全基因组鉴定和分析水稻AP2基因家族

AP2亚组类转录因子是植物特有的一类转录因子,属于AP2/ERF基因家族,在植物生长发育、细胞分化以及响应生物和非生物胁迫过程中起着重要的作用。本研究通过生物信息学的方式共鉴定到16个水稻AP2基因,并对这些基因的理化性质、基因结构、进化途径、顺式调控元件、表达谱等方面进行分析。结果显示这些基因不均匀地分布在8条染色体上,根据同源性差异又可以分成3个亚组。每个亚组成员在基因结构以及保守基序的位置和数目上具有相似性,而且大部分OsAP2基因受到一个或者多个miRNA基因的调控。另一方面,这些基因在不同组织的表达水平有很大的差异,其中茎和花药中表达量相对较高,且部分OsAP2基因的表达量受到激素的诱导。这些结果为下一步研究水稻AP2基因的生物学功能打下坚实的基础。