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基于PCA的模糊C均值聚类算法识别AD候选致病基因
1
作者
杨华兰
庞朝阳
+1 位作者
董体智
胡本琼
《四川师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2016年第4期496-502,共7页
研究表明阿尔茨海默病(AD)的致病机理可能与基因有关.利用计算方法对AD基因表达数据进行挖掘,以获得AD候选致病基因,寻找治愈AD方法.结合生物信息理论应用基于主成分分析(PCA)方法的模糊C均值算法处理基因表达数据:观察到AD基因表达数...
研究表明阿尔茨海默病(AD)的致病机理可能与基因有关.利用计算方法对AD基因表达数据进行挖掘,以获得AD候选致病基因,寻找治愈AD方法.结合生物信息理论应用基于主成分分析(PCA)方法的模糊C均值算法处理基因表达数据:观察到AD基因表达数据具有线性相关性后,先用PCA对数据降维,再利用一维分类方法对降维后的数据聚类,然后将结果提供给模糊C均值算法作为其初始聚类数目和聚类中心.通过算法,最终识别出9个AD候选致病基因.
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关键词
基因表达数据
AD候选致病基因
模糊C均值算法
主成分分析
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职称材料
题名
基于PCA的模糊C均值聚类算法识别AD候选致病基因
1
作者
杨华兰
庞朝阳
董体智
胡本琼
机构
四川师范大学数学与软件科学学院
四川师范大学计算机科学学院
东华软件股份公司
成都理工大学管理科学学院
出处
《四川师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2016年第4期496-502,共7页
基金
中国航空科学基金(2012ZD11)
文摘
研究表明阿尔茨海默病(AD)的致病机理可能与基因有关.利用计算方法对AD基因表达数据进行挖掘,以获得AD候选致病基因,寻找治愈AD方法.结合生物信息理论应用基于主成分分析(PCA)方法的模糊C均值算法处理基因表达数据:观察到AD基因表达数据具有线性相关性后,先用PCA对数据降维,再利用一维分类方法对降维后的数据聚类,然后将结果提供给模糊C均值算法作为其初始聚类数目和聚类中心.通过算法,最终识别出9个AD候选致病基因.
关键词
基因表达数据
AD候选致病基因
模糊C均值算法
主成分分析
Keywords
gene expression
the candidate genes of AD
Fuzzy C-Means clustering
principal component analysis
分类号
O24 [理学—计算数学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于PCA的模糊C均值聚类算法识别AD候选致病基因
杨华兰
庞朝阳
董体智
胡本琼
《四川师范大学学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2016
0
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