生物信息学分析CETP基因在肝癌中表达及其对预后和免疫的影响

目的:探讨胆固醇酯转移蛋白(CETP)在原发性肝癌(肝癌)中表达及其对预后和免疫的影响。方法:下载GEO数据集GSE101685、GSE45267、GSE62232,以及ImmPort数据库人类免疫相关基因(IRGs),联合筛选差异表达的下调基因并选择未研究过的基因CETP。使用UALCAN和Kaplan-Meier Plotter数据库分别分析CETP在肝癌中的表达和其与肝癌患者预后的关系。LinkedOmics数据库进行基因本体(GO)分析和KEGG通路基因富集分析。Timer数据库及TISIDB数据库分析CETP与肝癌免疫细胞浸润、免疫调节剂的相关性。结果:3个肝癌数据集及ImmPort数据库筛选出共有的16个差异基因,从中选择下调的关键基因CETP。UALCAN数据库显示,与正常组织相比,CETP基因在肝癌组织中表达水平降低(P<0.05);CETP表达与美国癌症联合委员会(AJCC)分期、淋巴结转移密切相关(P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库分析显示,CETP基因低表达患者中位生存时间37.8个月,明显短于高表达患者的61.7个月(HR=0.66,P<0.05)。GO分析显示,CETP相关基因主要参与免疫反应、白细胞粘附、细胞死亡、细胞趋化等活动;KEGG通路分析显示,CETP基因在NK细胞介导的细胞毒性、细胞因子-细胞因子受体相互作用、氧化磷酸化、Th1和Th2细胞分化等通路中富集。TIMER数据库及TISIDB数据库表明CETP与肝癌中树突状细胞、CD8+T细胞免疫细胞浸润水平及免疫调节剂相关。结论:在线数据库分析表明,CETP基因在肝癌中表达下调,CETP低表达与患者临床特征和不良预后相关,CETP表达的改变可影响免疫应答,从而可能影响患者预后。

U2AF2表达对肝细胞癌增殖和迁移的影响及其与预后的关系

目的:探讨U2小核RNA辅助因子2(U2AF2)表达对肝细胞癌增殖和迁移的影响及其与预后的关系。方法:采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测U2AF2在HCC细胞系(HepG2、Hep3B、Huh-7和HCCLM9)及正常肝脏细胞LO2中的表达水平。采用慢病毒介导的短发夹RNA(shRNA)敲低U2AF2在HCC细胞中的表达(shU2AF2-1、shU2AF2-2为实验组,sh-NC为对照组)。采用CCK-8和细胞划痕实验分别检测shU2AF2-1组和sh-NC组HCC细胞的增殖和迁移能力。Western bolt检测shU2AF2-1组和sh-NC组HCC细胞的哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)表达水平及其磷酸化(p-mTOR)水平。生物信息学分析采用UALCAN和Kaplan-Meier Plotter数据库分别分析U2AF2在HCC中的表达及其与HCC预后的关系。下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库的HCC表达谱,采用基因集富集分析(GSEA)分析U2AF2在HCC中参与的信号通路。多组比较采用单因素方差分析,两组比较采用LSD-t或t检验。结果:TCGA数据库分析显示,HCC组织U2AF2 mRNA表达水平明显高于癌旁正常肝组织(P<0.05),U2AF2 mRNA表达水平随着HCC肿瘤分级的增高而增高(P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库分析显示,U2AF2高表达组患者总体生存率及无复发生存率明显低于低表达组(HR=1.86,1.85;P<0.05)。GSEA结果提示,U2AF2的高表达与mTOR通路密切相关,标准化富集得分(NES)为2.113(P<0.05)。qRT-PCR检测显示,U2AF2 mRNA在HepG2、Hep3B、Huh-7和HCCLM9细胞中表达水平明显高于正常肝脏细胞LO2,其中以HCCLM9细胞的表达最高(F=26.003,P<0.05);shU2AF2-1和shU2AF2-2组HCCLM9细胞U2AF2 mRNA平均相对表达量分别为0.27±0.09、0.41±0.13,明显低于sh-NC组的1.02±0.06(LSD-t=-7.643,-6.220;P<0.05)。CCK-8实验显示,shU2AF2-1组HCCLM9细胞的增殖能力明显低于sh-NC组(t=-5.381,P<0.05)。细胞划痕实验显示,shU2AF2-1组HCCLM9细胞的迁移能力明显低于sh-NC组(t=-7.903,P<0.05)。Western blot检测显示,shU2AF2-1组HCCLM9细胞的p-mTOR水平明显低于sh-NC组,而两组mTOR水平无明显差异。结论:U2AF2在HCC中高表达,且U2AF2高表达和HCC的不良预后相关,U2AF2对HCC细胞增殖和迁移的促进作用可能是通过激活mTOR通路实现。

广西在校大学生身体脂肪参数对肺功能的影响

目的探究广西在校大学生的身体脂肪参数对肺功能的影响,为改善大学生身体功能素质提供依据。方法随机抽取广西医科大学2 462名(男生716名,女生1 746名)在校大学生为研究对象,并采用奥美体成分测量仪(Tanita MC-180)测量身体脂肪参数,参照国家体质健康测试标准统一测试大学生的身高、体重及肺活量。采用SPSS 20.0软件对数据进行分析。结果男女大学生的肺活量均随着体脂率的增加呈上升趋势,肺活量体重指数均随着体脂率的增加呈下降趋势(F值分别为41.627,69.196,P值均<0.05)。体脂率过低组男大学生肺活量体重指数与身体各部位脂肪参数的相关均无统计学意义(P值均>0.05),体脂率过高组和标准组的肺活量体重指数与不同部位的脂肪参数呈不同程度的负相关性(r值均<0,P值均<0.05)。在女大学生中,仅有体脂率过低组和标准组的肺活量体重指数与身体各部位脂肪参数呈负相关(r值均<0,P值均<0.05),体脂率过高组的肺活量体重指数与身体各部位脂肪参数的相关均无统计学意义(P值均>0.05)。结论大学生部分身体脂肪参数可导致一定程度的肺活量体重指数下降,对大学生的肺功能造成一定影响。保持身体各部位适宜的脂肪含量对改善大学生的身体健康和肺功能有一定积极作用。