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白木香ARF基因家族的鉴定及结香表达分析
1
作者
范思庆
谢钊启
+2 位作者
杨佳欣
郭敏
程春松
《广东农业科学》
CAS
2024年第5期44-55,共12页
【目的】 生长素响应因子(Auxin response factor,ARF)是生长素信号转导中的重要转录因子,参与植物花果发育、器官形态形成、激素调节和应激反应等生理生化过程。旨在探究白木香〔Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg〕ARF基因(AsARF)在结...
【目的】 生长素响应因子(Auxin response factor,ARF)是生长素信号转导中的重要转录因子,参与植物花果发育、器官形态形成、激素调节和应激反应等生理生化过程。旨在探究白木香〔Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg〕ARF基因(AsARF)在结香过程中的生物学功能。【方法】利用生物信息学方法对AsARF进行全基因组鉴定和分析,通过转录组数据分析白木香受到机械损伤时ARF基因家族成员的表达模式。【结果】从全基因组水平鉴定了21个AsARF基因,生物信息学分析结果显示,21个AsARF基因分为5个类群,同一类群的AsARF基因具有相似的基因结构和蛋白保守基序,而不同类群的AsARF基因在外显子和内含子的数量上存在显著差异。此外,顺式作用元件分析发现AsARF基因启动子区域含有大量与光、厌氧和赤霉素等响应元件有关的序列。基因复制和共线性分析结果表明,片段复制事件对于白木香ARF基因家族的进化和扩张起着重要作用。与水稻ARF基因相比,白木香和拟南芥的ARF基因更为密切相关。此外,转录组数据分析表明,白木香在受到机械损伤时,AsARF5、AsARF6、AsARF19、AsARF20和AsARF21的表达量明显下降。【结论】首次对白木香ARF基因家族进行全基因组鉴定,并对其理化性质、系统进化、基因结构、保守基序、启动子顺式作用元件、基因复制和共线性等进行了详细分析。通过RNA-seq分析探索AsARF基因在白木香结香过程中的潜在机制,发现部分AsARF基因可能参与白木香结香的防御和生长的动态平衡过程,可为深入了解白木香结香机制提供重要理论依据。
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关键词
生长素响应因子
白木香
AsARF
基因家族
RNA-seq分析
结香机制
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职称材料
不同采收时间三叶木通果实品质变化分析
被引量:
4
2
作者
蔡芳丽
邹帅宇
+5 位作者
高浦新
贾天娇
程春松
范思庆
丁剑敏
黄宏文
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期83-85,共3页
对4个采收时间(9月3日、9月17日、10月1日和10月7日)三叶木通〔Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.〕果实的物理参数以及营养成分和矿质元素含量进行测定和比较。结果表明:总体上看,随着采收时间的推迟,三叶木通果实的单果鲜质量、纵径、...
