信息学分析 被引量:2
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作者 范业锴 王鹏 +2 位作者 周祖阳 韩海银 刘玉芳 《中国家禽》 北大核心 2021年第11期1-6,共6页
为研究影响太行鸡不同羽色性状的重要候选基因MC1R的表达及生物信息学特性,试验以太行鸡麻、白两种羽色为研究对象,采用PCR克隆、实时荧光定量PCR技术和生物信息学分析进行探讨。测序结果显示:太行鸡MC1R基因CDS序列为945 bp,编码蛋白为... 为研究影响太行鸡不同羽色性状的重要候选基因MC1R的表达及生物信息学特性,试验以太行鸡麻、白两种羽色为研究对象,采用PCR克隆、实时荧光定量PCR技术和生物信息学分析进行探讨。测序结果显示:太行鸡MC1R基因CDS序列为945 bp,编码蛋白为314个氨基酸;蛋白理化性质分析发现,MC1R蛋白存在7个跨膜区,为跨膜受体;CDS区序列比对发现,太行鸡MC1R基因存在c.637C>T的突变,突变造成编码氨基酸mRNA二级结构和编码蛋白空间结构发生改变;实时荧光定量PCR检测发现,太行鸡麻羽品系毛囊中MC1R的表达量极显著高于白羽品系(P<0.01)。研究结果表明:MC1R基因的c.637C>T突变显著影响太行鸡的羽色,可以作为太行鸡羽色选育的候选分子标记。 展开更多
关键词 太行鸡 MC1R基因 表达分析 生物信息学 羽色
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山羊STEAP1基因和EIF2B4基因多态性与繁殖性能的关联分析
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作者 范业锴 刘玉芳 +5 位作者 陶林 江炎庭 欧阳依娜 张伟峰 洪琼花 储明星 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2022年第7期110-116,121,共8页
为探究候选基因STEAP1和EIF2B4与山羊繁殖性能的关联性,本实验利用MassARRAY■技术对STEAP1和EIF2B4基因的4个候选多态性位点(SNPs)进行分型,探究其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并... 为探究候选基因STEAP1和EIF2B4与山羊繁殖性能的关联性,本实验利用MassARRAY■技术对STEAP1和EIF2B4基因的4个候选多态性位点(SNPs)进行分型,探究其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并分析其与山羊繁殖性能(包括产羔数、初生窝重和断奶窝重)的关联性。结果表明,STEAP1 g.45853158 C>T和EIF2B4 g.72016288 T>G在不同品种山羊(济宁青山羊和辽宁绒山羊)中的基因型分布存在极显著差异;而STEAP1 g.45857345 C>T和g.45857371T>A基因型分布在山羊不同群体中差异不显著;在云上黑山羊高产群体和低产群体中,所有候选位点的基因型频率和基因频率均无显著差异;所有基因候选位点均与产羔数、初生窝重和断奶窝重无显著关联;STEAP1基因的位点g.45853158 C>T在不同繁殖性能群体中差异显著,生物信息学分析表明,突变造成STEAP1编码蛋白二级空间结构发生变化,可作为云上黑山羊繁殖性能的分子标记,但不适合进行窝选;STEAP1基因的另外2个SNPs位点g.45857371 T>A和g.45857345 C>T在不同繁殖性能群体中无显著差异,不适合作为云上黑山羊繁殖性能选育的分子标记。 展开更多
关键词 山羊 繁殖性能 多态性关联分析 STEAP1基因 EIF2B4基因
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太行鸡麻羽系产蛋率与累计产蛋量曲线拟合分析 被引量:6
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作者 刘玉芳 范业锴 +3 位作者 郭思武 韩海银 杨俊琦 张伟峰 《畜牧与兽医》 北大核心 2021年第7期1-5,共5页
为探究太行鸡麻羽系的产蛋规律,利用不同统计学方法对其产蛋率和累计产蛋量进行曲线拟合分析,确定最佳模型。选用Wood、McMillan、Yang和Ali-Schaeffer 4种模型对太行鸡麻羽系蛋鸡产蛋率曲线进行拟合分析,选用Gompertz、Logistic和von B... 为探究太行鸡麻羽系的产蛋规律,利用不同统计学方法对其产蛋率和累计产蛋量进行曲线拟合分析,确定最佳模型。选用Wood、McMillan、Yang和Ali-Schaeffer 4种模型对太行鸡麻羽系蛋鸡产蛋率曲线进行拟合分析,选用Gompertz、Logistic和von Bertalanffy 3种模型对其累计产蛋数曲线进行拟合分析。统计结果表明:Yang模型的产蛋率曲线拟合效果最好,拟合度(R^(2))为0.989;von Bertalanffy模型的累计产蛋量曲线拟合效果最佳,拟合度(R^(2))为0.998,累计产蛋量的拐点周龄为38.37,拐点产蛋数为66.95。因此,Yang和von Bertalanffy模型为太行鸡麻羽系产蛋率和累计产蛋量曲线拟合的最佳模型。 展开更多
关键词 太行鸡麻羽系 产蛋率 累计产蛋量 拟合统计模型 产蛋曲线
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大约克夏种猪繁殖性能遗传参数估计
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作者 孟瑶 范业锴 +2 位作者 张伟峰 何旭 张军辉 《猪业科学》 2022年第3期100-100,共1页
想要更好地了解和研究猪的繁殖性能,以此进一步降低成本及提高生产效率,需要精确的数据支撑以及对数据进行全方位的整理和记录,为研究猪的繁殖性能和之后的相关数据计算打下坚实的基础,也是为了让最终的数据更加的科学和严谨以及准确。... 想要更好地了解和研究猪的繁殖性能,以此进一步降低成本及提高生产效率,需要精确的数据支撑以及对数据进行全方位的整理和记录,为研究猪的繁殖性能和之后的相关数据计算打下坚实的基础,也是为了让最终的数据更加的科学和严谨以及准确。相比国外的一些进展,美系等猪种的数据,其中都有矫正等规范的计算过程,也方便后期与此相应的数据准备。 展开更多
关键词 繁殖性能 遗传参数估计 数据准备 数据支撑 降低成本 数据计算 美系 猪种
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