新疆维吾尔族溃疡性结肠炎患者相关的长链非编码RNA差异表达谱及功能研究

目的:利用微阵列芯片和生物信息学技术,分析溃疡性结肠炎(UC)中长链非编码RNA(lncRNA)表达特征。方法:选取医院确诊的3例维吾尔族UC患者,将其纳入观察组,另选3名维吾尔族健康体检者纳入对照组,运用lncRNA芯片检测两组结肠组织中lncRNAs和信使核糖核酸(mRNAs)表达谱,分析两组间差异表达的lncRNAs。运用在线生物信息学软件对差异lncRNAs的生物学功能和lncRNAs预测的靶向mRNAs进行全基因组关联分析。结果:芯片结果预处理分析中,两组的芯片结果在总体基因的表达一致。通过对lncRNA和mRNA的数据进行聚类分析发现,在两组样本中,lncRNA和mRNA的基因表达存在明显的差异。观察组患者病变结肠组织中表达的lnc RNAs筛选差异倍数≥2,共有1242个,其中表达上调579个,下调663个;差异表达的lncRNAs主要在免疫系统进展、炎症通路及B细胞的激活等功能上显著富集;基因座信息预测差异表达的lncRNA靶基因中有8个与UC发病机制相关的lncRNA-mRNA分子调控机制。结论:新疆维吾尔族UC患者与维吾尔族健康者的结肠组织存在差异表达的lncRNAs,且可能参与UC的致病调控过程。

miR-198靶向抑制FGFR1表达抑制胃癌细胞增殖并诱导细胞凋亡

目的:探究微小RNA(miR)-198对胃癌细胞增殖及凋亡的影响及其可能的作用机制。方法:培养人胃癌细胞株系MKN-45、SGC-7901和BGC-823以及人胃黏膜上皮细胞(GES-1),采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测miR-198在胃癌细胞中的表达;对胃癌细胞MKN-45进行miR-198模拟物(mimic)和阴性对照(mimiccontrol)转染,分别设定为miR-198 mimic+control组和miR-198 mimic+FGFR1组,采用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)和流式细胞仪检测miR-198表达上调对胃癌细胞增殖和凋亡的影响。采用生物信息学网站预测miR-198的潜在靶基因;采用双荧光素酶报告实验及免疫印迹(Western Blot)验证miR-198对成纤维细胞生长因子受体1(FGFR1)的调控关系。结果:与GES-1细胞相比,miR-198在MKN-45、SGC-7901和BGC-823胃癌细胞中的表达显著下调,差异有统计学意义(t=35.068,t=9.872,t=20.585;P<0.01);miR-198表达上调显著抑制胃癌细胞的增殖,两组细胞在转染第48 h和72 h增殖比较和诱导细胞凋亡比较,差异均有统计学意义(t_(增殖)=5.041,t=6.041;t_(凋亡)=6.797;P<0.01);WesternBlot实验中,miR-198 mimic组FGFR1蛋白水平与mimic control组相比,显著抑制了FGFR1蛋白水平表达,差异有统计学意义(t=6.030,P<0.01);CCK-8实验中miR-198mimic组+FGFR1细胞增殖能力明显增强,细胞凋亡率显著降低,与miR-198 mimic+control组相比,差异有统计学意义(t=4.797,t=7.249;P<0.01)。结论:miR-198通过靶向抑制FGFR1的表达而抑制胃癌细胞的增殖,诱导细胞凋亡,在胃癌中发挥抑癌基因功能。