百日咳重现下MRBp感染的治疗、防控及面临的挑战

百日咳(whooping cough)是由百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis,Bp)感染,通过空气传播的急性呼吸道传染病。大环内酯类抗生素(Macrolides antibiotics)一直是治疗百日咳的首选药物。但自从国内首次报道耐大环内酯类百日咳鲍特菌(Macrolide-resistant Bordetella pertussis,MRBp)后,近年来我国出现了MRBp的广泛流行。尤其近期全球百日咳重现,深入了解MRBp流性特征、诊疗、防控进展及面临的挑战尤为重要。

老年患者泌尿道感染病原菌分布及耐药性分析

目的调查西安地区泌尿道感染老年患者的病原菌分布及耐药特点。方法回顾性分析2012年11月至2017年3月在西安市某三甲医院就诊的2475例65岁及以上泌尿道感染患者的尿标本病原菌信息及其药敏试验数据。结果从1465例女性标本和1010例男性标本中共分离出2475株非重复病原菌,其中革兰阴性杆菌1594株(64.40%),以大肠埃希菌为主,为1230株(49.70%);革兰阳性球菌452株(18.26%),以屎肠球菌为主,为294株(11.88%)。大肠埃希菌是导致老年女性泌尿道感染的主要病原菌,其感染率(61.98%)明显高于男性(31.88%),差异有统计学意义(χ^2=216.643,P<0.001)。病原菌对抗菌药物的耐药率:氨苄西林为82.76%,环丙沙星为69.68%,左氧氟沙星为65.52%,呋喃妥因为20.33%。女性分离株对氨苄西林的耐药率(84.08%)高于男性(80.45%),差异有统计学意义(χ^2=4.210,P=0.040);男性分离株对呋喃妥因的耐药率(28.07%)明显高于女性(15.92%),差异有统计学意义(χ^2=41.550,P<0.001)。女性产超广谱β-内酰胺酶的大肠埃希菌的耐药率(52.75%)低于男性(79.19%),差异有统计学意义(χ^2=69.051,P<0.001);女性耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌的耐药率(0.22%)低于男性(0.62%),但差异无统计学意义(χ^2=1.178,P=0.278)。结论该地区老年泌尿道感染患者以女性为主,病原菌除大肠埃希菌外,应重视对抗菌药物耐药程度较高的屎肠球菌。老年男性泌尿道感染患者,应避免过量使用氨苄西林、环丙沙星和左氧氟沙星进行经验性治疗。

测序平台在母婴肠道菌群结构分析中产生的可能偏倚

目的将两个不同的二代测序平台及其生物信息学流程进行的相同标本的微生物群分析结果的异同进行比较。方法在同一实验室采用相同的生物信息学分析方案,使用两个不同的测序平台(Ion Torrent S5-xl和Illumina HiSeq 2500)对56个(28对)母婴粪便样本进行16SrRNA扩增子测序,采用相关性分析、主成分分析(PCA)、主坐标分析(PCoA)以及MRPP分析比较两个平台产生的微生物群落结构的异同。结果Alpha多样性除Shannon指数外,Chao1指数(t=1.96,P=0.0011)、Observed species指数(t=2.13,P<0.0010)、PD_whole tree指数(t=2.07,P<0.0010)、Simpson指数(t=1.87,P=0.0031)和Good coverage指数(t=2.32,P<0.0010)差异存在统计学意义。对不同分类水平下的菌群相对丰度进行分析,测序和注释的细菌种类越多,两个平台间建立的细菌相对丰度的相关性越低。PCA结果显示,超过87%的样本被聚类。通过PCoA结果将两个平台的56个样本分为两个集群(cluster),两个平台之间的重叠率为71.43%。MRPP差异分别显示了两个测序平台的菌群数据在科水平、属水平上差异存在统计学意义(A=0.0941,P=0.0010;A=0.0852,P=0.0021)。当考虑样本来源时,在科水平上,母亲组的菌群组成没有明显的测序平台差异(A=0.0063,P=0.1491),新生儿组差异则有统计学意义(A=0.0352,P=0.0061);在属水平,母、婴组的菌群组成有显著的测序平台差异(A=0.0216,P=0.0042;A=0.0981,P=0.0010)。结论相同样本在不同平台进行扩增子测序,其菌群结构相对丰度基本相似,但其多样性和相关性仍然有很大差异。为了队列研究数据的可重复性和可靠性,建议使用相同的测序平台和分析流程以减少菌群分析中的偏倚。

贲门失弛缓症免疫机制的研究进展

贲门失弛缓症的病因尚未明确, 目前认为遗传、病毒感染、自身免疫、肌神经病变与该病的发生、发展有关。然而, 越来越多的证据表明, 贲门失弛缓症是一种免疫介导的炎症性疾病, 免疫机制在其发病过程中具有至关重要的作用。本文对近年来贲门失弛缓症免疫机制的研究进展进行总结, 从病毒感染、免疫遗传、炎症细胞、细胞因子等方面进行综述, 以期提高临床对该病的认识。