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基于SNP位点的吉林梅花鹿分子系谱构建及群体遗传结构分析
1
作者
范广轩
王天骄
+4 位作者
董依萌
王洪亮
丁宁
王莘皓
邢秀梅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期3925-3935,共11页
旨在利用全基因重测序技术获得的SNP位点为吉林梅花鹿保种群构建分子系谱,并对其遗传结构进行分析。本研究在锯茸期采集保种群的吉林梅花鹿血液10 mL(n=425),其中成年公鹿132只、成年母鹿208只、仔鹿85只,提取DNA后进行全基因重测序。...
旨在利用全基因重测序技术获得的SNP位点为吉林梅花鹿保种群构建分子系谱,并对其遗传结构进行分析。本研究在锯茸期采集保种群的吉林梅花鹿血液10 mL(n=425),其中成年公鹿132只、成年母鹿208只、仔鹿85只,提取DNA后进行全基因重测序。通过计算血源同源系数(IBD)分析吉林梅花鹿亲缘关系;基于观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、系统发育树和群体分化指数(Fst)等对吉林梅花鹿保种群遗传结构进行分析。通过全基因重测序筛选出25548601个高质量SNPs,425个样本共组成了90100对亲缘关系,平均亲缘系数为0.4351,得出195对父子关系与143对母子关系,占到采样群体原始系谱记录的92%,检出原始系谱错误率为2.2%,纠正了原始记录错误8处,具有较高的准确性和可靠性;分析群体分化指数(Fst),东丰型吉林梅花鹿与伊通型距离较远;绘制系统发育树,将吉林梅花鹿保种群划分为17个家系;采用的SNP标记平均观测杂合度为0.456,平均期望杂合度为0.277,平均多态信息含量为0.627,吉林梅花鹿保种群平均近交系数为0.078,存在较弱的近交。本研究建立了吉林梅花鹿保种群的分子系谱并对其群体遗传结构进行了分析,这对于保护吉林梅花鹿遗传多样性和规划保种群后续选育计划至关重要。
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关键词
吉林梅花鹿
SNP
分子系谱
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职称材料
钛合金返回料真空自耗电弧炉回收工艺研究
被引量:
2
2
作者
董燕妮
范广轩
张宝秋
《科技创新与应用》
2021年第3期110-113,共4页
探讨了钛合金返回料的自耗电极制备工艺,采用VAR法制备出了不同返回料添加比例的TC4和TA15钛合金铸锭,并研究了铸锭的成分均匀性。结果表明:采用压制法制备自耗电极,碎块料的适宜添加比例≤25%,短板边适宜添加比例≤15%;采用捆绑法可以...
探讨了钛合金返回料的自耗电极制备工艺,采用VAR法制备出了不同返回料添加比例的TC4和TA15钛合金铸锭,并研究了铸锭的成分均匀性。结果表明:采用压制法制备自耗电极,碎块料的适宜添加比例≤25%,短板边适宜添加比例≤15%;采用捆绑法可以实现返回料100%添加,但电极密度较小、单重小、成分均匀性差,不适宜于重要用途铸锭的熔炼;添加碎块料熔炼TC4和TA15铸锭可以获得高品质的铸锭,但为了保持铸锭的成分均匀性和稳定性,采用20%以下的添加量为宜。
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关键词
钛合金返回料
添加比例
自耗电极
铸锭
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职称材料
基于单细胞转录组测序的鹿茸生长中心细胞异质性研究
3
作者
丁宁
张然然
+2 位作者
范广轩
邢秀梅
刘欣
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
2024年第19期108-112,123-127,共10页
为了从单细胞水平探究梅花鹿鹿茸生长中心中细胞类型和基因表达的差异,即细胞异质性,试验采用单细胞转录组测序的方法,对生长75 d的梅花鹿鹿茸生长中心进行单细胞转录组分析,鉴定细胞类型,并对不同类型细胞进行基因表达模式、基因功能...
