奥密克戎变异株XBB.1.16于2023年1月9日在印度首次被发现,其病毒表面刺突(Spike,S)蛋白的E180V、T478R、F486P突变增加了病毒的传播力、致病性和免疫逃逸能力,使得在美国、印度等国家的新冠病例数激增。2023年4月17日,世界卫生组织指定X...奥密克戎变异株XBB.1.16于2023年1月9日在印度首次被发现,其病毒表面刺突(Spike,S)蛋白的E180V、T478R、F486P突变增加了病毒的传播力、致病性和免疫逃逸能力,使得在美国、印度等国家的新冠病例数激增。2023年4月17日,世界卫生组织指定XBB.1.16为感兴趣的变异株(variant of interest,VOI),但未观察到疾病严重程度的增加或额外的公共健康风险,其全球评估风险较低。本文通过文献阅读和数据库检索分析,对XBB.1.16流行情况和病原学特征进行总结,为新冠病毒防控策略的制定及疫苗、药物的研究提供科学参考。展开更多
目的了解苏州市2019新型冠状病毒感染病例的病毒分子变异及宿主适应性情况。方法采集苏州市9例本土2019新型冠状病毒感染病例和6例境外输入2019新型冠状病毒感染病例的咽拭子样本,提取病毒核酸进行病毒全基因组测序。以武汉株Wuhan-Hu-...目的了解苏州市2019新型冠状病毒感染病例的病毒分子变异及宿主适应性情况。方法采集苏州市9例本土2019新型冠状病毒感染病例和6例境外输入2019新型冠状病毒感染病例的咽拭子样本,提取病毒核酸进行病毒全基因组测序。以武汉株Wuhan-Hu-1为参考序列进行比对分析。采用MEGA 7.0软件构建病毒全基因组序列系统进化树。结果15条2019新型冠状病毒基因组序列分别按照中国分型法、Nextstrain分型法、Pangolin分型法和全球共享流感数据倡议组织(Global Initiative on Sharing All Influenza Data,GISAID)分型法可分为7个型、6个型、8个型和5个亚型/谱系。与Wuhan-Hu-1参考株相比,基于核苷酸翻译的氨基酸序列突变位点中位数为3个,范围为0~12个。6条境外输入病毒株刺突蛋白均检出可导致传播力增强的D614G突变。输入病例的基因序列中未发现可导致病毒传播力明显增强的阿尔法变异株、贝塔变异株和伽马变异株。15条序列核苷酸突变位点中位数为8个,范围为3~23个。结论2019新型冠状病毒在不断变异,已衍生出多种进化谱系/基因型。苏州市境外输入病毒株均携带可致传染性增强的突变。展开更多
文摘奥密克戎变异株XBB.1.16于2023年1月9日在印度首次被发现,其病毒表面刺突(Spike,S)蛋白的E180V、T478R、F486P突变增加了病毒的传播力、致病性和免疫逃逸能力,使得在美国、印度等国家的新冠病例数激增。2023年4月17日,世界卫生组织指定XBB.1.16为感兴趣的变异株(variant of interest,VOI),但未观察到疾病严重程度的增加或额外的公共健康风险,其全球评估风险较低。本文通过文献阅读和数据库检索分析,对XBB.1.16流行情况和病原学特征进行总结,为新冠病毒防控策略的制定及疫苗、药物的研究提供科学参考。
文摘目的了解苏州市2019新型冠状病毒感染病例的病毒分子变异及宿主适应性情况。方法采集苏州市9例本土2019新型冠状病毒感染病例和6例境外输入2019新型冠状病毒感染病例的咽拭子样本,提取病毒核酸进行病毒全基因组测序。以武汉株Wuhan-Hu-1为参考序列进行比对分析。采用MEGA 7.0软件构建病毒全基因组序列系统进化树。结果15条2019新型冠状病毒基因组序列分别按照中国分型法、Nextstrain分型法、Pangolin分型法和全球共享流感数据倡议组织(Global Initiative on Sharing All Influenza Data,GISAID)分型法可分为7个型、6个型、8个型和5个亚型/谱系。与Wuhan-Hu-1参考株相比,基于核苷酸翻译的氨基酸序列突变位点中位数为3个,范围为0~12个。6条境外输入病毒株刺突蛋白均检出可导致传播力增强的D614G突变。输入病例的基因序列中未发现可导致病毒传播力明显增强的阿尔法变异株、贝塔变异株和伽马变异株。15条序列核苷酸突变位点中位数为8个,范围为3~23个。结论2019新型冠状病毒在不断变异,已衍生出多种进化谱系/基因型。苏州市境外输入病毒株均携带可致传染性增强的突变。