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基于电子捕获裂解/电子转运裂解串联质谱技术的蛋白质组学研究 被引量:15
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作者 孙瑞祥 董梦秋 +5 位作者 迟浩 杨兵 秀丽蕴 王乐珩 付岩 贺思敏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第1期94-102,共9页
蛋白质组学的兴起带动了质谱技术的快速发展,而质谱技术的进步则拓宽了蛋白质组学研究问题的广度.最近10年内,肽段或完整蛋白质在质谱仪中的裂解技术——电子捕获裂解(electron capture dissociation,ECD)与电子转运裂解(electron trans... 蛋白质组学的兴起带动了质谱技术的快速发展,而质谱技术的进步则拓宽了蛋白质组学研究问题的广度.最近10年内,肽段或完整蛋白质在质谱仪中的裂解技术——电子捕获裂解(electron capture dissociation,ECD)与电子转运裂解(electron transfer dissociation,ETD)逐渐发展起来.ECD和ETD在蛋白质组学中的应用,特别是在蛋白质的翻译后修饰鉴定和"自顶而下(Top-down)"的完整蛋白质裂解研究中已经展示出了诱人的前景.对ECD和ETD的基本原理、质谱特点、仪器实现、数据解析算法与软件开发,以及在蛋白质组学中的应用进展等方面进行了比较系统全面的阐述,并对当前的研究问题、面临的技术挑战与未来的发展趋势等方面作了深入剖析. 展开更多
关键词 电子捕获裂解 电子转运裂解 碰撞诱导裂解 串联质谱技术 计算蛋白质组学
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蛋白质结构与相互作用研究新方法--交联质谱技术 被引量:10
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作者 樊盛博 吴妍洁 +8 位作者 杨兵 迟浩 孟佳明 卢珊 张昆 邬龙 孙瑞祥 董梦秋 贺思敏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1109-1125,共17页
蛋白质的空间结构信息以及蛋白质间的相互作用信息对于研究蛋白质的功能有重要意义.研究蛋白质结构与相互作用的传统技术,如核磁共振技术、X射线晶体衍射技术等,对于蛋白质的纯度、结晶性和绝对量均有比较高的要求,限制了其广泛应用.交... 蛋白质的空间结构信息以及蛋白质间的相互作用信息对于研究蛋白质的功能有重要意义.研究蛋白质结构与相互作用的传统技术,如核磁共振技术、X射线晶体衍射技术等,对于蛋白质的纯度、结晶性和绝对量均有比较高的要求,限制了其广泛应用.交联质谱技术是近十多年来发展起来的新技术,它将质谱技术与交联技术相结合,在研究蛋白质结构与相互作用方面具有速度快、成本小、蛋白质各方面性状要求低等优势.本文就交联质谱技术各个环节的技术方法加以综述,包括交联质谱实验分离富集技术、常见交联剂特性、交联质谱数据库搜索算法、结果验证研究和交联质谱技术的应用等方面,并展望了该研究方向未来的发展. 展开更多
关键词 交联质谱技术 蛋白质结构 蛋白质相互作用 蛋白质组学 质谱技术
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TransitID通过串联邻近标记和富集无偏鉴定蛋白质移位
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作者 曹勇 董梦秋 《Science Bulletin》 SCIE EI CAS CSCD 2023年第19期2139-2141,M0003,共4页
Every eukaryotic cell is a busy microcosm filled with organelles,and the proper functioning of a protein is contingent upon its arrival at the correct location.As such,transportation of proteins takes place constantly... Every eukaryotic cell is a busy microcosm filled with organelles,and the proper functioning of a protein is contingent upon its arrival at the correct location.As such,transportation of proteins takes place constantly within and between cells,some of which is constitutive and some regulated.For example,fibroblasts secrete collagens constitutively,which involves transportation of newly synthesized collagen proteins from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus,and finally across the plasma membrane via secretory vesicles[1].In contrast,only under stressful conditions does the transcription factor forkhead box O(FOXO)translocate from the cytoplasm to the nucleus to launch a transcriptional response consisting of hundreds of genes[2–4]. 展开更多
关键词 CONSTITUTIVE hundreds FILLED
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