为了从单细胞水平探究梅花鹿鹿茸生长中心中细胞类型和基因表达的差异,即细胞异质性,试验采用单细胞转录组测序的方法,对生长75 d的梅花鹿鹿茸生长中心进行单细胞转录组分析,鉴定细胞类型,并对不同类型细胞进行基因表达模式、基因功能富集分析。结果表明:鹿茸生长中心包含了内皮细胞、周细胞、间充质细胞、免疫细胞、软骨细胞和成骨细胞等6种细胞类型,其中内皮细胞特异性表达PECAM1和VWF基因;周细胞特异性表达ABCC9和KCNJ8基因;间充质细胞高表达PRRX1和POSTN基因;免疫细胞特异性表达PTPRC和LCP1基因;成骨细胞特异性表达PHEX基因;软骨细胞特异性表达IGF1R基因。说明鹿茸的生长中心有着丰富的细胞类型,鹿茸的生长发育需要这些细胞的协调作用。
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关键词
梅花鹿
鹿茸
单细胞转录组测序
骨发育
细胞异质性
原文传递
题名
基于SNP位点的吉林梅花鹿分子系谱构建及群体遗传结构分析
1
作者
范广轩
王天骄
董依萌
王洪亮
丁宁
王莘皓
邢秀梅
机构
中国农业科学院特产研究所农业农村部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室
东北林业大学野生动物与自然保护地学院
广东长隆集团有限公司
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期3925-3935,共11页
基金
茸用梅花鹿新品种(品系)示范推广(202300801-05)
中国农业科学院科技。创新工程-特种动物遗传资源科技创新团队(CAAS-ASTIP-2021-ISAPS)
50K梅花鹿育种专用基因芯片研制(2022C038-2)。
文摘
旨在利用全基因重测序技术获得的SNP位点为吉林梅花鹿保种群构建分子系谱,并对其遗传结构进行分析。本研究在锯茸期采集保种群的吉林梅花鹿血液10 mL(n=425),其中成年公鹿132只、成年母鹿208只、仔鹿85只,提取DNA后进行全基因重测序。通过计算血源同源系数(IBD)分析吉林梅花鹿亲缘关系;基于观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、系统发育树和群体分化指数(Fst)等对吉林梅花鹿保种群遗传结构进行分析。通过全基因重测序筛选出25548601个高质量SNPs,425个样本共组成了90100对亲缘关系,平均亲缘系数为0.4351,得出195对父子关系与143对母子关系,占到采样群体原始系谱记录的92%,检出原始系谱错误率为2.2%,纠正了原始记录错误8处,具有较高的准确性和可靠性;分析群体分化指数(Fst),东丰型吉林梅花鹿与伊通型距离较远;绘制系统发育树,将吉林梅花鹿保种群划分为17个家系;采用的SNP标记平均观测杂合度为0.456,平均期望杂合度为0.277,平均多态信息含量为0.627,吉林梅花鹿保种群平均近交系数为0.078,存在较弱的近交。本研究建立了吉林梅花鹿保种群的分子系谱并对其群体遗传结构进行了分析,这对于保护吉林梅花鹿遗传多样性和规划保种群后续选育计划至关重要。
关键词
吉林梅花鹿
SNP
分子系谱
Keywords
Jilin sika deer
SNP
molecular genealogy
分类号
S829.9 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
钛合金返回料真空自耗电弧炉回收工艺研究
被引量:
2
2
作者
董燕妮
范广轩
张宝秋
机构
宝钛集团有限公司
出处
《科技创新与应用》
2021年第3期110-113,共4页
文摘
探讨了钛合金返回料的自耗电极制备工艺,采用VAR法制备出了不同返回料添加比例的TC4和TA15钛合金铸锭,并研究了铸锭的成分均匀性。结果表明:采用压制法制备自耗电极,碎块料的适宜添加比例≤25%,短板边适宜添加比例≤15%;采用捆绑法可以实现返回料100%添加,但电极密度较小、单重小、成分均匀性差,不适宜于重要用途铸锭的熔炼;添加碎块料熔炼TC4和TA15铸锭可以获得高品质的铸锭,但为了保持铸锭的成分均匀性和稳定性,采用20%以下的添加量为宜。
关键词
钛合金返回料
添加比例
自耗电极
铸锭
Keywords
titanium alloy recycled material
addition proportion
consumable electrode
ingot
分类号
TF823 [冶金工程—有色金属冶金]
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职称材料
题名
基于单细胞转录组测序的鹿茸生长中心细胞异质性研究
3
作者
丁宁
张然然
范广轩
邢秀梅
刘欣
机构
东北林业大学野生动物与自然保护地学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
2024年第19期108-112,123-127,共10页
基金
中国农业科学院科技创新工程-特种动物遗传资源科技创新团队项目(CAAS-ASTIP-2021-ISAPS)。
文摘
为了从单细胞水平探究梅花鹿鹿茸生长中心中细胞类型和基因表达的差异,即细胞异质性,试验采用单细胞转录组测序的方法,对生长75 d的梅花鹿鹿茸生长中心进行单细胞转录组分析,鉴定细胞类型,并对不同类型细胞进行基因表达模式、基因功能富集分析。结果表明:鹿茸生长中心包含了内皮细胞、周细胞、间充质细胞、免疫细胞、软骨细胞和成骨细胞等6种细胞类型,其中内皮细胞特异性表达PECAM1和VWF基因;周细胞特异性表达ABCC9和KCNJ8基因;间充质细胞高表达PRRX1和POSTN基因;免疫细胞特异性表达PTPRC和LCP1基因;成骨细胞特异性表达PHEX基因;软骨细胞特异性表达IGF1R基因。说明鹿茸的生长中心有着丰富的细胞类型,鹿茸的生长发育需要这些细胞的协调作用。
关键词
梅花鹿
鹿茸
单细胞转录组测序
骨发育
细胞异质性
Keywords
Sika deer
antler
single-cell transcriptome sequencing
bone development
cellular heterogeneity
分类号
S825 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SNP位点的吉林梅花鹿分子系谱构建及群体遗传结构分析
范广轩
王天骄
董依萌
王洪亮
丁宁
王莘皓
邢秀梅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
钛合金返回料真空自耗电弧炉回收工艺研究
董燕妮
范广轩
张宝秋
《科技创新与应用》
2021
2
下载PDF
职称材料
3
基于单细胞转录组测序的鹿茸生长中心细胞异质性研究
丁宁
张然然
范广轩
邢秀梅
刘欣
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
2024
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已选择
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