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苹果多胺氧化酶(PAO)基因家族鉴定与表达分析
被引量:
4
1
作者
秦玲
张鑫
+5 位作者
荣春笑
莫传园
范露
闫婕
孟莹
张满让
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第2期262-273,共12页
从金冠基因组数据库中,利用BLAST网站在苹果中鉴定得到8个编码多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)的家族基因(命名为MdPAO1~8),对其进行理化性质、系统进化、蛋白结构、基因结构和启动子元件分析。结果表明,MdPAO蛋白的分子量为54.053~6...
从金冠基因组数据库中,利用BLAST网站在苹果中鉴定得到8个编码多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)的家族基因(命名为MdPAO1~8),对其进行理化性质、系统进化、蛋白结构、基因结构和启动子元件分析。结果表明,MdPAO蛋白的分子量为54.053~64.813 ku,等电点介于5.16~6.02。根据进化树分析,MdPAO被分为3个亚家族(Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ),且同一亚家族的成员具有相似的蛋白结构、基因结构和蛋白保守基序分布。利用GEO数据库检测出8个MdPAO在不同组织器官中的表达具有明显差异。以苹果主栽品种长富2号为材料,利用实时荧光定量PCR检测分析得出8个MdPAO在不同组织中的表达情况,结果表明,MdPAO3、MdPAO4、MdPAO5/6和MdPAO8在花中有较高的表达水平;MdPAO1/2和MdPAO7在茎和果中有较高的表达水平。外源亚精胺处理后发现,除MdPAO3以外,其余MdPAO的转录水平显著提高,表明MdPAO在PA代谢途径中具有重要作用。
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关键词
苹果
多胺氧化酶(PAO)基因家族
生物信息学
基因表达
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职称材料
题名
苹果多胺氧化酶(PAO)基因家族鉴定与表达分析
被引量:
4
1
作者
秦玲
张鑫
荣春笑
莫传园
范露
闫婕
孟莹
张满让
机构
西北农林科技大学园艺学院
洛南县林业局
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020年第2期262-273,共12页
基金
国家现代农业产业技术体系(CARS-27)
文摘
从金冠基因组数据库中,利用BLAST网站在苹果中鉴定得到8个编码多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)的家族基因(命名为MdPAO1~8),对其进行理化性质、系统进化、蛋白结构、基因结构和启动子元件分析。结果表明,MdPAO蛋白的分子量为54.053~64.813 ku,等电点介于5.16~6.02。根据进化树分析,MdPAO被分为3个亚家族(Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ),且同一亚家族的成员具有相似的蛋白结构、基因结构和蛋白保守基序分布。利用GEO数据库检测出8个MdPAO在不同组织器官中的表达具有明显差异。以苹果主栽品种长富2号为材料,利用实时荧光定量PCR检测分析得出8个MdPAO在不同组织中的表达情况,结果表明,MdPAO3、MdPAO4、MdPAO5/6和MdPAO8在花中有较高的表达水平;MdPAO1/2和MdPAO7在茎和果中有较高的表达水平。外源亚精胺处理后发现,除MdPAO3以外,其余MdPAO的转录水平显著提高,表明MdPAO在PA代谢途径中具有重要作用。
关键词
苹果
多胺氧化酶(PAO)基因家族
生物信息学
基因表达
Keywords
apple
polyamine oxidase(PAO)gene family
bioinformatics
gene expression
分类号
S661.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苹果多胺氧化酶(PAO)基因家族鉴定与表达分析
秦玲
张鑫
荣春笑
莫传园
范露
闫婕
孟莹
张满让
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2020
4
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