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铵胁迫下Bacillus aryabhattai NM1-A2脂质代谢的多组学分析
1
作者
陆钊梅
Kashif Muhammad
+2 位作者
莫淑名
杜林方
蒋承建
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期178-185,共8页
为了探究脂质代谢在抵抗铵胁迫中的具体作用,本研究以一株高耐铵菌株Bacillus aryabhattai NM1-A2为研究对象,通过全基因组和转录组分析挖掘脂质代谢通路和关键基因,利用实时荧光定量PCR对筛选的差异表达基因进行定量分析,并测定丙二醛...
为了探究脂质代谢在抵抗铵胁迫中的具体作用,本研究以一株高耐铵菌株Bacillus aryabhattai NM1-A2为研究对象,通过全基因组和转录组分析挖掘脂质代谢通路和关键基因,利用实时荧光定量PCR对筛选的差异表达基因进行定量分析,并测定丙二醛含量和抗氧化酶活性.结果表明,铵胁迫下脂肪酸合成相关基因(accC、fabG和fabF等)均上调表达,脂肪酸降解相关基因(ACSL、fadB和fadN等)大多下调表达,可能导致脂肪酸积累.醛脱氢酶编码基因ALDH上调表达以减少脂质氧化产物的积累.此外,铵胁迫诱导超氧化物歧化酶、过氧化物酶和过氧化氢酶表达水平和活性的提高,以减少活性氧产生和细胞损伤.因此,活跃的脂质代谢和抗氧化酶系统是B.aryabhattai NM1-A2抵抗铵胁迫的重要途径.
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关键词
铵胁迫
脂质代谢
抗氧化
组学分析
下载PDF
职称材料
北部湾红树林沉积物中微生物群落结构的时空变化分析
被引量:
5
2
作者
赵华显
阎冰
+5 位作者
徐悦
莫淑名
聂世清
欧倩
武波
蒋承建
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期2161-2169,共9页
微生物群落结构对海洋红树林湿地生态系统中的物质循环非常关键。本研究从中国亚热带北部湾典型海洋红树林湿地生态系统中采集沉积物样品,利用宏基因组学技术手段,完成了沉积物样品16S rDNA基因的扩增子的高通量测序,分析了不同时空条...
微生物群落结构对海洋红树林湿地生态系统中的物质循环非常关键。本研究从中国亚热带北部湾典型海洋红树林湿地生态系统中采集沉积物样品,利用宏基因组学技术手段,完成了沉积物样品16S rDNA基因的扩增子的高通量测序,分析了不同时空条件下红树林沉积物的微生物群落结构分布和变化规律。研究结果表明,不管在干季还是湿季,在门分类水平上变形菌门(Proteobacteria)是最丰富的类别。此外,变形菌门(Proteobacteria)与绿弯菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)和放线菌门(Actinobacteria)一共占据总丰度的80%左右。干季时期的微生物α多样性显著高于湿季,主坐标分析(principal co-ordinates analysis,PCoA)显示干、湿两季的微生物群落结构具有明显差异。干季时期的细菌的相对丰度显著高于湿季,而古菌则相反。不同时空期(干季和湿季)的变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度没有显著差异。冗余分析(redundancy analysis,RDA)和相关性分析表明温度和盐度对微生物群落结构具有显著影响。本研究对揭示亚热带海洋红树林湿地生态系统沉积物中的微生物多样性及其群落结构演替规律具有重要的实践意义。
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关键词
亚热带海洋红树林
时空变化
微生物群落结构
16S
rDNA
原文传递
题名
铵胁迫下Bacillus aryabhattai NM1-A2脂质代谢的多组学分析
1
作者
陆钊梅
Kashif Muhammad
莫淑名
杜林方
蒋承建
机构
四川大学生命科学学院生物资源与生态环境重点实验室
广西科学院国家非粮生物质能源工程技术研究中心非粮生物质酶解技术国家重点实验室
出处
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期178-185,共8页
基金
广西中央引导地方科技发展基金项目(GrantGUIKEZY21195021)
广西自然科学基金杰出青年基金项目(2019GXNSFFA245011)
广西科学院基础研究基金(CQ-C-202202)。
文摘
为了探究脂质代谢在抵抗铵胁迫中的具体作用,本研究以一株高耐铵菌株Bacillus aryabhattai NM1-A2为研究对象,通过全基因组和转录组分析挖掘脂质代谢通路和关键基因,利用实时荧光定量PCR对筛选的差异表达基因进行定量分析,并测定丙二醛含量和抗氧化酶活性.结果表明,铵胁迫下脂肪酸合成相关基因(accC、fabG和fabF等)均上调表达,脂肪酸降解相关基因(ACSL、fadB和fadN等)大多下调表达,可能导致脂肪酸积累.醛脱氢酶编码基因ALDH上调表达以减少脂质氧化产物的积累.此外,铵胁迫诱导超氧化物歧化酶、过氧化物酶和过氧化氢酶表达水平和活性的提高,以减少活性氧产生和细胞损伤.因此,活跃的脂质代谢和抗氧化酶系统是B.aryabhattai NM1-A2抵抗铵胁迫的重要途径.
关键词
铵胁迫
脂质代谢
抗氧化
组学分析
Keywords
Ammonium stress
Lipid metabolism
Antioxidant
Omics analysis
分类号
Q935 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
北部湾红树林沉积物中微生物群落结构的时空变化分析
被引量:
5
2
作者
赵华显
阎冰
徐悦
莫淑名
聂世清
欧倩
武波
蒋承建
机构
广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室
广西红树林研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期2161-2169,共9页
基金
国家重点研发计划科技基础资源调查专项(2017FY100704)
广西红树林保护与利用重点实验室开放基金(课题编号:GKLMC-201702)
广西“红树林和海草系统保育与生态监测”特聘专家岗基金资助。
文摘
微生物群落结构对海洋红树林湿地生态系统中的物质循环非常关键。本研究从中国亚热带北部湾典型海洋红树林湿地生态系统中采集沉积物样品,利用宏基因组学技术手段,完成了沉积物样品16S rDNA基因的扩增子的高通量测序,分析了不同时空条件下红树林沉积物的微生物群落结构分布和变化规律。研究结果表明,不管在干季还是湿季,在门分类水平上变形菌门(Proteobacteria)是最丰富的类别。此外,变形菌门(Proteobacteria)与绿弯菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)和放线菌门(Actinobacteria)一共占据总丰度的80%左右。干季时期的微生物α多样性显著高于湿季,主坐标分析(principal co-ordinates analysis,PCoA)显示干、湿两季的微生物群落结构具有明显差异。干季时期的细菌的相对丰度显著高于湿季,而古菌则相反。不同时空期(干季和湿季)的变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度没有显著差异。冗余分析(redundancy analysis,RDA)和相关性分析表明温度和盐度对微生物群落结构具有显著影响。本研究对揭示亚热带海洋红树林湿地生态系统沉积物中的微生物多样性及其群落结构演替规律具有重要的实践意义。
关键词
亚热带海洋红树林
时空变化
微生物群落结构
16S
rDNA
Keywords
Subtropical marine mangrove
Spatio-temporal variability
Microbial community structure
16S rDNA
分类号
Q938.1 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
铵胁迫下Bacillus aryabhattai NM1-A2脂质代谢的多组学分析
陆钊梅
Kashif Muhammad
莫淑名
杜林方
蒋承建
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
北部湾红树林沉积物中微生物群落结构的时空变化分析
赵华显
阎冰
徐悦
莫淑名
聂世清
欧倩
武波
蒋承建
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
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