对4个采收时间(9月3日、9月17日、10月1日和10月7日)三叶木通〔Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.〕果实的物理参数以及营养成分和矿质元素含量进行测定和比较。结果表明:总体上看,随着采收时间的推迟,三叶木通果实的单果鲜质量、纵径、横径、含水量和可溶性糖含量逐渐增加,而硬度和大部分矿质元素含量逐渐降低。总体上看,10月1日,三叶木通果实的鲜质量、大小、含水量、可溶性糖含量和VC含量显著升高,硬度及大部分矿质元素含量显著降低,表明此时果实向生理成熟转变。综合考虑三叶木通果实的品质和耐贮藏性,建议在10月1日左右采收。
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关键词
三叶木通
果实
采收时间
生理指标
品质
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职称材料
题名
白木香ARF基因家族的鉴定及结香表达分析
1
作者
范思庆
谢钊启
杨佳欣
郭敏
程春松
机构
中国科学院庐山植物园
出处
《广东农业科学》
CAS
2024年第5期44-55,共12页
基金
江西省双千人才-自然科学领军人才长期项目(jxsq2023101038)
江西省急需紧缺海外人才项目(20223BCJ25027)
九江市基地和人才计划重点领域科技创新团队项目(S2022TDJS029)。
文摘
【目的】 生长素响应因子(Auxin response factor,ARF)是生长素信号转导中的重要转录因子,参与植物花果发育、器官形态形成、激素调节和应激反应等生理生化过程。旨在探究白木香〔Aquilaria sinensis (Lour.) Gilg〕ARF基因(AsARF)在结香过程中的生物学功能。【方法】利用生物信息学方法对AsARF进行全基因组鉴定和分析,通过转录组数据分析白木香受到机械损伤时ARF基因家族成员的表达模式。【结果】从全基因组水平鉴定了21个AsARF基因,生物信息学分析结果显示,21个AsARF基因分为5个类群,同一类群的AsARF基因具有相似的基因结构和蛋白保守基序,而不同类群的AsARF基因在外显子和内含子的数量上存在显著差异。此外,顺式作用元件分析发现AsARF基因启动子区域含有大量与光、厌氧和赤霉素等响应元件有关的序列。基因复制和共线性分析结果表明,片段复制事件对于白木香ARF基因家族的进化和扩张起着重要作用。与水稻ARF基因相比,白木香和拟南芥的ARF基因更为密切相关。此外,转录组数据分析表明,白木香在受到机械损伤时,AsARF5、AsARF6、AsARF19、AsARF20和AsARF21的表达量明显下降。【结论】首次对白木香ARF基因家族进行全基因组鉴定,并对其理化性质、系统进化、基因结构、保守基序、启动子顺式作用元件、基因复制和共线性等进行了详细分析。通过RNA-seq分析探索AsARF基因在白木香结香过程中的潜在机制,发现部分AsARF基因可能参与白木香结香的防御和生长的动态平衡过程,可为深入了解白木香结香机制提供重要理论依据。
关键词
生长素响应因子
白木香
AsARF
基因家族
RNA-seq分析
结香机制
Keywords
auxin response factor
Aquilaria sinensis
AsARF
gene family
RNA-seq analysis
aroma formation mechanism
分类号
S792.99 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
不同采收时间三叶木通果实品质变化分析
被引量:
4
2
作者
蔡芳丽
邹帅宇
高浦新
贾天娇
程春松
范思庆
丁剑敏
黄宏文
机构
江西农业大学林学院
中国科学院庐山植物园
出处
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期83-85,共3页
基金
中国科学院战略生物资源服务网络计划项目(KFJ-BRP-007-001)
中国科学院庐山植物园庐山植物专项(2021ZWZX07)。
文摘
对4个采收时间(9月3日、9月17日、10月1日和10月7日)三叶木通〔Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.〕果实的物理参数以及营养成分和矿质元素含量进行测定和比较。结果表明:总体上看,随着采收时间的推迟,三叶木通果实的单果鲜质量、纵径、横径、含水量和可溶性糖含量逐渐增加,而硬度和大部分矿质元素含量逐渐降低。总体上看,10月1日,三叶木通果实的鲜质量、大小、含水量、可溶性糖含量和VC含量显著升高,硬度及大部分矿质元素含量显著降低,表明此时果实向生理成熟转变。综合考虑三叶木通果实的品质和耐贮藏性,建议在10月1日左右采收。
关键词
三叶木通
果实
采收时间
生理指标
品质
Keywords
Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.
fruit
harvesting time
physiological index
quality
分类号
Q949.9 [生物学—植物学]
Q946.91 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
白木香ARF基因家族的鉴定及结香表达分析
范思庆
谢钊启
杨佳欣
郭敏
程春松
《广东农业科学》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
不同采收时间三叶木通果实品质变化分析
蔡芳丽
邹帅宇
高浦新
贾天娇
程春松
范思庆
丁剑敏
黄宏文
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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职称材料
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